91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1106 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_1106  hypothetical protein  100 
 
 
355 aa  717    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.117901 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0548  phospholipase/Carboxylesterase  64.79 
 
 
358 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.185297  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0335  phospholipase/carboxylesterase  64.51 
 
 
357 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.64094  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0490  hypothetical protein  64.59 
 
 
357 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.637254  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1052  phospholipase/carboxylesterase  46.26 
 
 
365 aa  305  1.0000000000000001e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2287  phospholipase/Carboxylesterase  32.82 
 
 
263 aa  79  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.191504  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0409  phospholipase/Carboxylesterase  28.45 
 
 
277 aa  77  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00373212  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1208  phospholipase/carboxylesterase  32.43 
 
 
239 aa  76.3  0.0000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.12535 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4839  phospholipase/Carboxylesterase  30.57 
 
 
232 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1368  phospholipase/Carboxylesterase  31.89 
 
 
239 aa  73.6  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5584  phospholipase/carboxylesterase  32.57 
 
 
231 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3399  phospholipase/Carboxylesterase  28.5 
 
 
886 aa  69.3  0.00000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0843548  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1148  phospholipase/Carboxylesterase  29.53 
 
 
239 aa  69.3  0.00000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0242  phospholipase/Carboxylesterase  28.42 
 
 
412 aa  68.2  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.080802  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1716  phospholipase/Carboxylesterase  31.25 
 
 
217 aa  66.6  0.0000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4614  phospholipase/Carboxylesterase  29 
 
 
238 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.376672 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0890  phospholipase/carboxylesterase  25.12 
 
 
417 aa  65.9  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00284338  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0063  phospholipase/carboxylesterase  30.3 
 
 
227 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.982882  normal  0.670301 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0912  phospholipase/carboxylesterase  25.12 
 
 
417 aa  64.7  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0349753  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6756  phospholipase/carboxylesterase  27.98 
 
 
225 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.847027  normal  0.369639 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0060  phospholipase/carboxylesterase  31.43 
 
 
226 aa  63.9  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.885579  normal  0.31865 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5020  phospholipase/Carboxylesterase  26.18 
 
 
563 aa  63.5  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.780509  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1105  phospholipase/carboxylesterase  25.81 
 
 
253 aa  63.2  0.000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.320599  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0696  phospholipase/Carboxylesterase  27.4 
 
 
218 aa  60.5  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2269  hypothetical protein  26.34 
 
 
261 aa  60.1  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.187168  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4055  phospholipase/carboxylesterase  30.06 
 
 
242 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.342724  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4173  phospholipase/carboxylesterase  27.18 
 
 
225 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741665  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1400  phospholipase/Carboxylesterase  27.13 
 
 
325 aa  58.2  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3866  hypothetical protein  28.86 
 
 
302 aa  55.8  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.178954  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5282  hypothetical protein  28.96 
 
 
334 aa  55.8  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2561  phospholipase/Carboxylesterase  27.32 
 
 
229 aa  53.9  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.299124  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3855  phospholipase/Carboxylesterase  29.7 
 
 
226 aa  53.1  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  26.9 
 
 
1002 aa  52.4  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4144  phospholipase/carboxylesterase  27.6 
 
 
217 aa  51.2  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.111836 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2931  phospholipase/carboxylesterase  26.55 
 
 
222 aa  50.1  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0054  carboxylesterase  27.96 
 
 
248 aa  50.1  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.691003  normal  0.104617 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4230  phospholipase/Carboxylesterase  24.06 
 
 
268 aa  50.1  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.58568  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34810  esterase, poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  30.3 
 
 
501 aa  50.1  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2257  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  28.25 
 
 
270 aa  50.1  0.00006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0108  phospholipase/carboxylesterase family protein  29.09 
 
 
222 aa  50.1  0.00006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000237023  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1020  hypothetical protein  28.21 
 
 
260 aa  49.7  0.00007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3487  hypothetical protein  31.48 
 
 
332 aa  49.7  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2074  carboxylesterase  29.09 
 
 
236 aa  49.7  0.00009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.439919  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1493  phospholipase/Carboxylesterase  26.38 
 
 
317 aa  49.3  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.030471  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6990  phospholipase/Carboxylesterase  24.34 
 
 
276 aa  49.3  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0030979 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3402  carboxylesterase  25.23 
 
