53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1148 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_1148  phospholipase/Carboxylesterase  100 
 
 
239 aa  476  1e-133  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1208  phospholipase/carboxylesterase  89.5 
 
 
239 aa  396  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.12535 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1368  phospholipase/Carboxylesterase  89.5 
 
 
239 aa  396  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4839  phospholipase/Carboxylesterase  78.67 
 
 
232 aa  347  1e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5584  phospholipase/carboxylesterase  71.56 
 
 
231 aa  317  7.999999999999999e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4055  phospholipase/carboxylesterase  79.37 
 
 
242 aa  309  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.342724  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0060  phospholipase/carboxylesterase  67.26 
 
 
226 aa  270  1e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.885579  normal  0.31865 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6756  phospholipase/carboxylesterase  58.93 
 
 
225 aa  260  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.847027  normal  0.369639 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4173  phospholipase/carboxylesterase  55.16 
 
 
225 aa  249  3e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741665  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4614  phospholipase/Carboxylesterase  44.29 
 
 
238 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.376672 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1773  phospholipase/Carboxylesterase  42.11 
 
 
239 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2287  phospholipase/Carboxylesterase  42.71 
 
 
263 aa  145  5e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.191504  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0063  phospholipase/carboxylesterase  40.09 
 
 
227 aa  142  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.982882  normal  0.670301 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3855  phospholipase/Carboxylesterase  43.68 
 
 
226 aa  132  3e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1052  phospholipase/carboxylesterase  33.33 
 
 
365 aa  89.4  5e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0548  phospholipase/Carboxylesterase  31.25 
 
 
358 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.185297  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0335  phospholipase/carboxylesterase  32.12 
 
 
357 aa  77  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.64094  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0490  hypothetical protein  29.47 
 
 
357 aa  76.3  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.637254  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1106  hypothetical protein  29.53 
 
 
355 aa  69.3  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.117901 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3106  putative lipoprotein  29.38 
 
 
341 aa  66.6  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2306  phospholipase/carboxylesterase  29.86 
 
 
235 aa  52.8  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.412885  hitchhiker  0.00320087 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1204  phospholipase/carboxylesterase  30.17 
 
 
335 aa  52.8  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.299935  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5020  phospholipase/Carboxylesterase  27.66 
 
 
563 aa  50.1  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.780509  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0297  lpqC, putative  28.49 
 
 
306 aa  49.3  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.433259  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2261  putative esterase/lipase/thioesterase  26.26 
 
 
361 aa  48.9  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556081  normal  0.0820217 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1272  Carboxylesterase  26.11 
 
 
220 aa  48.9  0.00007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1536  putative polyhydroxybutyrate depolymerase  25.12 
 
 
276 aa  48.5  0.00008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.26582  normal  0.221996 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05267  feruloyl esterase (Eurofung)  25.84 
 
 
270 aa  48.5  0.00009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3487  hypothetical protein  28.78 
 
 
332 aa  47.4  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3966  phospholipase/carboxylesterase  26.28 
 
 
795 aa  47  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3399  phospholipase/Carboxylesterase  25.37 
 
 
886 aa  46.6  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0843548  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5017  phospholipase/Carboxylesterase  25.88 
 
 
205 aa  45.4  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122217  normal  0.0411034 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1983  phospholipase/Carboxylesterase  26.98 
 
 
217 aa  44.7  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0573653  normal  0.134179 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2931  phospholipase/carboxylesterase  29.65 
 
 
222 aa  45.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3198  putative polyhydroxybutyrate depolymerase  27.52 
 
 
279 aa  44.7  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.396095  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0054  carboxylesterase  24.58 
 
 
248 aa  45.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.691003  normal  0.104617 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2412  phospholipase/carboxylesterase  30.17 
 
 
227 aa  44.7  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0536257  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3866  hypothetical protein  32.95 
 
 
302 aa  44.7  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.178954  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7236  putative LpqP (hydrolase/esterase)  28.1 
 
 
405 aa  45.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0397136  normal  0.31443 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1240  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  29.24 
 
 
370 aa  43.9  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.194401 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4488  phospholipase/Carboxylesterase  22.4 
 
 
204 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.332778 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4424  phospholipase/Carboxylesterase  22.4 
 
 
204 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3860  alpha/beta hydrolase fold  30.7 
 
 
287 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3787  alpha/beta hydrolase fold  30.7 
 
 
287 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265139  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3791  alpha/beta hydrolase fold  30.7 
 
 
287 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4748  alpha/beta hydrolase fold  30.09 
 
 
295 aa  43.1  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.259792  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3244  phospholipase/carboxylesterase  24.37 
 
 
245 aa  42.7  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1229  hypothetical protein  26.15 
 
 
275 aa  42.4  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116233 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2781  hypothetical protein  31.65 
 
 
796 aa  42.4  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.216427  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00180  conserved hypothetical protein  28.25 
 
 
340 aa  42.4  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1493  phospholipase/Carboxylesterase  23.44 
 
 
317 aa  42  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.030471  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2257  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  26.15 
 
 
270 aa  42  0.008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2297  phospholipase/carboxylesterase  28.28 
 
 
238 aa  42  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.563406  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>