248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3426 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3426  carboxylesterase  100 
 
 		 279 aa  586  1e-166  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0160  esterase, putative  96.42 
 
 		 279 aa  567  1e-161  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.471398  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4226  carboxylesterase  93.53 
 
 		 279 aa  553  1e-156  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0152295 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0376  S-formylglutathione hydrolase  89.25 
 
 		 289 aa  534  1e-151  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0270  S-formylglutathione hydrolase  87.81 
 
 		 279 aa  533  1e-150  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1439  carboxylesterase  80.65 
 
 		 285 aa  489  1e-137  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0819  putative esterase  80.22 
 
 		 283 aa  484  1e-136  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2252  carboxylesterase  79.14 
 
 		 283 aa  482  1e-135  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.493434  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1393  carboxylesterase  75.27 
 
 		 281 aa  449  1e-125  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0228664  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3531  carboxylesterase  73.21 
 
 		 283 aa  440  9.999999999999999e-123  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419783 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1541  carboxylesterase  71.84 
 
 		 278 aa  431  1e-120  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.107015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06926  esterase  70.04 
 
 		 279 aa  425  1e-118  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000930  S-formylglutathione hydrolase  70.04 
 
 		 279 aa  420  1e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3766  carboxylesterase  70.71 
 
 		 279 aa  420  1e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1838  putative esterase  71.74 
 
 		 279 aa  419  1e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.236801 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1787  carboxylesterase  71.01 
 
 		 279 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2190  carboxylesterase  71.01 
 
 		 279 aa  414  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4058  carboxylesterase  69.89 
 
 		 281 aa  412  1e-114  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.863948  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2055  esterase, putative  69.57 
 
 		 279 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2173  carboxylesterase  68.84 
 
 		 280 aa  404  1.0000000000000001e-112  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.116345  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2407  S-formylglutathione hydrolase  68.84 
 
 		 280 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3027  carboxylesterase  69.89 
 
 		 280 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000156847 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2418  S-formylglutathione hydrolase  68.84 
 
 		 280 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1941  S-formylglutathione hydrolase  68.84 
 
 		 280 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00373445  normal  0.789535 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2525  S-formylglutathione hydrolase  68.48 
 
 		 280 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.81553  normal  0.653671 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1368  carboxylesterase  68.46 
 
 		 281 aa  403  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0745  putative esterase  68.33 
 
 		 280 aa  402  1e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.474716  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1617  S-formylglutathione hydrolase  66.78 
 
 		 284 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.117906  normal  0.524398 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1559  esterase, putative  67.74 
 
 		 281 aa  397  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.41528  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1171  S-formylglutathione hydrolase  67.14 
 
 		 284 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.441797 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1126  putative esterase  65.59 
 
 		 281 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4058  S-formylglutathione hydrolase  67.14 
 
 		 284 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000241575 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4160  S-formylglutathione hydrolase  66.78 
 
 		 284 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.394545 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0607  S-formylglutathione hydrolase  66.3 
 
 		 282 aa  391  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38740  S-formylglutathione hydrolase  65.94 
 
 		 281 aa  388  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03627  Carboxylesterase  66.19 
 
 		 280 aa  388  1e-107  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0003  carboxylesterase  66.19 
 
 		 281 aa  387  1e-107  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000616557 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0051  periplasmic nitrate reductase, large subunit  64.64 
 
 		 280 aa  384  1e-106  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.649739 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1828  carboxylesterase  62.41 
 
 		 298 aa  375  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0463121  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17410  putative esterase  63.67 
 
 		 283 aa  375  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1511  S-formylglutathione hydrolase  63.67 
 
 		 283 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2273  carboxylesterase  63.44 
 
 		 289 aa  373  1e-102  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3679  S-formylglutathione hydrolase  63.04 
 
 		 276 aa  373  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.182564  normal  0.277984 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0986  carboxylesterase  60.22 
 
 		 285 aa  365  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2340  S-formylglutathione hydrolase  60.65 
 
 		 285 aa  363  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.723017  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2429  S-formylglutathione hydrolase  60.65 
 
 		 285 aa  363  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.74612 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2385  S-formylglutathione hydrolase  60.65 
 
 		 285 aa  363  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.72074 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2543  S-formylglutathione hydrolase  60.65 
 
 		 285 aa  362  3e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.420997  normal  0.167647 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2433  S-formylglutathione hydrolase  60.29 
 
 		 285 aa  361  6e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.511168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2755  carboxylesterase  61.07 
 
 		 278 aa  360  1e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.936506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4239  S-formylglutathione hydrolase  61.03 
 
 		 276 aa  359  3e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2312  S-formylglutathione hydrolase  59.21 
 
 		 280 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.770707  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2412  S-formylglutathione hydrolase  57.25 
 
