32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5819 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_1229  hypothetical protein  52.63 
 
 
816 aa  904    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.737589  hitchhiker  0.00225369 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5819  hypothetical protein  100 
 
 
816 aa  1690    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.438939  decreased coverage  0.00192823 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3037  hypothetical protein  52.85 
 
 
850 aa  894    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.762203  normal  0.221922 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5020  phospholipase/Carboxylesterase  26.23 
 
 
563 aa  99.4  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.780509  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0409  phospholipase/Carboxylesterase  35.77 
 
 
277 aa  84.3  0.000000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00373212  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1987  hypothetical protein  21.37 
 
 
700 aa  77.8  0.0000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0883  hypothetical protein  22.22 
 
 
682 aa  65.9  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.888299  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2269  hypothetical protein  30.43 
 
 
261 aa  65.1  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.187168  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1716  phospholipase/Carboxylesterase  29.8 
 
 
217 aa  65.5  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0696  phospholipase/Carboxylesterase  28.48 
 
 
218 aa  58.2  0.0000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02216  phospholipase/carboxylesterase superfamily  28.47 
 
 
245 aa  56.6  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.195432  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04286  conserved hypothetical protein  30.88 
 
 
861 aa  56.6  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.207639 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3048  phospholipase/Carboxylesterase  23.47 
 
 
405 aa  53.5  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0780  hypothetical protein  27.04 
 
 
752 aa  52.8  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.893714 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3399  phospholipase/Carboxylesterase  25.66 
 
 
886 aa  53.5  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0843548  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0799  hypothetical protein  27.04 
 
 
752 aa  52  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.666809  normal  0.067283 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0784  hypothetical protein  27.04 
 
 
752 aa  52  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4230  phospholipase/Carboxylesterase  31.31 
 
 
268 aa  52  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.58568  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3625  putative esterase  29.11 
 
 
283 aa  51.6  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000216129  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1105  phospholipase/carboxylesterase  29.27 
 
 
253 aa  50.8  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.320599  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  34.26 
 
 
1002 aa  50.1  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0912  phospholipase/carboxylesterase  27.54 
 
 
417 aa  48.1  0.0006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0349753  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6990  phospholipase/Carboxylesterase  48.21 
 
 
276 aa  47.8  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0030979 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0088  phospholipase/Carboxylesterase  28.99 
 
 
255 aa  47.8  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0890  phospholipase/carboxylesterase  26.81 
 
 
417 aa  47.8  0.0008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00284338  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0514  phospholipase/carboxylesterase  30.4 
 
 
249 aa  47.4  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.463342  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3746  peptidase-like  39.44 
 
 
325 aa  47  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.841468 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2978  hypothetical protein  20.55 
 
 
777 aa  45.8  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3966  phospholipase/carboxylesterase  32.19 
 
 
795 aa  45.8  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1020  hypothetical protein  27.27 
 
 
260 aa  44.7  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0944  hypothetical protein  32.56 
 
 
265 aa  44.3  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.992264  normal  0.367367 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2781  hypothetical protein  31.33 
 
 
796 aa  44.3  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.216427  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>