251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_A0160 on replicon NC_004349
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004349  SO_A0160  esterase, putative  100 
 
 
279 aa  585  1e-166  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.471398  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3426  carboxylesterase  96.42 
 
 
279 aa  567  1e-161  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4226  carboxylesterase  92.11 
 
 
279 aa  548  1e-155  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0152295 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0270  S-formylglutathione hydrolase  86.02 
 
 
279 aa  525  1e-148  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0376  S-formylglutathione hydrolase  86.74 
 
 
289 aa  520  1e-146  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1439  carboxylesterase  79.21 
 
 
285 aa  483  1e-135  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0819  putative esterase  78.78 
 
 
283 aa  479  1e-134  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2252  carboxylesterase  78.06 
 
 
283 aa  478  1e-134  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.493434  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1393  carboxylesterase  74.91 
 
 
281 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0228664  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3531  carboxylesterase  72.5 
 
 
283 aa  434  1e-121  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00419783 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1541  carboxylesterase  71.48 
 
 
278 aa  428  1e-119  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.107015  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3766  carboxylesterase  71.07 
 
 
279 aa  420  1e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06926  esterase  69.31 
 
 
279 aa  420  1e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000930  S-formylglutathione hydrolase  68.95 
 
 
279 aa  414  9.999999999999999e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4058  carboxylesterase  69.53 
 
 
281 aa  410  1e-114  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.863948  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1838  putative esterase  71.01 
 
 
279 aa  414  1e-114  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.236801 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1787  carboxylesterase  70.29 
 
 
279 aa  410  1e-113  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2190  carboxylesterase  70.29 
 
 
279 aa  409  1e-113  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1368  carboxylesterase  69.53 
 
 
281 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1617  S-formylglutathione hydrolase  67.84 
 
 
284 aa  401  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.117906  normal  0.524398 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2055  esterase, putative  69.2 
 
 
279 aa  401  1e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1559  esterase, putative  69.18 
 
 
281 aa  401  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.41528  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1171  S-formylglutathione hydrolase  68.2 
 
 
284 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.441797 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3027  carboxylesterase  69.89 
 
 
280 aa  402  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000156847 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4058  S-formylglutathione hydrolase  68.2 
 
 
284 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000241575 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4160  S-formylglutathione hydrolase  67.84 
 
 
284 aa  401  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.394545 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1941  S-formylglutathione hydrolase  68.12 
 
 
280 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00373445  normal  0.789535 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1126  putative esterase  66.31 
 
 
281 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2173  carboxylesterase  68.12 
 
 
280 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.116345  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2407  S-formylglutathione hydrolase  68.12 
 
 
280 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2525  S-formylglutathione hydrolase  67.75 
 
 
280 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.81553  normal  0.653671 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0745  putative esterase  68.33 
 
 
280 aa  400  9.999999999999999e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.474716  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2418  S-formylglutathione hydrolase  68.12 
 
 
280 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0051  periplasmic nitrate reductase, large subunit  64.29 
 
 
280 aa  385  1e-106  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.649739 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03627  Carboxylesterase  65.83 
 
 
280 aa  384  1e-106  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38740  S-formylglutathione hydrolase  66.3 
 
 
281 aa  386  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0607  S-formylglutathione hydrolase  65.94 
 
 
282 aa  384  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0003  carboxylesterase  65.48 
 
 
281 aa  385  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000616557 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1511  S-formylglutathione hydrolase  64.03 
 
 
283 aa  375  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2273  carboxylesterase  63.08 
 
 
289 aa  371  1e-102  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17410  putative esterase  64.03 
 
 
283 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3679  S-formylglutathione hydrolase  63.04 
 
 
276 aa  369  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.182564  normal  0.277984 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0986  carboxylesterase  60.57 
 
 
285 aa  367  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1828  carboxylesterase  60.64 
 
 
298 aa  365  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0463121  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2340  S-formylglutathione hydrolase  61.01 
 
 
285 aa  364  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.723017  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2429  S-formylglutathione hydrolase  61.01 
 
 
285 aa  364  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.74612 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2385  S-formylglutathione hydrolase  61.01 
 
 
285 aa  364  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.72074 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2543  S-formylglutathione hydrolase  61.01 
 
 
285 aa  363  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.420997  normal  0.167647 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2433  S-formylglutathione hydrolase  60.65 
 
 
285 aa  362  4e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.511168  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2755  carboxylesterase  61.43 
 
 
278 aa  361  9e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.936506  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2312  S-formylglutathione hydrolase  59.93 
 
 
280 aa  358  6e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.770707  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4239  S-formylglutathione hydrolase  60.66 
 