 		 281 aa  354  6.999999999999999e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.246644  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0105  S-formylglutathione hydrolase  61.01 
 
 		 276 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04413  S-formylglutathione hydrolase  60.36 
 
 		 276 aa  354  8.999999999999999e-97  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3385  S-formylglutathione hydrolase  63.64 
 
 		 276 aa  354  1e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.217643  normal  0.707698 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3406  carboxylesterase  60.51 
 
 		 282 aa  353  2e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1556  S-formylglutathione hydrolase  57.71 
 
 		 280 aa  350  1e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02083  predicted esterase  59.14 
 
 		 278 aa  350  2e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.229266  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1504  S-formylglutathione hydrolase  59.14 
 
 		 278 aa  350  2e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0638079  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02042  hypothetical protein  59.14 
 
 		 278 aa  350  2e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214105  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0812  S-formylglutathione hydrolase  59.14 
 
 		 278 aa  350  2e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.631287  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2288  S-formylglutathione hydrolase  59.14 
 
 		 278 aa  350  2e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1494  S-formylglutathione hydrolase  59.14 
 
 		 278 aa  350  2e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.777132 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3289  S-formylglutathione hydrolase  59.14 
 
 		 278 aa  349  3e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.410888  normal  0.795091 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2450  S-formylglutathione hydrolase  59.14 
 
 		 278 aa  349  4e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1937  S-formylglutathione hydrolase  59.78 
 
 		 280 aa  347  1e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.446926  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1666  S-formylglutathione hydrolase  59.42 
 
 		 281 aa  347  1e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.37813  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0257  Fis family transcriptional regulator  58.06 
 
 		 281 aa  347  2e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2301  S-formylglutathione hydrolase  59.14 
 
 		 278 aa  346  2e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.014444 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2474  S-formylglutathione hydrolase  57.61 
 
 		 280 aa  345  5e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2572  S-formylglutathione hydrolase  57.25 
 
 		 280 aa  342  2.9999999999999997e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3010  S-formylglutathione hydrolase  57.25 
 
 		 280 aa  341  7e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00182867  hitchhiker  0.00074389 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0458  carboxylesterase  59.5 
 
 		 278 aa  340  1e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0002  carboxylesterase  58.27 
 
 		 283 aa  336  2.9999999999999997e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4023  carboxylesterase  58.71 
 
 		 287 aa  334  7.999999999999999e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.707301 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0380  S-formylglutathione hydrolase  54.55 
 
 		 277 aa  323  2e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0420  S-formylglutathione hydrolase  54.55 
 
 		 277 aa  323  2e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0430  S-formylglutathione hydrolase  54.55 
 
 		 277 aa  323  2e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0386  S-formylglutathione hydrolase  54.55 
 
 		 277 aa  322  3e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.94847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3270  S-formylglutathione hydrolase  54.55 
 
 		 277 aa  321  8e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.103024  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00309  predicted esterase  54.55 
 
 		 277 aa  321  8e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3251  S-formylglutathione hydrolase  54.55 
 
 		 277 aa  321  8e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00313  hypothetical protein  54.55 
 
 		 277 aa  321  8e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1087  putative esterase  57.56 
 
 		 278 aa  318  6e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0484  S-formylglutathione hydrolase  55.2 
 
 		 281 aa  310  2e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.329572  hitchhiker  0.0024188 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0807  carboxylesterase  54.12 
 
 		 281 aa  309  2.9999999999999997e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0179435  hitchhiker  0.00571706 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0714  S-formylglutathione hydrolase (FghA)  55.71 
 
 		 285 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0019  carboxylesterase  54.48 
 
 		 279 aa  307  1.0000000000000001e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0474  S-formylglutathione hydrolase  53.09 
 
 		 275 aa  306  2.0000000000000002e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2838  carboxylesterase  54.32 
 
 		 282 aa  306  2.0000000000000002e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.796702  normal  0.149576 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0052  carboxylesterase  53.99 
 
 		 277 aa  306  3e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3252  S-formylglutathione hydrolase  54.64 
 
 		 283 aa  306  3e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.499772 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3945  S-formylglutathione hydrolase  53.45 
 
 		 276 aa  302  4.0000000000000003e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.897116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2291  S-formylglutathione hydrolase  52.1 
 
 		 294 aa  302  4.0000000000000003e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3448  carboxylesterase  53.07 
 
 		 281 aa  301  8.000000000000001e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.775669 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0756  S-formylglutathione hydrolase  56.78 
 
 		 282 aa  301  1e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.135614 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2922  carboxylesterase  53.36 
 
 		 285 aa  301  1e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2801  carboxylesterase  51.75 
 
 		 294 aa  300  1e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.234504 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3999  carboxylesterase  54.42 
 
 		 283 aa  300  2e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.122299  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>