108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4460 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4460  polyhydroxybutyrate depolymerase  100 
 
 		 322 aa  645    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.403398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5085  polyhydroxybutyrate depolymerase  58.06 
 
 		 313 aa  365  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  normal  0.355318 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1590  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  53.79 
 
 		 353 aa  289  4e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255211  normal  0.12664 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10685  lipoprotein lpqP  48.08 
 
 		 280 aa  275  8e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.132448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3854  putative lipoprotein  36.86 
 
 		 336 aa  140  3e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.496382  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1493  phospholipase/Carboxylesterase  33.7 
 
 		 317 aa  124  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.030471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0373  polyhydroxybutyrate depolymerase  36.67 
 
 		 357 aa  122  8e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0880654  hitchhiker  0.00622899 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1573  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  32.34 
 
 		 326 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1651  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  31.53 
 
 		 323 aa  113  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0627752  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2408  carbohydrate esterase family 1 protein  28.88 
 
 		 316 aa  112  7.000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.211104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1953  putative hydrolase  29.96 
 
 		 308 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0001445  hitchhiker  0.00199711 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13327  esterase lipoprotein lpqC  34.88 
 
 		 304 aa  108  1e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000167103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3487  hypothetical protein  28.43 
 
 		 332 aa  103  5e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0646  hypothetical protein  33.68 
 
 		 322 aa  102  6e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399454  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1969  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  30.47 
 
 		 363 aa  101  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0935555 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07050  hypothetical protein  34 
 
 		 322 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3127  phospholipase/Carboxylesterase  32.53 
 
 		 314 aa  99.4  7e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.539584 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1204  phospholipase/carboxylesterase  31.51 
 
 		 335 aa  97.1  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.299935  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7236  putative LpqP (hydrolase/esterase)  31.82 
 
 		 405 aa  96.3  7e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0397136  normal  0.31443 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1400  phospholipase/Carboxylesterase  27.68 
 
 		 325 aa  95.9  8e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3106  putative lipoprotein  34.23 
 
 		 341 aa  95.9  8e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0297  lpqC, putative  31.54 
 
 		 306 aa  94.4  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.433259  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  28.31 
 
 		 1002 aa  94.7  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1240  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  31.65 
 
 		 370 aa  92.4  8e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.194401 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3576  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  29.89 
 
 		 451 aa  91.7  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.875939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0579  esterase, putative  27.59 
 
 		 324 aa  91.3  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3217  hypothetical protein  31.54 
 
 		 282 aa  90.1  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0967  putative esterase  34.94 
 
 		 244 aa  90.5  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.127871 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1167  hypothetical protein  28.98 
 
 		 471 aa  88.6  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.428408  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1290  hypothetical protein  37.42 
 
 		 305 aa  87.4  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0072  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  29.74 
 
 		 392 aa  87  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3966  phospholipase/carboxylesterase  26.67 
 
 		 795 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0726  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  28.62 
 
 		 462 aa  83.2  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401494  normal  0.100919 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4595  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  31.84 
 
 		 344 aa  81.6  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3566  phospholipase/carboxylesterase  26.62 
 
 		 331 aa  78.6  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2301  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  35.94 
 
 		 232 aa  78.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2261  putative esterase/lipase/thioesterase  31.85 
 
 		 361 aa  73.9  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556081  normal  0.0820217 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2752  phospholipase/carboxylesterase  27.56 
 
 		 309 aa  73.2  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00180  conserved hypothetical protein  29 
 
 		 340 aa  72  0.00000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0080  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  25.97 
 
 		 286 aa  72  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  27.74 
 
 		 461 aa  70.1  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1990  esterase, PHB depolymerase family  31.69 
 
 		 406 aa  68.6  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000642829  normal  0.085302 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0713  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  29.35 
 
 		 287 aa  68.6  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0242  cellulose-binding family II  27.78 
 
 		 447 aa  66.2  0.0000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3891  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  28.89 
 
 		 298 aa  65.9  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.947481  normal  0.780646 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0364  putative polyhydroxybutyrate depolymerase  28.05 
 
 		 265 aa  65.9  0.0000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.81916  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33500  esterase, poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  28.4 
 
 		 429 aa  64.3  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92192  predicted protein  23.92 
 
 		 486 aa  63.9  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.865019  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3488  hypothetical protein  28.9 
 
 		 447 aa  63.2  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3303  glycoside hydrolase family 62  28.75 
 
 		 436 aa  63.2  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000382833  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4027  PHB depolymerase family esterase  28.77 
 
 		 387 aa  62  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.391886 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26429  predicted protein  34.11 
 