 
220 aa  48.9  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3106  putative lipoprotein  30.49 
 
 
341 aa  48.9  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3966  phospholipase/carboxylesterase  27.33 
 
 
795 aa  48.1  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1773  phospholipase/Carboxylesterase  28.35 
 
 
239 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2641  phospholipase/carboxylesterase  28.35 
 
 
205 aa  47.8  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.419247  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3048  phospholipase/Carboxylesterase  24.14 
 
 
405 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1955  phospholipase/carboxylesterase  26.55 
 
 
222 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0569  phospholipase/Carboxylesterase  31.25 
 
 
218 aa  47.4  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1107  carboxylesterase  25.5 
 
 
225 aa  47  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.175918  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0353  hypothetical protein  26.62 
 
 
261 aa  47  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.528975 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3742  peptidase-like protein  27.48 
 
 
326 aa  47  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5085  polyhydroxybutyrate depolymerase  27.5 
 
 
313 aa  46.6  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  normal  0.355318 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2537  phospholipase/carboxylesterase  24.84 
 
 
219 aa  46.2  0.0009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.311842  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0572  phospholipase/Carboxylesterase  32.74 
 
 
218 aa  46.2  0.0009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.637211  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7236  putative LpqP (hydrolase/esterase)  30 
 
 
405 aa  46.2  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0397136  normal  0.31443 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11300  Carboxylesterase I  28.8 
 
 
219 aa  45.4  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0686  phospholipase/carboxylesterase  22.82 
 
 
232 aa  45.8  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3270  esterase, PHB depolymerase  34.45 
 
 
372 aa  45.8  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.67973 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2408  carbohydrate esterase family 1 protein  26.7 
 
 
316 aa  45.8  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.211104  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5409  phospholipase/Carboxylesterase  23.77 
 
 
468 aa  46.2  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.301225 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1071  carboxylesterase  28.93 
 
 
219 aa  45.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1229  hypothetical protein  24.24 
 
 
816 aa  44.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.737589  hitchhiker  0.00225369 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2092  phospholipase/Carboxylesterase  29.57 
 
 
224 aa  45.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.907639 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2918  phospholipase/carboxylesterase  23.58 
 
 
218 aa  45.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2447  phospholipase/carboxylesterase  22.76 
 
 
214 aa  44.7  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.252523  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4424  phospholipase/Carboxylesterase  30.4 
 
 
204 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1893  phospholipase/Carboxylesterase  29.36 
 
 
223 aa  44.7  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02216  phospholipase/carboxylesterase superfamily  26.98 
 
 
245 aa  44.3  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.195432  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0185  hypothetical protein  21.8 
 
 
446 aa  44.7  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000162284  hitchhiker  0.000128495 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4488  phospholipase/Carboxylesterase  30.4 
 
 
204 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.332778 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1942  phospholipase/carboxylesterase  30.08 
 
 
228 aa  43.9  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1958  phospholipase/carboxylesterase  30.08 
 
 
228 aa  43.9  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0275939  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0272  putative carboxylesterase  30.08 
 
 
228 aa  43.9  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0149548  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0493  esterase, PHB depolymerase family  26.47 
 
 
378 aa  43.9  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1610  phospholipase/carboxylesterase  30.08 
 
 
228 aa  43.9  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.247692  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1167  carboxylesterase, putative  30.08 
 
 
228 aa  43.9  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00098882  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2197  carboxylesterase  28 
 
 
226 aa  43.9  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.610315  normal  0.977178 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2107  carboxylesterase  30.08 
 
 
228 aa  43.9  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.213325  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0972  phospholipase/carboxylesterase  26.35 
 
 
218 aa  43.9  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0373  polyhydroxybutyrate depolymerase  28.66 
 
 
357 aa  43.5  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0880654  hitchhiker  0.00622899 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1698  phospholipase/Carboxylesterase  28.35 
 
 
222 aa  43.5  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.675921  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1969  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  27.85 
 
 
363 aa  43.1  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0935555 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1079  phospholipase/carboxylesterase  24.07 
 
 
250 aa  42.7  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3522  phospholipase/carboxylesterase  24 
 
 
237 aa  42.7  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.406594  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1124  phospholipase/Carboxylesterase  24.07 
 
 
257 aa  42.7  0.009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2412  phospholipase/carboxylesterase  24.58 
 
 
227 aa  42.7  0.01  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0536257  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>