58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4839 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_4839  phospholipase/Carboxylesterase  100 
 
 
232 aa  457  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4055  phospholipase/carboxylesterase  87.56 
 
 
242 aa  348  3e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.342724  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1148  phospholipase/Carboxylesterase  78.67 
 
 
239 aa  347  9e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5584  phospholipase/carboxylesterase  77.19 
 
 
231 aa  343  1e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1368  phospholipase/Carboxylesterase  79.11 
 
 
239 aa  327  8e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1208  phospholipase/carboxylesterase  79.11 
 
 
239 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.12535 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0060  phospholipase/carboxylesterase  72 
 
 
226 aa  300  1e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.885579  normal  0.31865 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4173  phospholipase/carboxylesterase  54.22 
 
 
225 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741665  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6756  phospholipase/carboxylesterase  54.91 
 
 
225 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.847027  normal  0.369639 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0063  phospholipase/carboxylesterase  47.09 
 
 
227 aa  160  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.982882  normal  0.670301 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4614  phospholipase/Carboxylesterase  41.26 
 
 
238 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.376672 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2287  phospholipase/Carboxylesterase  43.28 
 
 
263 aa  146  3e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.191504  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3855  phospholipase/Carboxylesterase  44.33 
 
 
226 aa  142  5e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1773  phospholipase/Carboxylesterase  44.02 
 
 
239 aa  142  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1052  phospholipase/carboxylesterase  34.18 
 
 
365 aa  84  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0548  phospholipase/Carboxylesterase  34.85 
 
 
358 aa  79.3  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.185297  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0335  phospholipase/carboxylesterase  34.08 
 
 
357 aa  79  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.64094  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1106  hypothetical protein  30.57 
 
 
355 aa  75.1  0.0000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.117901 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0490  hypothetical protein  29.47 
 
 
357 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.637254  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3106  putative lipoprotein  31.52 
 
 
341 aa  63.9  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2257  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  25.22 
 
 
270 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0297  lpqC, putative  30.54 
 
 
306 aa  53.9  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.433259  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5020  phospholipase/Carboxylesterase  24.26 
 
 
563 aa  52  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.780509  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3487  hypothetical protein  28.83 
 
 
332 aa  52  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3866  hypothetical protein  31.16 
 
 
302 aa  50.4  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.178954  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3966  phospholipase/carboxylesterase  25.41 
 
 
795 aa  50.8  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1983  phospholipase/Carboxylesterase  27.64 
 
 
217 aa  49.7  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0573653  normal  0.134179 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00180  conserved hypothetical protein  29.94 
 
 
340 aa  48.9  0.00006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2261  putative esterase/lipase/thioesterase  30.07 
 
 
361 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556081  normal  0.0820217 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2408  carbohydrate esterase family 1 protein  30.08 
 
 
316 aa  47.8  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.211104  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03001  esterase  24.72 
 
 
205 aa  47.8  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.66751  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5085  polyhydroxybutyrate depolymerase  26.67 
 
 
313 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  normal  0.355318 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4488  phospholipase/Carboxylesterase  23.71 
 
 
204 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.332778 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4424  phospholipase/Carboxylesterase  23.71 
 
 
204 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5113  esterase, PHB depolymerase  31.15 
 
 
370 aa  47  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.841359  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3399  phospholipase/Carboxylesterase  26.21 
 
 
886 aa  46.2  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0843548  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2860  carboxylesterase Est2  38.05 
 
 
321 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.79214  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1208  phospholipase/Carboxylesterase  24.28 
 
 
223 aa  45.8  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0080  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  29.81 
 
 
286 aa  45.8  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05267  feruloyl esterase (Eurofung)  22.14 
 
 
270 aa  45.8  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0355  phospholipase/Carboxylesterase  25.53 
 
 
207 aa  45.4  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0220103  normal  0.29368 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2297  phospholipase/carboxylesterase  30.82 
 
 
238 aa  44.7  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.563406  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2932  hypothetical protein  30.71 
 
 
399 aa  44.7  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1536  putative polyhydroxybutyrate depolymerase  26.45 
 
 
276 aa  44.7  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.26582  normal  0.221996 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2954  phospholipase/carboxylesterase  26.37 
 
 
223 aa  44.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.231462  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1240  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  29.17 
 
 
370 aa  45.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.194401 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5170  phospholipase/Carboxylesterase  28.12 
 
 
255 aa  44.7  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.649523 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3420  phospholipase/Carboxylesterase  23.9 
 
 
205 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0054  carboxylesterase  25.75 
 
 
248 aa  44.3  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.691003  normal  0.104617 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1400  phospholipase/Carboxylesterase  24.19 
 
 
325 aa  42.7  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1462  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.07 
 
 
680 aa  42.7  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5017  phospholipase/Carboxylesterase  24.46 
 
 
205 aa  42.4  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122217  normal  0.0411034 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2641  phospholipase/carboxylesterase  25.6 
 
 
205 aa  42.4  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.419247  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4377  phospholipase/carboxylesterase  28.89 
 
 
233 aa  42  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.234043 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3040  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.36 
 
 
678 aa  42  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.157189 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2306  phospholipase/carboxylesterase  31.54 
 
 
235 aa  42  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.412885  hitchhiker  0.00320087 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1716  phospholipase/Carboxylesterase  26.92 
 
 
217 aa  42  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2498  phospholipase/carboxylesterase  22.97 
 
 
220 aa  41.6  0.01  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>