 		 363 aa  62  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000229905  normal  0.222049 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1285  esterase, PHB depolymerase family  27.5 
 
 		 367 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.29485  normal  0.060549 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2056  esterase, PHB depolymerase family  25.55 
 
 		 334 aa  60.5  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3270  esterase, PHB depolymerase  27.27 
 
 		 372 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.67973 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1385  putative Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  22.92 
 
 		 464 aa  58.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.516849  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3990  Poly (3-hydroxybutyrate ) depolymerase  29.06 
 
 		 396 aa  58.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0179  PHB depolymerase family esterase  27.3 
 
 		 656 aa  57  0.0000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.18087  normal  0.428012 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1211  esterase, PHB depolymerase family  27.7 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0349548 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5398  hypothetical protein  25.61 
 
 		 302 aa  55.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.330044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3485  hypothetical protein  30.71 
 
 		 269 aa  55.5  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0493  esterase, PHB depolymerase family  29.81 
 
 		 378 aa  55.5  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3857  PHB depolymerase family esterase  29.62 
 
 		 414 aa  54.7  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0048  esterase, PHB depolymerase family  34.51 
 
 		 417 aa  55.1  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616843 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2770  PHB depolymerase family esterase  25.4 
 
 		 544 aa  54.7  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4407  PHB depolymerase family esterase  26.83 
 
 		 398 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.32684  normal  0.707171 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2268  esterase, PHB depolymerase family  32.39 
 
 		 344 aa  53.5  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.493113  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05267  feruloyl esterase (Eurofung)  34.4 
 
 		 270 aa  53.5  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4018  hypothetical protein  29.24 
 
 		 355 aa  53.5  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1945  esterase, PHB depolymerase family  32.39 
 
 		 344 aa  53.5  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.198099  normal  0.0353299 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0082  esterase, PHB depolymerase  33.96 
 
 		 414 aa  52.8  0.000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2059  phospholipase/carboxylesterase  27.89 
 
 		 343 aa  51.6  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.550035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3819  PHB depolymerase family esterase  27.4 
 
 		 419 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2149  hypothetical protein  32.12 
 
 		 343 aa  50.8  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000536767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1940  PHB depolymerase family esterase  28.42 
 
 		 433 aa  50.8  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1984  esterase, PHB depolymerase family  26.02 
 
 		 337 aa  50.8  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000502853  normal  0.034342 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2179  esterase, PHB depolymerase family  33.85 
 
 		 419 aa  50.8  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2991  PHB depolymerase family esterase  25.66 
 
 		 419 aa  50.4  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0711  esterase, PHB depolymerase  33.07 
 
 		 392 aa  49.7  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.612274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6025  PHB depolymerase family esterase  29.1 
 
 		 416 aa  49.7  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.950963  normal  0.103792 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9052  polyhydroxybutyrate depolymerase  30.33 
 
 		 366 aa  49.7  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6802  esterase, PHB depolymerase family  25.17 
 
 		 398 aa  49.3  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0419644  decreased coverage  0.000000125026 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2846  esterase, PHB depolymerase  26.6 
 
 		 398 aa  48.9  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.222858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5409  phospholipase/Carboxylesterase  30.95 
 
 		 468 aa  48.5  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.301225 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4602  esterase, PHB depolymerase  31.43 
 
 		 317 aa  48.1  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.462256  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4102  hypothetical protein  28.4 
 
 		 385 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.943667 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4362  PHB depolymerase family esterase  28.45 
 
 		 576 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3290  esterase, PHB depolymerase family  30.65 
 
 		 450 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1173  esterase, PHB depolymerase family  28.62 
 
 		 410 aa  47.8  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2906  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  24.84 
 
 		 659 aa  47.8  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.686004  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2650  hypothetical protein  28.05 
 
 		 355 aa  47.8  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.376354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7674  putative polyhydroxy-alkanoate/butyrate(PHA/PHB) depolymerase  33.94 
 
 		 529 aa  47.8  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0209  esterase, PHB depolymerase family  28.63 
 
 		 342 aa  47.8  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2576  esterase, PHB depolymerase  27.22 
 
 		 396 aa  47  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.225739  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4127  esterase, PHB depolymerase family  26.71 
 
 		 419 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0535  esterase, PHB depolymerase family  29.21 
 
 		 338 aa  45.8  0.0009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.660761  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3344  PHB depolymerase family esterase  28.74 
 
 		 429 aa  45.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.335799  normal  0.68562 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4301  PHB depolymerase family esterase  33.89 
 
 		 368 aa  45.8  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4281  PHB depolymerase family esterase  32.67 
 
 		 403 aa  45.4  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0631571 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2257  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  25.95 
 
 		 270 aa  45.4  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>