 
276 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1556  S-formylglutathione hydrolase  58.78 
 
 
280 aa  353  1e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3385  S-formylglutathione hydrolase  63.64 
 
 
276 aa  353  2e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.217643  normal  0.707698 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04413  S-formylglutathione hydrolase  60.36 
 
 
276 aa  352  5e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0105  S-formylglutathione hydrolase  60.65 
 
 
276 aa  351  7e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3406  carboxylesterase  60.51 
 
 
282 aa  350  1e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2412  S-formylglutathione hydrolase  57.25 
 
 
281 aa  350  1e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.246644  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02083  predicted esterase  59.5 
 
 
278 aa  349  3e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.229266  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1504  S-formylglutathione hydrolase  59.5 
 
 
278 aa  349  3e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0638079  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0812  S-formylglutathione hydrolase  59.5 
 
 
278 aa  349  3e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.631287  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2288  S-formylglutathione hydrolase  59.5 
 
 
278 aa  349  3e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1494  S-formylglutathione hydrolase  59.5 
 
 
278 aa  349  3e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.777132 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02042  hypothetical protein  59.5 
 
 
278 aa  349  3e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214105  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2450  S-formylglutathione hydrolase  59.5 
 
 
278 aa  348  6e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3289  S-formylglutathione hydrolase  59.5 
 
 
278 aa  348  7e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.410888  normal  0.795091 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1937  S-formylglutathione hydrolase  59.78 
 
 
280 aa  346  3e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.446926  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2301  S-formylglutathione hydrolase  59.5 
 
 
278 aa  345  3e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.014444 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1666  S-formylglutathione hydrolase  59.42 
 
 
281 aa  345  4e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.37813  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0257  Fis family transcriptional regulator  58.06 
 
 
281 aa  343  2e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2474  S-formylglutathione hydrolase  57.61 
 
 
280 aa  342  4e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2572  S-formylglutathione hydrolase  57.25 
 
 
280 aa  340  2e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3010  S-formylglutathione hydrolase  57.25 
 
 
280 aa  338  5e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00182867  hitchhiker  0.00074389 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4023  carboxylesterase  59.47 
 
 
287 aa  337  9.999999999999999e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.707301 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0458  carboxylesterase  59.5 
 
 
278 aa  336  1.9999999999999998e-91  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0002  carboxylesterase  58.27 
 
 
283 aa  335  5e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0380  S-formylglutathione hydrolase  54.55 
 
 
277 aa  322  5e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0420  S-formylglutathione hydrolase  54.55 
 
 
277 aa  322  6e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0430  S-formylglutathione hydrolase  54.55 
 
 
277 aa  321  7e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0386  S-formylglutathione hydrolase  54.55 
 
 
277 aa  321  9.000000000000001e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.94847  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3270  S-formylglutathione hydrolase  54.55 
 
 
277 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.103024  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00309  predicted esterase  54.55 
 
 
277 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3251  S-formylglutathione hydrolase  54.55 
 
 
277 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00313  hypothetical protein  54.55 
 
 
277 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1087  putative esterase  57.56 
 
 
278 aa  317  1e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0484  S-formylglutathione hydrolase  55.56 
 
 
281 aa  308  9e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.329572  hitchhiker  0.0024188 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0807  carboxylesterase  54.48 
 
 
281 aa  308  9e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0179435  hitchhiker  0.00571706 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0714  S-formylglutathione hydrolase (FghA)  56.07 
 
 
285 aa  306  3e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224272  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2838  carboxylesterase  54.32 
 
 
282 aa  306  3e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.796702  normal  0.149576 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2922  carboxylesterase  54.42 
 
 
285 aa  305  5.0000000000000004e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0052  carboxylesterase  53.99 
 
 
277 aa  305  5.0000000000000004e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3252  S-formylglutathione hydrolase  55 
 
 
283 aa  304  8.000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.499772 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0019  carboxylesterase  53.41 
 
 
279 aa  304  1.0000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0474  S-formylglutathione hydrolase  52.36 
 
 
275 aa  303  2.0000000000000002e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3945  S-formylglutathione hydrolase  53.09 
 
 
276 aa  300  2e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.897116  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2291  S-formylglutathione hydrolase  52.45 
 
 
294 aa  300  2e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3999  carboxylesterase  55.44 
 
 
283 aa  299  4e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.122299  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2801  carboxylesterase  52.1 
 
 
294 aa  298  7e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.234504 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2413  S-formylglutathione hydrolase  53.02 
 
 
290 aa  297  1e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4919  S-formylglutathione hydrolase  51.44 
 
 
278 aa  297  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>