41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1987 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1987  hypothetical protein  100 
 
 		 700 aa  1446    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0883  hypothetical protein  30.16 
 
 		 682 aa  281  3e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.888299  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5020  phospholipase/Carboxylesterase  27.29 
 
 		 563 aa  131  4.0000000000000003e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.780509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1229  hypothetical protein  22.24 
 
 		 816 aa  91.3  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.737589  hitchhiker  0.00225369 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5819  hypothetical protein  21.37 
 
 		 816 aa  77.4  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.438939  decreased coverage  0.00192823 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1105  phospholipase/carboxylesterase  25.58 
 
 		 253 aa  75.9  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.320599  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3037  hypothetical protein  20.75 
 
 		 850 aa  75.5  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.762203  normal  0.221922 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0409  phospholipase/Carboxylesterase  28.04 
 
 		 277 aa  63.2  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00373212  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1716  phospholipase/Carboxylesterase  29.77 
 
 		 217 aa  61.2  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5249  phospholipase/carboxylesterase  31.4 
 
 		 243 aa  60.5  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0855258  normal  0.417619 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0696  phospholipase/Carboxylesterase  30.77 
 
 		 218 aa  60.5  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3857  PHB depolymerase family esterase  28.65 
 
 		 414 aa  57.8  0.0000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6990  phospholipase/Carboxylesterase  28.33 
 
 		 276 aa  57.8  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030979 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3399  phospholipase/Carboxylesterase  31.82 
 
 		 886 aa  55.5  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0843548  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1578  putative esterase  30.43 
 
 		 295 aa  55.1  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.56731  normal  0.469655 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0780  hypothetical protein  26.16 
 
 		 752 aa  51.6  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.893714 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0799  hypothetical protein  26.16 
 
 		 752 aa  51.6  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.666809  normal  0.067283 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0784  hypothetical protein  26.16 
 
 		 752 aa  51.6  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2978  hypothetical protein  30.69 
 
 		 777 aa  50.8  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1020  hypothetical protein  28.23 
 
 		 260 aa  50.8  0.00009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1211  esterase, PHB depolymerase family  24.84 
 
 		 312 aa  48.5  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0349548 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2308  putative esterase  26.49 
 
 		 270 aa  48.1  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4144  phospholipase/carboxylesterase  30 
 
 		 217 aa  48.1  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.111836 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0242  phospholipase/Carboxylesterase  28.1 
 
 		 412 aa  46.6  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.080802  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0944  hypothetical protein  26.98 
 
 		 265 aa  47.4  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.992264  normal  0.367367 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2650  hypothetical protein  27.39 
 
 		 355 aa  46.6  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.376354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3746  peptidase-like  20.49 
 
 		 325 aa  46.2  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.841468 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2269  hypothetical protein  24.22 
 
 		 261 aa  46.6  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.187168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3522  phospholipase/carboxylesterase  31.88 
 
 		 237 aa  45.4  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.406594  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3823  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  27.61 
 
 		 374 aa  45.8  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1701  S-formylglutathione hydrolase  46.94 
 
 		 291 aa  45.8  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0975891  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2510  S-formylglutathione hydrolase  28.45 
 
 		 273 aa  45.4  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.566414  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2781  hypothetical protein  34.78 
 
 		 796 aa  44.7  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.216427  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2413  S-formylglutathione hydrolase  26.09 
 
 		 290 aa  44.7  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5113  esterase, PHB depolymerase  27.69 
 
 		 370 aa  44.7  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.841359  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0822  hypothetical protein  29.85 
 
 		 565 aa  44.7  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.390074 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33500  esterase, poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  26.25 
 
 		 429 aa  44.7  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4230  phospholipase/Carboxylesterase  23.26 
 
 		 268 aa  44.7  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.58568  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4136  putative esterase  23.83 
 
 		 327 aa  44.3  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.520814 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4097  putative esterase  23.83 
 
 		 327 aa  44.3  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5282  hypothetical protein  28.49 
 
 		 334 aa  44.7  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.21823 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>