264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_4160 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_1617  S-formylglutathione hydrolase  100 
 
 
284 aa  590  1e-168  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.117906  normal  0.524398 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4160  S-formylglutathione hydrolase  100 
 
 
284 aa  590  1e-168  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.394545 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1171  S-formylglutathione hydrolase  98.24 
 
 
284 aa  584  1e-166  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.441797 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4058  S-formylglutathione hydrolase  95.41 
 
 
284 aa  568  1e-161  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000241575 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1126  putative esterase  84.34 
 
 
281 aa  504  9.999999999999999e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1559  esterase, putative  82.62 
 
 
281 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.41528  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1368  carboxylesterase  83.33 
 
 
281 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3027  carboxylesterase  78.72 
 
 
280 aa  457  9.999999999999999e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000156847 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1511  S-formylglutathione hydrolase  77.5 
 
 
283 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38740  S-formylglutathione hydrolase  77.22 
 
 
281 aa  447  1.0000000000000001e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17410  putative esterase  76.43 
 
 
283 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0607  S-formylglutathione hydrolase  74.82 
 
 
282 aa  441  1e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0270  S-formylglutathione hydrolase  67.27 
 
 
279 aa  401  1e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0160  esterase, putative  67.84 
 
 
279 aa  401  1e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.471398  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1393  carboxylesterase  66.55 
 
 
281 aa  399  9.999999999999999e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0228664  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3766  carboxylesterase  67.02 
 
 
279 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3426  carboxylesterase  66.78 
 
 
279 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4058  carboxylesterase  66.55 
 
 
281 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.863948  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1787  carboxylesterase  66.67 
 
 
279 aa  396  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2190  carboxylesterase  66.67 
 
 
279 aa  396  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1941  S-formylglutathione hydrolase  65.95 
 
 
280 aa  394  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00373445  normal  0.789535 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1838  putative esterase  66.31 
 
 
279 aa  394  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.236801 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4226  carboxylesterase  65.72 
 
 
279 aa  391  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0152295 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2407  S-formylglutathione hydrolase  65.59 
 
 
280 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2418  S-formylglutathione hydrolase  65.59 
 
 
280 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3531  carboxylesterase  64.18 
 
 
283 aa  392  1e-108  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00419783 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0376  S-formylglutathione hydrolase  65.02 
 
 
289 aa  391  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2055  esterase, putative  65.59 
 
 
279 aa  388  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0986  carboxylesterase  64.18 
 
 
285 aa  389  1e-107  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2525  S-formylglutathione hydrolase  65.23 
 
 
280 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.81553  normal  0.653671 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1439  carboxylesterase  64.31 
 
 
285 aa  388  1e-107  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2252  carboxylesterase  65.25 
 
 
283 aa  388  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.493434  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3406  carboxylesterase  67.39 
 
 
282 aa  387  1e-106  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0051  periplasmic nitrate reductase, large subunit  62.41 
 
 
280 aa  384  1e-106  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.649739 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2173  carboxylesterase  65.23 
 
 
280 aa  387  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.116345  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0003  carboxylesterase  66.08 
 
 
281 aa  387  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000616557 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3679  S-formylglutathione hydrolase  63.8 
 
 
276 aa  382  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.182564  normal  0.277984 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1541  carboxylesterase  64.06 
 
 
278 aa  381  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.107015  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03627  Carboxylesterase  62.06 
 
 
280 aa  380  1e-104  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0819  putative esterase  62.63 
 
 
283 aa  375  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0745  putative esterase  60.78 
 
 
280 aa  375  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.474716  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0257  Fis family transcriptional regulator  63.48 
 
 
281 aa  374  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06926  esterase  60.85 
 
 
279 aa  369  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3385  S-formylglutathione hydrolase  67.78 
 
 
276 aa  365  1e-100  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.217643  normal  0.707698 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000930  S-formylglutathione hydrolase  61.21 
 
 
279 aa  367  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04413  S-formylglutathione hydrolase  64.16 
 
 
276 aa  366  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2273  carboxylesterase  60.57 
 
 
289 aa  359  3e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4239  S-formylglutathione hydrolase  62.37 
 
 
276 aa  359  3e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0105  S-formylglutathione hydrolase  61.92 
 
 
276 aa  359  3e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2433  S-formylglutathione hydrolase  60.14 
 
 
285 aa  352  5.9999999999999994e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.511168  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2429  S-formylglutathione hydrolase  60.14 
 
 
285 aa  351  8.999999999999999e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.74612 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2385  S-formylglutathione hydrolase  60.14 
 
