146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2408 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2408  carbohydrate esterase family 1 protein  100 
 
 		 316 aa  665    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.211104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1400  phospholipase/Carboxylesterase  31.65 
 
 		 325 aa  157  2e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3966  phospholipase/carboxylesterase  32.01 
 
 		 795 aa  154  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1493  phospholipase/Carboxylesterase  30.41 
 
 		 317 aa  142  7e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.030471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0579  esterase, putative  28.99 
 
 		 324 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1204  phospholipase/carboxylesterase  29.15 
 
 		 335 aa  135  9e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.299935  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1969  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  29.25 
 
 		 363 aa  133  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0935555 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13327  esterase lipoprotein lpqC  32.36 
 
 		 304 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000167103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1573  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  30.07 
 
 		 326 aa  115  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1240  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  28.57 
 
 		 370 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.194401 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1590  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  29.93 
 
 		 353 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255211  normal  0.12664 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0967  putative esterase  29.05 
 
 		 244 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.127871 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1385  putative Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  29.43 
 
 		 464 aa  112  6e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.516849  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0373  polyhydroxybutyrate depolymerase  30 
 
 		 357 aa  112  9e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0880654  hitchhiker  0.00622899 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5085  polyhydroxybutyrate depolymerase  29.14 
 
 		 313 aa  111  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  normal  0.355318 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1651  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  28.82 
 
 		 323 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0627752  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00180  conserved hypothetical protein  32.06 
 
 		 340 aa  110  3e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3106  putative lipoprotein  30.31 
 
 		 341 aa  110  3e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10685  lipoprotein lpqP  29.22 
 
 		 280 aa  110  3e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.132448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1167  hypothetical protein  28.57 
 
 		 471 aa  110  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.428408  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3487  hypothetical protein  25.55 
 
 		 332 aa  108  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4460  polyhydroxybutyrate depolymerase  28.88 
 
 		 322 aa  107  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.403398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0726  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  27.63 
 
 		 462 aa  107  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401494  normal  0.100919 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2261  putative esterase/lipase/thioesterase  26.62 
 
 		 361 aa  105  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556081  normal  0.0820217 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07050  hypothetical protein  25.09 
 
 		 322 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3217  hypothetical protein  29.72 
 
 		 282 aa  99.8  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  25.87 
 
 		 1002 aa  99.4  8e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0646  hypothetical protein  26.64 
 
 		 322 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399454  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3127  phospholipase/Carboxylesterase  25.08 
 
 		 314 aa  95.9  9e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.539584 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2301  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  30.73 
 
 		 232 aa  94.4  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2752  phospholipase/carboxylesterase  24.6 
 
 		 309 aa  93.2  5e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3854  putative lipoprotein  26.16 
 
 		 336 aa  92.8  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.496382  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0297  lpqC, putative  26.55 
 
 		 306 aa  92.8  6e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.433259  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3566  phospholipase/carboxylesterase  22.07 
 
 		 331 aa  92.8  6e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5398  hypothetical protein  27.45 
 
 		 302 aa  89.4  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.330044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0080  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  24.41 
 
 		 286 aa  89  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3576  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  24.45 
 
 		 451 aa  88.2  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.875939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1953  putative hydrolase  26.88 
 
 		 308 aa  88.2  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0001445  hitchhiker  0.00199711 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3891  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  25.57 
 
 		 298 aa  87.4  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.947481  normal  0.780646 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0072  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  32.67 
 
 		 392 aa  86.7  5e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7236  putative LpqP (hydrolase/esterase)  34.18 
 
 		 405 aa  86.3  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0397136  normal  0.31443 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4595  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  25.72 
 
 		 344 aa  78.2  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1290  hypothetical protein  32.21 
 
 		 305 aa  75.1  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1105  phospholipase/carboxylesterase  30.91 
 
 		 253 aa  73.9  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.320599  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  25 
 
 		 461 aa  73.6  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3488  hypothetical protein  20.81 
 
 		 447 aa  72.8  0.000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2906  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  26.06 
 
 		 659 aa  67.8  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.686004  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3303  glycoside hydrolase family 62  23.13 
 
 		 436 aa  67  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000382833  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3485  hypothetical protein  25 
 
 		 269 aa  65.9  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2056  esterase, PHB depolymerase family  23.67 
 
 		 334 aa  64.3  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1020  hypothetical protein  27.96 
 
 		 260 aa  63.5  0.000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2257  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  24.38 
 
 		 270 aa  63.2  0.000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2846  esterase, PHB depolymerase  22.54 
 
