214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1177 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_1177  S-formylglutathione hydrolase  100 
 
 
292 aa  598  1e-170  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2922  carboxylesterase  75.89 
 
 
285 aa  442  1e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5942  S-formylglutathione hydrolase  75.63 
 
 
281 aa  440  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.183278  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0099  carboxylesterase  75.71 
 
 
281 aa  433  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1834  carboxylesterase  67.62 
 
 
282 aa  393  1e-108  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.018763  normal  0.805615 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0141  S-formylglutathione hydrolase  59.15 
 
 
293 aa  357  9e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0333539  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1021  S-formylglutathione hydrolase  62.45 
 
 
277 aa  353  2e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.444109  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4831  S-formylglutathione hydrolase  62.09 
 
 
278 aa  351  8.999999999999999e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.256219 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4919  S-formylglutathione hydrolase  61.73 
 
 
278 aa  348  4e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2510  S-formylglutathione hydrolase  61.31 
 
 
273 aa  346  2e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.566414  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0019  carboxylesterase  58.72 
 
 
279 aa  346  3e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0127  esterase, putative  64.14 
 
 
251 aa  339  2.9999999999999998e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0122  S-formylglutathione hydrolase  63.75 
 
 
251 aa  336  1.9999999999999998e-91  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16316  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4058  carboxylesterase  56.27 
 
 
281 aa  333  2e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.863948  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3406  carboxylesterase  58.36 
 
 
282 aa  330  2e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0607  S-formylglutathione hydrolase  56.89 
 
 
282 aa  325  7e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3027  carboxylesterase  59.29 
 
 
280 aa  322  5e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000156847 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0807  carboxylesterase  58.06 
 
 
281 aa  321  9.999999999999999e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0179435  hitchhiker  0.00571706 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3448  carboxylesterase  55.87 
 
 
281 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.775669 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0002  carboxylesterase  58.63 
 
 
283 aa  318  6e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3766  carboxylesterase  53.41 
 
 
279 aa  316  4e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1617  S-formylglutathione hydrolase  56.38 
 
 
284 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.117906  normal  0.524398 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4160  S-formylglutathione hydrolase  56.38 
 
 
284 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.394545 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1559  esterase, putative  55.87 
 
 
281 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.41528  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1171  S-formylglutathione hydrolase  56.38 
 
 
284 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.441797 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1368  carboxylesterase  55.87 
 
 
281 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4239  S-formylglutathione hydrolase  56.27 
 
 
276 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1126  putative esterase  55.16 
 
 
281 aa  311  7.999999999999999e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1511  S-formylglutathione hydrolase  55.28 
 
 
283 aa  308  8e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0986  carboxylesterase  53.02 
 
 
285 aa  307  2.0000000000000002e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4058  S-formylglutathione hydrolase  55.32 
 
 
284 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000241575 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17410  putative esterase  55.28 
 
 
283 aa  306  3e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38740  S-formylglutathione hydrolase  56.07 
 
 
281 aa  305  5.0000000000000004e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0052  carboxylesterase  55.23 
 
 
277 aa  305  5.0000000000000004e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0051  periplasmic nitrate reductase, large subunit  53.21 
 
 
280 aa  305  5.0000000000000004e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.649739 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1393  carboxylesterase  52.67 
 
 
281 aa  305  6e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0228664  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3531  carboxylesterase  52.5 
 
 
283 aa  305  7e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00419783 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04413  S-formylglutathione hydrolase  55.91 
 
 
276 aa  305  8.000000000000001e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0745  putative esterase  51.6 
 
 
280 aa  304  1.0000000000000001e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.474716  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0105  S-formylglutathione hydrolase  53.96 
 
 
276 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1541  carboxylesterase  52.69 
 
 
278 aa  302  5.000000000000001e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.107015  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0003  carboxylesterase  53.09 
 
 
281 aa  301  7.000000000000001e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000616557 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03627  Carboxylesterase  52.16 
 
 
280 aa  301  1e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1787  carboxylesterase  51.07 
 
 
279 aa  300  1e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2190  carboxylesterase  51.07 
 
 
279 aa  300  1e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2273  carboxylesterase  54.06 
 
 
289 aa  300  2e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0819  putative esterase  54.04 
 
 
283 aa  299  5e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3945  S-formylglutathione hydrolase  52.88 
 
 
276 aa  299  5e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.897116  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1838  putative esterase  50.71 
 
 
279 aa  298  6e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.236801 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3426  carboxylesterase  53.93 
 
 
279 aa  298  8e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2252  carboxylesterase  53.21 
 
 
283 aa  298  8e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.493434  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2452  S-formylglutathione hydrolase  53.71 
 
