243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2510 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_2510  S-formylglutathione hydrolase  100 
 
 
273 aa  575  1.0000000000000001e-163  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.566414  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1021  S-formylglutathione hydrolase  81.32 
 
 
277 aa  484  1e-136  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.444109  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4831  S-formylglutathione hydrolase  68.13 
 
 
278 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.256219 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0141  S-formylglutathione hydrolase  67.03 
 
 
293 aa  396  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0333539  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4919  S-formylglutathione hydrolase  65.2 
 
 
278 aa  385  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0127  esterase, putative  67.87 
 
 
251 aa  365  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0122  S-formylglutathione hydrolase  67.47 
 
 
251 aa  362  3e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16316  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1177  S-formylglutathione hydrolase  61.31 
 
 
292 aa  346  2e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0099  carboxylesterase  60.95 
 
 
281 aa  342  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5942  S-formylglutathione hydrolase  58.03 
 
 
281 aa  334  9e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.183278  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1834  carboxylesterase  58.55 
 
 
282 aa  333  1e-90  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.018763  normal  0.805615 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2922  carboxylesterase  57.97 
 
 
285 aa  320  1.9999999999999998e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0002  carboxylesterase  56.2 
 
 
283 aa  314  9.999999999999999e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0986  carboxylesterase  50.55 
 
 
285 aa  300  2e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1541  carboxylesterase  52.01 
 
 
278 aa  297  1e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.107015  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0807  carboxylesterase  52.38 
 
 
281 aa  296  3e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0179435  hitchhiker  0.00571706 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0003  carboxylesterase  54.44 
 
 
281 aa  293  2e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000616557 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1393  carboxylesterase  51.27 
 
 
281 aa  292  4e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0228664  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0019  carboxylesterase  50.18 
 
 
279 aa  292  5e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2312  S-formylglutathione hydrolase  52.73 
 
 
280 aa  291  6e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.770707  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3766  carboxylesterase  51.09 
 
 
279 aa  291  9e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1559  esterase, putative  53.09 
 
 
281 aa  290  2e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.41528  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1126  putative esterase  52.73 
 
 
281 aa  290  2e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3406  carboxylesterase  51.09 
 
 
282 aa  288  6e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1368  carboxylesterase  53.09 
 
 
281 aa  288  7e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1171  S-formylglutathione hydrolase  52.71 
 
 
284 aa  288  9e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.441797 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1617  S-formylglutathione hydrolase  52.35 
 
 
284 aa  287  1e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.117906  normal  0.524398 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4160  S-formylglutathione hydrolase  52.35 
 
 
284 aa  287  1e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.394545 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4058  carboxylesterase  50.73 
 
 
281 aa  287  1e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.863948  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0270  S-formylglutathione hydrolase  50.36 
 
 
279 aa  287  1e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3123  carboxylesterase  50.55 
 
 
276 aa  287  1e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00154101 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0852  S-formylglutathione hydrolase  50.55 
 
 
276 aa  286  2e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0397354  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2511  carboxylesterase  50.92 
 
 
276 aa  287  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.863748  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0607  S-formylglutathione hydrolase  51.82 
 
 
282 aa  285  7e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0376  S-formylglutathione hydrolase  50 
 
 
289 aa  285  8e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2412  S-formylglutathione hydrolase  51.65 
 
 
281 aa  284  9e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.246644  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1087  putative esterase  50.37 
 
 
278 aa  284  1.0000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3945  S-formylglutathione hydrolase  50.18 
 
 
276 aa  284  1.0000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.897116  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1439  carboxylesterase  50 
 
 
285 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3426  carboxylesterase  50.73 
 
 
279 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4058  S-formylglutathione hydrolase  51.99 
 
 
284 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000241575 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2525  S-formylglutathione hydrolase  50.37 
 
 
280 aa  282  5.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.81553  normal  0.653671 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04413  S-formylglutathione hydrolase  50.55 
 
 
276 aa  281  7.000000000000001e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1941  S-formylglutathione hydrolase  50 
 
 
280 aa  280  1e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00373445  normal  0.789535 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2418  S-formylglutathione hydrolase  50 
 
 
280 aa  281  1e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2407  S-formylglutathione hydrolase  49.63 
 
 
280 aa  280  2e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2496  S-formylglutathione hydrolase  52.01 
 
 
280 aa  280  2e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.881177  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4226  carboxylesterase  49.64 
 
 
279 aa  279  3e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0152295 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2190  carboxylesterase  51.11 
 
 
279 aa  279  3e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38740  S-formylglutathione hydrolase  52.03 
 
 
281 aa  279  3e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0819  putative esterase  49.64 
 
