35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1229 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1229  hypothetical protein  100 
 
 		 816 aa  1685    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.737589  hitchhiker  0.00225369 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5819  hypothetical protein  53.43 
 
 		 816 aa  900    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.438939  decreased coverage  0.00192823 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3037  hypothetical protein  53.52 
 
 		 850 aa  869    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.762203  normal  0.221922 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5020  phospholipase/Carboxylesterase  26.84 
 
 		 563 aa  103  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.780509  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1987  hypothetical protein  22.24 
 
 		 700 aa  91.3  6e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0883  hypothetical protein  22.55 
 
 		 682 aa  90.9  8e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.888299  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1716  phospholipase/Carboxylesterase  32.73 
 
 		 217 aa  79.3  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04286  conserved hypothetical protein  21.58 
 
 		 861 aa  75.9  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.207639 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0409  phospholipase/Carboxylesterase  38.28 
 
 		 277 aa  74.7  0.000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00373212  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0696  phospholipase/Carboxylesterase  31.58 
 
 		 218 aa  68.2  0.0000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0799  hypothetical protein  28.65 
 
 		 752 aa  59.3  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.666809  normal  0.067283 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0780  hypothetical protein  28.65 
 
 		 752 aa  58.9  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.893714 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0784  hypothetical protein  28.65 
 
 		 752 aa  59.3  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2978  hypothetical protein  21.9 
 
 		 777 aa  58.2  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2269  hypothetical protein  26.42 
 
 		 261 aa  56.6  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.187168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1020  hypothetical protein  30.51 
 
 		 260 aa  53.9  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02216  phospholipase/carboxylesterase superfamily  29.2 
 
 		 245 aa  54.3  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.195432  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4230  phospholipase/Carboxylesterase  26.79 
 
 		 268 aa  52.8  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.58568  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3746  peptidase-like  42.25 
 
 		 325 aa  53.5  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.841468 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6990  phospholipase/Carboxylesterase  33.33 
 
 		 276 aa  52  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030979 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1105  phospholipase/carboxylesterase  30 
 
 		 253 aa  49.7  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.320599  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3399  phospholipase/Carboxylesterase  25 
 
 		 886 aa  48.1  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0843548  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5249  phospholipase/carboxylesterase  40 
 
 		 243 aa  47.8  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0855258  normal  0.417619 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3660  PHB depolymerase family esterase  31.25 
 
 		 381 aa  47  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.741995  normal  0.231581 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4124  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.38 
 
 		 645 aa  46.6  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4323  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.38 
 
 		 645 aa  46.6  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0143  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.38 
 
 		 645 aa  46.6  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  31.78 
 
 		 1002 aa  46.2  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3966  phospholipase/carboxylesterase  28.77 
 
 		 795 aa  45.4  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1106  hypothetical protein  24.24 
 
 		 355 aa  44.7  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.117901 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2781  hypothetical protein  31.33 
 
 		 796 aa  44.7  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.216427  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0944  hypothetical protein  50 
 
 		 265 aa  44.7  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.992264  normal  0.367367 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3803  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.43 
 
 		 645 aa  44.7  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.6032 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3048  phospholipase/Carboxylesterase  28.32 
 
 		 405 aa  44.3  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3522  phospholipase/carboxylesterase  26.5 
 
 		 237 aa  44.3  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.406594  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>