195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3448 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008043  TM1040_3448  carboxylesterase  100 
 
 		 281 aa  590  1e-167  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.775669 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0052  carboxylesterase  76.73 
 
 		 277 aa  458  9.999999999999999e-129  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0852  S-formylglutathione hydrolase  69.09 
 
 		 276 aa  417  1e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0397354  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2511  carboxylesterase  69.45 
 
 		 276 aa  418  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.863748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0019  carboxylesterase  68.35 
 
 		 279 aa  415  9.999999999999999e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3123  carboxylesterase  68.36 
 
 		 276 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00154101 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0474  S-formylglutathione hydrolase  63.14 
 
 		 275 aa  376  1e-103  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3945  S-formylglutathione hydrolase  62.41 
 
 		 276 aa  362  3e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.897116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1177  S-formylglutathione hydrolase  55.87 
 
 		 292 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1541  carboxylesterase  52.71 
 
 		 278 aa  311  5.999999999999999e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.107015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0141  S-formylglutathione hydrolase  55.04 
 
 		 293 aa  311  1e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0333539  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2922  carboxylesterase  57.09 
 
 		 285 aa  309  2.9999999999999997e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2312  S-formylglutathione hydrolase  54.29 
 
 		 280 aa  306  2.0000000000000002e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.770707  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2252  carboxylesterase  54.15 
 
 		 283 aa  306  3e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.493434  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0002  carboxylesterase  54.51 
 
 		 283 aa  306  3e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0819  putative esterase  53.24 
 
 		 283 aa  305  6e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2412  S-formylglutathione hydrolase  53.41 
 
 		 281 aa  303  2.0000000000000002e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.246644  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2474  S-formylglutathione hydrolase  54.12 
 
 		 280 aa  303  3.0000000000000004e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2433  S-formylglutathione hydrolase  53.93 
 
 		 285 aa  302  4.0000000000000003e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.511168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0270  S-formylglutathione hydrolase  53.05 
 
 		 279 aa  302  4.0000000000000003e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1937  S-formylglutathione hydrolase  54.29 
 
 		 280 aa  301  8.000000000000001e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.446926  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3426  carboxylesterase  53.07 
 
 		 279 aa  301  9e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0376  S-formylglutathione hydrolase  52.33 
 
 		 289 aa  300  1e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1834  carboxylesterase  53.76 
 
 		 282 aa  300  1e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.018763  normal  0.805615 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2340  S-formylglutathione hydrolase  53.57 
 
 		 285 aa  300  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.723017  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2429  S-formylglutathione hydrolase  53.57 
 
 		 285 aa  300  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.74612 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2543  S-formylglutathione hydrolase  53.57 
 
 		 285 aa  300  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.420997  normal  0.167647 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2385  S-formylglutathione hydrolase  53.57 
 
 		 285 aa  300  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.72074 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04413  S-formylglutathione hydrolase  52 
 
 		 276 aa  300  2e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2055  esterase, putative  52 
 
 		 279 aa  299  4e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2525  S-formylglutathione hydrolase  52.36 
 
 		 280 aa  298  5e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.81553  normal  0.653671 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1556  S-formylglutathione hydrolase  53.74 
 
 		 280 aa  298  5e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2572  S-formylglutathione hydrolase  53.41 
 
 		 280 aa  298  6e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5942  S-formylglutathione hydrolase  52.14 
 
 		 281 aa  298  6e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.183278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000930  S-formylglutathione hydrolase  50.36 
 
 		 279 aa  298  6e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3010  S-formylglutathione hydrolase  53.41 
 
 		 280 aa  298  8e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00182867  hitchhiker  0.00074389 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1838  putative esterase  51.64 
 
 		 279 aa  298  9e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.236801 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03627  Carboxylesterase  52.36 
 
 		 280 aa  298  1e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2418  S-formylglutathione hydrolase  52 
 
 		 280 aa  297  1e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0105  S-formylglutathione hydrolase  50.9 
 
 		 276 aa  297  1e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1941  S-formylglutathione hydrolase  52 
 
 		 280 aa  297  1e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00373445  normal  0.789535 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0160  esterase, putative  52.35 
 
 		 279 aa  297  2e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.471398  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0099  carboxylesterase  52.52 
 
 		 281 aa  297  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0807  carboxylesterase  53.26 
 
 		 281 aa  297  2e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0179435  hitchhiker  0.00571706 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2452  S-formylglutathione hydrolase  52.69 
 
 		 279 aa  296  3e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.243797  normal  0.206976 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1787  carboxylesterase  51.27 
 
 		 279 aa  296  3e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2190  carboxylesterase  51.27 
 
 		 279 aa  296  3e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06926  esterase  50.36 
 
 		 279 aa  296  3e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1666  S-formylglutathione hydrolase  53.55 
 