 
279 aa  297  2e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.243797  normal  0.206976 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1666  S-formylglutathione hydrolase  53.02 
 
 
281 aa  296  2e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.37813  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1937  S-formylglutathione hydrolase  53.02 
 
 
280 aa  296  4e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.446926  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0160  esterase, putative  53.93 
 
 
279 aa  295  4e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.471398  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2511  carboxylesterase  52.35 
 
 
276 aa  296  4e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.863748  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0852  S-formylglutathione hydrolase  51.99 
 
 
276 aa  295  5e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0397354  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3123  carboxylesterase  51.61 
 
 
276 aa  295  5e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00154101 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06926  esterase  51.43 
 
 
279 aa  295  9e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0270  S-formylglutathione hydrolase  52.5 
 
 
279 aa  294  1e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3515  S-formylglutathione hydrolase  55.2 
 
 
278 aa  294  1e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1941  S-formylglutathione hydrolase  49.29 
 
 
280 aa  293  2e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00373445  normal  0.789535 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1439  carboxylesterase  52.46 
 
 
285 aa  292  4e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2055  esterase, putative  49.64 
 
 
279 aa  291  6e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4226  carboxylesterase  53.21 
 
 
279 aa  292  6e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0152295 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000930  S-formylglutathione hydrolase  51.43 
 
 
279 aa  291  7e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2407  S-formylglutathione hydrolase  48.93 
 
 
280 aa  291  9e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1087  putative esterase  51.64 
 
 
278 aa  291  1e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1556  S-formylglutathione hydrolase  52.67 
 
 
280 aa  291  1e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0458  carboxylesterase  54.32 
 
 
278 aa  290  2e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0474  S-formylglutathione hydrolase  52.52 
 
 
275 aa  290  2e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3679  S-formylglutathione hydrolase  50.9 
 
 
276 aa  290  2e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.182564  normal  0.277984 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2418  S-formylglutathione hydrolase  48.93 
 
 
280 aa  290  2e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0376  S-formylglutathione hydrolase  51.42 
 
 
289 aa  290  2e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2412  S-formylglutathione hydrolase  51.59 
 
 
281 aa  289  4e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.246644  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2525  S-formylglutathione hydrolase  48.57 
 
 
280 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.81553  normal  0.653671 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3252  S-formylglutathione hydrolase  52.65 
 
 
283 aa  288  6e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.499772 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2474  S-formylglutathione hydrolase  50.71 
 
 
280 aa  287  2e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4023  carboxylesterase  54.61 
 
 
287 aa  287  2e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.707301 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2173  carboxylesterase  48.57 
 
 
280 aa  287  2e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.116345  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3385  S-formylglutathione hydrolase  56.39 
 
 
276 aa  286  2.9999999999999996e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.217643  normal  0.707698 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0714  S-formylglutathione hydrolase (FghA)  52.65 
 
 
285 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224272  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2524  S-formylglutathione hydrolase  54.29 
 
 
282 aa  286  4e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.225567  normal  0.138843 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2572  S-formylglutathione hydrolase  50.35 
 
 
280 aa  285  5e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2651  carboxylesterase  54.29 
 
 
282 aa  285  5e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0484  S-formylglutathione hydrolase  51.6 
 
 
281 aa  285  7e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.329572  hitchhiker  0.0024188 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2385  S-formylglutathione hydrolase  50.71 
 
 
285 aa  284  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.72074 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2429  S-formylglutathione hydrolase  50.71 
 
 
285 aa  284  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.74612 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2543  S-formylglutathione hydrolase  50.71 
 
 
285 aa  284  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.420997  normal  0.167647 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0430  S-formylglutathione hydrolase  48.2 
 
 
277 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2340  S-formylglutathione hydrolase  50.71 
 
 
285 aa  284  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.723017  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0604  hydrolase oxidoreductase protein  53.71 
 
 
289 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.197759  normal  0.276629 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0380  S-formylglutathione hydrolase  48.2 
 
 
277 aa  283  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2433  S-formylglutathione hydrolase  50.36 
 
 
285 aa  283  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.511168  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0694  S-formylglutathione hydrolase  52.86 
 
 
282 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.816955 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1229  carboxylesterase  50.89 
 
 
286 aa  283  3.0000000000000004e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.335856 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2312  S-formylglutathione hydrolase  51.24 
 
 
280 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.770707  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3010  S-formylglutathione hydrolase  50 
 
 
280 aa  282  4.0000000000000003e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00182867  hitchhiker  0.00074389 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0386  S-formylglutathione hydrolase  47.84 
 
 
277 aa  281  6.000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.94847  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2801  carboxylesterase  50.87 
 
 
294 aa  282  6.000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.234504 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>