67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4173 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B4173  phospholipase/carboxylesterase  100 
 
 
225 aa  450  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741665  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6756  phospholipase/carboxylesterase  72.32 
 
 
225 aa  327  9e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.847027  normal  0.369639 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4839  phospholipase/Carboxylesterase  54.22 
 
 
232 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1148  phospholipase/Carboxylesterase  55.16 
 
 
239 aa  249  3e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5584  phospholipase/carboxylesterase  52 
 
 
231 aa  241  5e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1208  phospholipase/carboxylesterase  56.5 
 
 
239 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.12535 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1368  phospholipase/Carboxylesterase  56.05 
 
 
239 aa  237  1e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0060  phospholipase/carboxylesterase  57.33 
 
 
226 aa  231  6e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.885579  normal  0.31865 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4055  phospholipase/carboxylesterase  54.67 
 
 
242 aa  217  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.342724  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1773  phospholipase/Carboxylesterase  44.84 
 
 
239 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4614  phospholipase/Carboxylesterase  45.63 
 
 
238 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.376672 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0063  phospholipase/carboxylesterase  42.16 
 
 
227 aa  150  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.982882  normal  0.670301 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2287  phospholipase/Carboxylesterase  43.28 
 
 
263 aa  149  3e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.191504  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3855  phospholipase/Carboxylesterase  44.09 
 
 
226 aa  143  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1106  hypothetical protein  27.18 
 
 
355 aa  58.2  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.117901 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1052  phospholipase/carboxylesterase  26.86 
 
 
365 aa  58.2  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3966  phospholipase/carboxylesterase  24 
 
 
795 aa  57  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5170  phospholipase/Carboxylesterase  29.05 
 
 
255 aa  55.1  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.649523 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1113  phospholipase/carboxylesterase  34.57 
 
 
224 aa  55.1  0.0000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.668569  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2724  phospholipase/carboxylesterase  30.95 
 
 
237 aa  54.3  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.124054  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0548  phospholipase/Carboxylesterase  26.86 
 
 
358 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.185297  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0490  hypothetical protein  23.96 
 
 
357 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.637254  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0335  phospholipase/carboxylesterase  28.16 
 
 
357 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.64094  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4424  phospholipase/Carboxylesterase  25.93 
 
 
204 aa  52  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4488  phospholipase/Carboxylesterase  25.93 
 
 
204 aa  52  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.332778 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2641  phospholipase/carboxylesterase  28.23 
 
 
205 aa  52  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.419247  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2918  phospholipase/carboxylesterase  25.98 
 
 
218 aa  51.2  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3420  phospholipase/Carboxylesterase  25.13 
 
 
205 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5020  phospholipase/Carboxylesterase  26.46 
 
 
563 aa  50.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.780509  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3842  phospholipase/carboxylesterase  33.66 
 
 
236 aa  49.7  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0054  carboxylesterase  27.4 
 
 
248 aa  48.9  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.691003  normal  0.104617 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1272  Carboxylesterase  28.21 
 
 
220 aa  47.8  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2498  phospholipase/carboxylesterase  23.64 
 
 
220 aa  48.1  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0941  phospholipase/carboxylesterase  27.62 
 
 
552 aa  47.8  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.443784 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5249  phospholipase/carboxylesterase  23.35 
 
 
243 aa  47  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0855258  normal  0.417619 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5201  phospholipase/carboxylesterase  33.33 
 
 
277 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.879928  normal  0.366851 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3639  Carboxylesterase  25.49 
 
 
223 aa  47.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4181  phospholipase/carboxylesterase  24.49 
 
 
206 aa  45.8  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2066  phospholipase/carboxylesterase  25.84 
 
 
238 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.565731  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3106  putative lipoprotein  24.86 
 
 
341 aa  45.4  0.0008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2101  phospholipase/carboxylesterase  25.5 
 
 
223 aa  45.1  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3402  carboxylesterase  31.15 
 
 
220 aa  45.1  0.0009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2074  carboxylesterase  30.28 
 
 
236 aa  45.1  0.0009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.439919  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0108  phospholipase/carboxylesterase family protein  30.28 
 
 
222 aa  44.7  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000237023  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1573  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  23.68 
 
 
326 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4485  phospholipase/Carboxylesterase  26.88 
 
 
212 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0355  phospholipase/Carboxylesterase  25 
 
 
207 aa  43.9  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0220103  normal  0.29368 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1942  phospholipase/carboxylesterase  30.16 
 
 
228 aa  43.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0272  putative carboxylesterase  30.16 
 
 
228 aa  43.1  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0149548  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1167  carboxylesterase, putative  30.16 
 
 
228 aa  43.1  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00098882  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03001  esterase  26.11 
 
 
205 aa  43.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.66751  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1610  phospholipase/carboxylesterase  30.16 
 
 
228 aa  43.1  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.247692  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2107  carboxylesterase  30.16 
 
 
228 aa  43.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.213325  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1958  phospholipase/carboxylesterase  30.16 
 
 
228 aa  43.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0275939  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0092  phospholipase/Carboxylesterase  21.51 
 
 
248 aa  43.1  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.898581  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1326  phospholipase/carboxylesterase  33.33 
 
 
222 aa  43.1  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1208  phospholipase/Carboxylesterase  29.82 
 
 
223 aa  43.1  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3946  phospholipase/carboxylesterase  29.66 
 
 
219 aa  42.7  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1899  Carboxylesterase  29.13 
 
 
226 aa  42.4  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0365567  normal  0.41049 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1204  phospholipase/carboxylesterase  26.34 
 
 
335 aa  42.4  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.299935  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1674  carboxylesterase  28.03 
 
 
223 aa  42  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.843799  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1983  phospholipase/Carboxylesterase  26.84 
 
 
217 aa  42  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0573653  normal  0.134179 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5529  phospholipase/Carboxylesterase  28.57 
 
 
219 aa  42.4  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.748493 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1130  putative hydrolase ypfH  34.17 
 
 
219 aa  42  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3399  phospholipase/Carboxylesterase  27.22 
 
 
886 aa  42  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0843548  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1955  phospholipase/carboxylesterase  25.4 
 
 
222 aa  41.6  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1893  phospholipase/Carboxylesterase  26.56 
 
 
223 aa  41.6  0.01  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>