 		 398 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.222858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6802  esterase, PHB depolymerase family  23 
 
 		 398 aa  62  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0419644  decreased coverage  0.000000125026 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5020  phospholipase/Carboxylesterase  28.42 
 
 		 563 aa  60.8  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.780509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0713  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  27.78 
 
 		 287 aa  60.1  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4407  PHB depolymerase family esterase  23.32 
 
 		 398 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.32684  normal  0.707171 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2059  phospholipase/carboxylesterase  23.57 
 
 		 343 aa  57.4  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.550035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92192  predicted protein  27.92 
 
 		 486 aa  55.8  0.0000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.865019  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6990  phospholipase/Carboxylesterase  25.29 
 
 		 276 aa  55.5  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030979 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4883  PHB depolymerase family esterase  28.38 
 
 		 369 aa  55.8  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103512  hitchhiker  0.0011428 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05267  feruloyl esterase (Eurofung)  24.47 
 
 		 270 aa  54.7  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3270  esterase, PHB depolymerase  22.63 
 
 		 372 aa  55.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.67973 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0242  cellulose-binding family II  22.55 
 
 		 447 aa  54.7  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4230  phospholipase/Carboxylesterase  25.29 
 
 		 268 aa  54.7  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.58568  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4502  esterase, PHB depolymerase  23.36 
 
 		 365 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.42248  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3862  PHB depolymerase family esterase  23.36 
 
 		 365 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0810078  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3399  phospholipase/Carboxylesterase  30.77 
 
 		 886 aa  53.9  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0843548  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3665  PHB depolymerase family esterase  23.36 
 
 		 365 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.131134  normal  0.75521 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0364  putative polyhydroxybutyrate depolymerase  27.34 
 
 		 265 aa  53.9  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.81916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0696  phospholipase/Carboxylesterase  24.1 
 
 		 218 aa  53.9  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2770  PHB depolymerase family esterase  22.88 
 
 		 544 aa  53.9  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0711  esterase, PHB depolymerase  28.47 
 
 		 392 aa  53.5  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.612274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26429  predicted protein  25.93 
 
 		 363 aa  52.8  0.000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000229905  normal  0.222049 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33500  esterase, poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  22.51 
 
 		 429 aa  52.8  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3660  PHB depolymerase family esterase  29.01 
 
 		 381 aa  52.8  0.000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.741995  normal  0.231581 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2287  phospholipase/Carboxylesterase  31.15 
 
 		 263 aa  52.8  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.191504  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1990  esterase, PHB depolymerase family  25.6 
 
 		 406 aa  52.4  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000642829  normal  0.085302 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2234  esterase, PHB depolymerase  28.66 
 
 		 369 aa  52  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.111052  normal  0.321017 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1052  phospholipase/carboxylesterase  25.71 
 
 		 365 aa  52  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0595  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  22.92 
 
 		 364 aa  51.2  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0535  esterase, PHB depolymerase family  24.43 
 
 		 338 aa  50.8  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.660761  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0490  hypothetical protein  26.38 
 
 		 357 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.637254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3823  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  21.31 
 
 		 374 aa  50.8  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5166  putative esterase  25.1 
 
 		 295 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.140239 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5113  esterase, PHB depolymerase  23.65 
 
 		 370 aa  50.1  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.841359  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0137  esterase, PHB depolymerase  24.02 
 
 		 392 aa  49.7  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1480  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  22.54 
 
 		 382 aa  50.1  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.289263  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1676  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  22.54 
 
 		 382 aa  50.1  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.254076  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2562  depolymerase  22.54 
 
 		 382 aa  50.1  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2425  PHB depolymerase family esterase  22.54 
 
 		 382 aa  50.1  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0301  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  22.54 
 
 		 367 aa  49.7  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0865  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  22.54 
 
 		 367 aa  49.7  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.208532  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1211  esterase, PHB depolymerase family  27.01 
 
 		 312 aa  49.3  0.00008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0349548 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0332  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  22.54 
 
 		 364 aa  49.3  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.203676  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2576  esterase, PHB depolymerase  27.61 
 
 		 396 aa  48.5  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.225739  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1945  esterase, PHB depolymerase family  23.59 
 
 		 344 aa  48.5  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.198099  normal  0.0353299 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2268  esterase, PHB depolymerase family  23.59 
 
 		 344 aa  49.3  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.493113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0409  phospholipase/Carboxylesterase  23.97 
 
 		 277 aa  48.5  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00373212  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4839  phospholipase/Carboxylesterase  30.08 
 
 		 232 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>