 
285 aa  351  8.999999999999999e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.72074 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2340  S-formylglutathione hydrolase  60.14 
 
 
285 aa  351  8.999999999999999e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.723017  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2543  S-formylglutathione hydrolase  60.14 
 
 
285 aa  350  1e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.420997  normal  0.167647 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1828  carboxylesterase  56.74 
 
 
298 aa  350  1e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0463121  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2301  S-formylglutathione hydrolase  62.59 
 
 
278 aa  344  1e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.014444 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4023  carboxylesterase  62.31 
 
 
287 aa  343  1e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.707301 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3289  S-formylglutathione hydrolase  61.76 
 
 
278 aa  343  2e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.410888  normal  0.795091 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2412  S-formylglutathione hydrolase  60.71 
 
 
281 aa  342  2.9999999999999997e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.246644  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2450  S-formylglutathione hydrolase  61.76 
 
 
278 aa  342  5.999999999999999e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02083  predicted esterase  61.4 
 
 
278 aa  341  8e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.229266  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1504  S-formylglutathione hydrolase  61.4 
 
 
278 aa  341  8e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0638079  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0812  S-formylglutathione hydrolase  61.4 
 
 
278 aa  341  8e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.631287  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2288  S-formylglutathione hydrolase  61.4 
 
 
278 aa  341  8e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02042  hypothetical protein  61.4 
 
 
278 aa  341  8e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214105  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1494  S-formylglutathione hydrolase  61.4 
 
 
278 aa  341  8e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.777132 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2312  S-formylglutathione hydrolase  60.36 
 
 
280 aa  340  1e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.770707  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0002  carboxylesterase  60.29 
 
 
283 aa  340  2e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2755  carboxylesterase  59.85 
 
 
278 aa  339  2.9999999999999998e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.936506  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1556  S-formylglutathione hydrolase  58.66 
 
 
280 aa  330  1e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2474  S-formylglutathione hydrolase  58.21 
 
 
280 aa  328  6e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0756  S-formylglutathione hydrolase  60.44 
 
 
282 aa  328  8e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.135614 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1087  putative esterase  57.86 
 
 
278 aa  325  4.0000000000000003e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2572  S-formylglutathione hydrolase  57.5 
 
 
280 aa  324  1e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3010  S-formylglutathione hydrolase  57.5 
 
 
280 aa  323  2e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00182867  hitchhiker  0.00074389 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1937  S-formylglutathione hydrolase  59.21 
 
 
280 aa  322  4e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.446926  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2413  S-formylglutathione hydrolase  57.8 
 
 
290 aa  321  8e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0698  S-formylglutathione hydrolase  60.85 
 
 
284 aa  320  9.999999999999999e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.380863  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3252  S-formylglutathione hydrolase  55.87 
 
 
283 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.499772 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0458  carboxylesterase  59.22 
 
 
278 aa  320  1.9999999999999998e-86  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1834  carboxylesterase  55.48 
 
 
282 aa  319  3.9999999999999996e-86  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.018763  normal  0.805615 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0714  S-formylglutathione hydrolase (FghA)  56.23 
 
 
285 aa  318  5e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224272  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0099  carboxylesterase  56.38 
 
 
281 aa  316  2e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0846  S-formylglutathione hydrolase  63.02 
 
 
268 aa  317  2e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.923853 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1666  S-formylglutathione hydrolase  57.76 
 
 
281 aa  316  3e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.37813  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2922  carboxylesterase  55.87 
 
 
285 aa  315  4e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3999  carboxylesterase  56.94 
 
 
283 aa  314  9e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.122299  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1177  S-formylglutathione hydrolase  56.38 
 
 
292 aa  314  9.999999999999999e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0687  esterase, putative  56.54 
 
 
282 aa  312  2.9999999999999996e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1993  carboxylesterase  56.54 
 
 
282 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2603  carboxylesterase  56.54 
 
 
282 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2627  S-formylglutathione hydrolase  56.18 
 
 
282 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1026  S-formylglutathione hydrolase  55.79 
 
 
286 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.199417  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0863  S-formylglutathione hydrolase  55.79 
 
 
286 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0867  S-formylglutathione hydrolase  55.79 
 
 
286 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0071  putative esterase  55.44 
 
 
286 aa  311  1e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0694  S-formylglutathione hydrolase  56.18 
 
 
282 aa  310  1e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.816955 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2291  S-formylglutathione hydrolase  55.75 
 
 
294 aa  310  1e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0623  putative esterase  55.44 
 
 
286 aa  311  1e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.778268  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2457  putative esterase  55.44 
 
 
286 aa  311  1e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>