83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3855 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_3855  phospholipase/Carboxylesterase  100 
 
 
226 aa  435  1e-121  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1773  phospholipase/Carboxylesterase  52.44 
 
 
239 aa  177  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0063  phospholipase/carboxylesterase  50.91 
 
 
227 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.982882  normal  0.670301 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2287  phospholipase/Carboxylesterase  51.24 
 
 
263 aa  165  5.9999999999999996e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.191504  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4173  phospholipase/carboxylesterase  42.66 
 
 
225 aa  155  7e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741665  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4614  phospholipase/Carboxylesterase  43.24 
 
 
238 aa  150  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.376672 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4839  phospholipase/Carboxylesterase  44.55 
 
 
232 aa  150  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6756  phospholipase/carboxylesterase  42.01 
 
 
225 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.847027  normal  0.369639 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1148  phospholipase/Carboxylesterase  43.44 
 
 
239 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5584  phospholipase/carboxylesterase  41.18 
 
 
231 aa  138  7e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1368  phospholipase/Carboxylesterase  43.16 
 
 
239 aa  135  4e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1208  phospholipase/carboxylesterase  43.75 
 
 
239 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.12535 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0060  phospholipase/carboxylesterase  42.5 
 
 
226 aa  126  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.885579  normal  0.31865 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4055  phospholipase/carboxylesterase  39.41 
 
 
242 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.342724  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0490  hypothetical protein  32.8 
 
 
357 aa  67.8  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.637254  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0335  phospholipase/carboxylesterase  31.22 
 
 
357 aa  65.1  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.64094  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0548  phospholipase/Carboxylesterase  32.21 
 
 
358 aa  62.8  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.185297  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1052  phospholipase/carboxylesterase  30.35 
 
 
365 aa  60.5  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2306  phospholipase/carboxylesterase  37.84 
 
 
235 aa  59.3  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.412885  hitchhiker  0.00320087 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1614  phospholipase/carboxylesterase  33.88 
 
 
221 aa  58.2  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2100  phospholipase/Carboxylesterase  33.88 
 
 
221 aa  58.2  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4488  phospholipase/Carboxylesterase  37.11 
 
 
204 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.332778 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1536  putative polyhydroxybutyrate depolymerase  30.84 
 
 
276 aa  56.6  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.26582  normal  0.221996 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4424  phospholipase/Carboxylesterase  37.11 
 
 
204 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3399  phospholipase/Carboxylesterase  32.87 
 
 
886 aa  55.8  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0843548  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3967  esterase YpfH  34.8 
 
 
212 aa  55.5  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.769125  normal  0.0547466 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2297  phospholipase/carboxylesterase  33.33 
 
 
238 aa  54.7  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.563406  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1106  hypothetical protein  29.7 
 
 
355 aa  53.9  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.117901 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2641  phospholipase/carboxylesterase  31.91 
 
 
205 aa  53.1  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.419247  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24861  esterase  34.01 
 
 
201 aa  52  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2074  carboxylesterase  27.61 
 
 
236 aa  50.1  0.00003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.439919  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0409  phospholipase/Carboxylesterase  29.29 
 
 
277 aa  50.1  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00373212  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0108  phospholipase/carboxylesterase family protein  27.61 
 
 
222 aa  49.7  0.00004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000237023  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2107  carboxylesterase  30 
 
 
228 aa  49.3  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.213325  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2495  phospholipase/carboxylesterase  29.91 
 
 
221 aa  48.9  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.402748  normal  0.915999 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0272  putative carboxylesterase  30 
 
 
228 aa  48.5  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0149548  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1942  phospholipase/carboxylesterase  30 
 
 
228 aa  48.5  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1958  phospholipase/carboxylesterase  30 
 
 
228 aa  48.5  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0275939  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1167  carboxylesterase, putative  30 
 
 
228 aa  48.5  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00098882  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1610  phospholipase/carboxylesterase  30 
 
 
228 aa  48.5  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.247692  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1113  phospholipase/carboxylesterase  29.93 
 
 
224 aa  47.8  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.668569  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1861  phospholipase/carboxylesterase  30.97 
 