 
283 aa  278  5e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1787  carboxylesterase  50.74 
 
 
279 aa  278  7e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1838  putative esterase  50.74 
 
 
279 aa  278  7e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.236801 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2252  carboxylesterase  50.36 
 
 
283 aa  278  7e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.493434  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06926  esterase  50 
 
 
279 aa  278  8e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3448  carboxylesterase  49.08 
 
 
281 aa  278  9e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.775669 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0484  S-formylglutathione hydrolase  48.36 
 
 
281 aa  278  1e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.329572  hitchhiker  0.0024188 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1229  carboxylesterase  50 
 
 
286 aa  277  1e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.335856 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2173  carboxylesterase  49.63 
 
 
280 aa  277  1e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.116345  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4239  S-formylglutathione hydrolase  49.64 
 
 
276 aa  276  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1556  S-formylglutathione hydrolase  50.55 
 
 
280 aa  277  2e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0160  esterase, putative  49.27 
 
 
279 aa  276  3e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.471398  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1828  carboxylesterase  48.74 
 
 
298 aa  276  3e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0463121  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3027  carboxylesterase  51.64 
 
 
280 aa  276  4e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000156847 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0756  S-formylglutathione hydrolase  49.45 
 
 
282 aa  275  6e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.135614 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2755  carboxylesterase  49.64 
 
 
278 aa  275  7e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.936506  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3999  carboxylesterase  50.36 
 
 
283 aa  273  1.0000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.122299  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0052  carboxylesterase  49.08 
 
 
277 aa  274  1.0000000000000001e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0420  S-formylglutathione hydrolase  47.62 
 
 
277 aa  274  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2801  carboxylesterase  49.82 
 
 
294 aa  274  1.0000000000000001e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.234504 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2055  esterase, putative  49.63 
 
 
279 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0051  periplasmic nitrate reductase, large subunit  50 
 
 
280 aa  273  2.0000000000000002e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.649739 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03627  Carboxylesterase  48 
 
 
280 aa  273  2.0000000000000002e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3385  S-formylglutathione hydrolase  51.52 
 
 
276 aa  272  3e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.217643  normal  0.707698 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2524  S-formylglutathione hydrolase  48.91 
 
 
282 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.225567  normal  0.138843 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0380  S-formylglutathione hydrolase  47.25 
 
 
277 aa  272  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2291  S-formylglutathione hydrolase  49.11 
 
 
294 aa  272  4.0000000000000004e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2413  S-formylglutathione hydrolase  51.26 
 
 
290 aa  272  5.000000000000001e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1511  S-formylglutathione hydrolase  49.82 
 
 
283 aa  271  6e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2651  carboxylesterase  48.91 
 
 
282 aa  271  6e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0386  S-formylglutathione hydrolase  47.25 
 
 
277 aa  271  9e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.94847  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000930  S-formylglutathione hydrolase  48.91 
 
 
279 aa  271  1e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0122  carboxylesterase  49.64 
 
 
288 aa  270  2e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17410  putative esterase  51.09 
 
 
283 aa  270  2e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2474  S-formylglutathione hydrolase  48.72 
 
 
280 aa  270  2.9999999999999997e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4785  S-formylglutathione hydrolase  49.46 
 
 
282 aa  268  5e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0295503  normal  0.699592 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00309  predicted esterase  46.52 
 
 
277 aa  268  7e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00313  hypothetical protein  46.52 
 
 
277 aa  268  7e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3270  S-formylglutathione hydrolase  46.52 
 
 
277 aa  268  7e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.103024  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2543  S-formylglutathione hydrolase  48.38 
 
 
285 aa  268  7e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.420997  normal  0.167647 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2429  S-formylglutathione hydrolase  48.38 
 
 
285 aa  268  8e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.74612 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2385  S-formylglutathione hydrolase  48.38 
 
 
285 aa  268  8e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.72074 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2340  S-formylglutathione hydrolase  48.38 
 
 
285 aa  268  8e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.723017  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0474  S-formylglutathione hydrolase  47.62 
 
 
275 aa  268  1e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1026  S-formylglutathione hydrolase  47.46 
 
 
286 aa  267  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.199417  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0080  S-formylglutathione hydrolase  52.24 
 
 
282 aa  267  1e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0827434  hitchhiker  0.00557282 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2572  S-formylglutathione hydrolase  48.35 
 
 
280 aa  267  1e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0430  S-formylglutathione hydrolase  46.52 
 
 
277 aa  268  1e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0863  S-formylglutathione hydrolase  47.46 
 
 
286 aa  267  1e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0867  S-formylglutathione hydrolase  47.46 
 
 
286 aa  267  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>