 		 281 aa  296  3e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.37813  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2173  carboxylesterase  52 
 
 		 280 aa  295  5e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.116345  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0986  carboxylesterase  51.24 
 
 		 285 aa  295  6e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3027  carboxylesterase  53.76 
 
 		 280 aa  295  7e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000156847 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2273  carboxylesterase  54.29 
 
 		 289 aa  294  9e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0458  carboxylesterase  53.79 
 
 		 278 aa  294  1e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2407  S-formylglutathione hydrolase  51.64 
 
 		 280 aa  294  1e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4226  carboxylesterase  51.62 
 
 		 279 aa  292  5e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0152295 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1393  carboxylesterase  53.05 
 
 		 281 aa  291  1e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0228664  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1439  carboxylesterase  51.25 
 
 		 285 aa  290  2e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4058  carboxylesterase  50 
 
 		 281 aa  290  2e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.863948  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2755  carboxylesterase  51.25 
 
 		 278 aa  289  3e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.936506  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02083  predicted esterase  53.05 
 
 		 278 aa  289  4e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.229266  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1504  S-formylglutathione hydrolase  53.05 
 
 		 278 aa  289  4e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0638079  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0812  S-formylglutathione hydrolase  53.05 
 
 		 278 aa  289  4e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.631287  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02042  hypothetical protein  53.05 
 
 		 278 aa  289  4e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214105  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2288  S-formylglutathione hydrolase  53.05 
 
 		 278 aa  289  4e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1494  S-formylglutathione hydrolase  53.05 
 
 		 278 aa  289  4e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.777132 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4239  S-formylglutathione hydrolase  50.36 
 
 		 276 aa  288  6e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0607  S-formylglutathione hydrolase  50.89 
 
 		 282 aa  287  1e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3766  carboxylesterase  50 
 
 		 279 aa  287  1e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3289  S-formylglutathione hydrolase  53.05 
 
 		 278 aa  288  1e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.410888  normal  0.795091 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2450  S-formylglutathione hydrolase  52.69 
 
 		 278 aa  287  1e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1087  putative esterase  47.83 
 
 		 278 aa  286  2e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1087  S-formylglutathione hydrolase  48.92 
 
 		 283 aa  286  2e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1116  S-formylglutathione hydrolase  48.92 
 
 		 283 aa  286  2e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.714854  normal  0.85145 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3406  carboxylesterase  52.54 
 
 		 282 aa  285  7e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2301  S-formylglutathione hydrolase  52.69 
 
 		 278 aa  284  9e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.014444 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3531  carboxylesterase  49.82 
 
 		 283 aa  284  9e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419783 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1828  carboxylesterase  50.35 
 
 		 298 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0463121  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0003  carboxylesterase  50.7 
 
 		 281 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000616557 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0051  periplasmic nitrate reductase, large subunit  52.17 
 
 		 280 aa  283  3.0000000000000004e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.649739 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1021  S-formylglutathione hydrolase  50 
 
 		 277 aa  280  1e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.444109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0756  S-formylglutathione hydrolase  48.94 
 
 		 282 aa  280  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.135614 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4831  S-formylglutathione hydrolase  50 
 
 		 278 aa  280  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.256219 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1617  S-formylglutathione hydrolase  51.94 
 
 		 284 aa  279  4e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.117906  normal  0.524398 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4160  S-formylglutathione hydrolase  51.94 
 
 		 284 aa  279  4e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.394545 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1368  carboxylesterase  50.72 
 
 		 281 aa  279  5e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2510  S-formylglutathione hydrolase  49.08 
 
 		 273 aa  278  9e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.566414  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38740  S-formylglutathione hydrolase  50.18 
 
 		 281 aa  277  1e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3385  S-formylglutathione hydrolase  50.75 
 
 		 276 aa  278  1e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.217643  normal  0.707698 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1559  esterase, putative  50.36 
 
 		 281 aa  277  2e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.41528  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1171  S-formylglutathione hydrolase  51.24 
 
 		 284 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.441797 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1511  S-formylglutathione hydrolase  48.94 
 
 		 283 aa  276  3e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4919  S-formylglutathione hydrolase  47.83 
 
 		 278 aa  275  4e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0257  Fis family transcriptional regulator  49.1 
 
 		 281 aa  275  5e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4023  carboxylesterase  51.67 
 
 		 287 aa  274  9e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.707301 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17410  putative esterase  48.94 
 
 		 283 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0127  esterase, putative  53.82 
 
 		 251 aa  273  2.0000000000000002e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2838  carboxylesterase  45.23 
 
 		 282 aa  273  2.0000000000000002e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.796702  normal  0.149576 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4058  S-formylglutathione hydrolase  50.18 
 
 		 284 aa  271  7e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000241575 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1126  putative esterase  49.1 
 
 		 281 aa  271  7e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>