 
228 aa  47.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.25946  normal  0.203182 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1208  phospholipase/Carboxylesterase  27.6 
 
 
223 aa  47.8  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2136  carboxylesterase  28.15 
 
 
224 aa  46.6  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000191828  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2404  carboxylesterase, putative  29.05 
 
 
319 aa  47  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0171467  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2931  phospholipase/carboxylesterase  31.86 
 
 
222 aa  46.2  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2670  carboxylesterase  28.57 
 
 
223 aa  46.2  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000549714  hitchhiker  0.00990238 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3420  phospholipase/Carboxylesterase  34.04 
 
 
205 aa  46.2  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2781  phospholipase/carboxylesterase  28.99 
 
 
221 aa  45.8  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3304  phospholipase/Carboxylesterase  34.45 
 
 
225 aa  46.2  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2028  esterase/lipase, putative  29.89 
 
 
211 aa  45.8  0.0006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.102102 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0092  phospholipase/Carboxylesterase  22.47 
 
 
248 aa  45.4  0.0007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.898581  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1326  phospholipase/carboxylesterase  30.63 
 
 
222 aa  45.4  0.0008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2455  phospholipase/carboxylesterase  28.15 
 
 
221 aa  45.4  0.0008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2022  carboxylesterase  30.15 
 
 
226 aa  45.1  0.0009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000559029  normal  0.99764 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1983  phospholipase/Carboxylesterase  37.17 
 
 
217 aa  44.7  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0573653  normal  0.134179 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1999  phospholipase/carboxylesterase family protein  28.68 
 
 
221 aa  45.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1950  carboxylesterase  26.28 
 
 
223 aa  44.3  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000802695  normal  0.0250693 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4934  phospholipase/carboxylesterase  32.31 
 
 
210 aa  44.3  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00035929 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1167  hypothetical protein  27.64 
 
 
471 aa  44.3  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.428408  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4695  phospholipase/carboxylesterase  29.79 
 
 
219 aa  44.7  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2054  phospholipase/carboxylesterase  31.79 
 
 
381 aa  43.5  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.287144  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0941  phospholipase/carboxylesterase  29.44 
 
 
552 aa  44.3  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.443784 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2337  carboxylesterase  28.15 
 
 
221 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.387077  normal  0.0702195 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2101  phospholipase/carboxylesterase  29.08 
 
 
223 aa  43.9  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0959  phospholipase/carboxylesterase  36.56 
 
 
193 aa  43.9  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.258344  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0054  carboxylesterase  30.6 
 
 
248 aa  43.9  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.691003  normal  0.104617 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0317  serine esterase  25.68 
 
 
222 aa  43.9  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00441133 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1073  phospholipase/Carboxylesterase  36.56 
 
 
218 aa  44.3  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1632  phospholipase/carboxylesterase  35.11 
 
 
224 aa  43.5  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2265  carboxylesterase  28.15 
 
 
221 aa  43.5  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2787  carboxymethylenebutenolidase  29.06 
 
 
254 aa  43.1  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4718  esterase YpfH  33.33 
 
 
207 aa  43.1  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3402  carboxylesterase  29.1 
 
 
220 aa  43.5  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2498  phospholipase/carboxylesterase  34.34 
 
 
220 aa  43.1  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05267  feruloyl esterase (Eurofung)  31.37 
 
 
270 aa  42.7  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1691  serine esterase  27.69 
 
 
227 aa  42.7  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2138  carboxylesterase  26.67 
 
 
234 aa  42.4  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000145278  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3813  phospholipase/carboxylesterase  33.33 
 
 
230 aa  42.4  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0993955  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0446  phospholipase/carboxylesterase  30.53 
 
 
243 aa  42  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0890683  normal  0.0467521 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1494  phospholipase/carboxylesterase  35 
 
 
256 aa  42  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.259302  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2312  carboxylesterase  28.15 
 
 
223 aa  41.6  0.01  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0295169  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1554  esterase YpfH  29.74 
 
 
241 aa  41.6  0.01  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.694816 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>