246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1666 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1666  S-formylglutathione hydrolase  100 
 
 		 281 aa  586  1e-166  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.37813  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1937  S-formylglutathione hydrolase  94.98 
 
 		 280 aa  535  1e-151  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.446926  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1556  S-formylglutathione hydrolase  79.64 
 
 		 280 aa  452  1.0000000000000001e-126  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2474  S-formylglutathione hydrolase  80.22 
 
 		 280 aa  451  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3010  S-formylglutathione hydrolase  79.5 
 
 		 280 aa  446  1.0000000000000001e-124  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00182867  hitchhiker  0.00074389 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2572  S-formylglutathione hydrolase  79.5 
 
 		 280 aa  447  1.0000000000000001e-124  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2412  S-formylglutathione hydrolase  74.1 
 
 		 281 aa  442  1e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.246644  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2340  S-formylglutathione hydrolase  73.48 
 
 		 285 aa  441  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.723017  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2429  S-formylglutathione hydrolase  73.48 
 
 		 285 aa  441  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.74612 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2385  S-formylglutathione hydrolase  73.48 
 
 		 285 aa  441  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.72074 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2543  S-formylglutathione hydrolase  73.48 
 
 		 285 aa  441  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.420997  normal  0.167647 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2433  S-formylglutathione hydrolase  73.12 
 
 		 285 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.511168  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2312  S-formylglutathione hydrolase  72.04 
 
 		 280 aa  420  1e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.770707  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2755  carboxylesterase  70.5 
 
 		 278 aa  414  1e-114  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.936506  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02083  predicted esterase  71.58 
 
 		 278 aa  409  1e-113  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.229266  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1504  S-formylglutathione hydrolase  71.58 
 
 		 278 aa  409  1e-113  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0638079  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02042  hypothetical protein  71.58 
 
 		 278 aa  409  1e-113  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214105  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1494  S-formylglutathione hydrolase  71.58 
 
 		 278 aa  409  1e-113  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.777132 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0812  S-formylglutathione hydrolase  71.58 
 
 		 278 aa  409  1e-113  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.631287  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2288  S-formylglutathione hydrolase  71.58 
 
 		 278 aa  409  1e-113  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3289  S-formylglutathione hydrolase  71.58 
 
 		 278 aa  407  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.410888  normal  0.795091 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2301  S-formylglutathione hydrolase  71.22 
 
 		 278 aa  404  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.014444 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2450  S-formylglutathione hydrolase  71.22 
 
 		 278 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0986  carboxylesterase  61.29 
 
 		 285 aa  376  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1828  carboxylesterase  61.62 
 
 		 298 aa  367  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0463121  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1541  carboxylesterase  58.48 
 
 		 278 aa  366  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.107015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0270  S-formylglutathione hydrolase  60.07 
 
 		 279 aa  365  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1511  S-formylglutathione hydrolase  63.35 
 
 		 283 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17410  putative esterase  63.35 
 
 		 283 aa  365  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4058  carboxylesterase  60.65 
 
 		 281 aa  362  3e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.863948  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3531  carboxylesterase  60 
 
 		 283 aa  360  1e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419783 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000930  S-formylglutathione hydrolase  59.93 
 
 		 279 aa  360  2e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06926  esterase  60.29 
 
 		 279 aa  358  7e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3426  carboxylesterase  59.78 
 
 		 279 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1787  carboxylesterase  59.57 
 
 		 279 aa  355  2.9999999999999997e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1838  putative esterase  59.57 
 
 		 279 aa  355  2.9999999999999997e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.236801 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2252  carboxylesterase  60.51 
 
 		 283 aa  356  2.9999999999999997e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.493434  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2055  esterase, putative  59.21 
 
 		 279 aa  355  5e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0607  S-formylglutathione hydrolase  58.93 
 
 		 282 aa  355  5e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2190  carboxylesterase  59.57 
 
 		 279 aa  355  5e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4226  carboxylesterase  60.14 
 
 		 279 aa  355  5.999999999999999e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0152295 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0160  esterase, putative  59.78 
 
 		 279 aa  354  6.999999999999999e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.471398  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3027  carboxylesterase  60.79 
 
 		 280 aa  355  6.999999999999999e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000156847 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1439  carboxylesterase  59.06 
 
 		 285 aa  353  2e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0819  putative esterase  58.55 
 
 		 283 aa  352  4e-96  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3766  carboxylesterase  58.12 
 
 		 279 aa  352  4e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2418  S-formylglutathione hydrolase  58.12 
 
 		 280 aa  352  4e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2525  S-formylglutathione hydrolase  57.76 
 
 		 280 aa  350  1e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.81553  normal  0.653671 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1941  S-formylglutathione hydrolase  58.12 
 
 		 280 aa  350  1e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00373445  normal  0.789535 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0458  carboxylesterase  63.41 
 
 		 278 aa  350  1e-95  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04413  S-formylglutathione hydrolase  58.03 
 
 		 276 aa  350  2e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2407  S-formylglutathione hydrolase  57.76 
 
 		 280 aa  350  2e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0003  carboxylesterase  58.12 
 
 		 281 aa  350  2e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000616557 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0376  S-formylglutathione hydrolase  58.7 
 
 		 289 aa  348  6e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2273  carboxylesterase  59.14 
 
 		 289 aa  348  6e-95  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3406  carboxylesterase  58.51 
 
 		 282 aa  347  1e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2173  carboxylesterase  57.76 
 
 		 280 aa  347  1e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.116345  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38740  S-formylglutathione hydrolase  61.45 
 
 		 281 aa  345  5e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1126  putative esterase  58.99 
 
 		 281 aa  343  1e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1393  carboxylesterase  57.91 
 
 		 281 aa  341  8e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0228664  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03627  Carboxylesterase  58.12 
 
 		 280 aa  340  1e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0105  S-formylglutathione hydrolase  57.66 
 
 		 276 aa  338  4e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1368  carboxylesterase  58.48 
 
 		 281 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0386  S-formylglutathione hydrolase  55.47 
 
 		 277 aa  336  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.94847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0380  S-formylglutathione hydrolase  55.47 
 
 		 277 aa  336  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3385  S-formylglutathione hydrolase  59.7 
 
 		 276 aa  335  3.9999999999999995e-91  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.217643  normal  0.707698 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0420  S-formylglutathione hydrolase  55.11 
 
 		 277 aa  334  1e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3679  S-formylglutathione hydrolase  56.73 
 
 		 276 aa  334  1e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.182564  normal  0.277984 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4239  S-formylglutathione hydrolase  56.36 
 
 		 276 aa  332  4e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0051  periplasmic nitrate reductase, large subunit  57.45 
 
 		 280 aa  332  5e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.649739 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4023  carboxylesterase  57.46 
 
 		 287 aa  332  5e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.707301 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3251  S-formylglutathione hydrolase  54.38 
 
 		 277 aa  331  9e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00309  predicted esterase  54.38 
 
 		 277 aa  331  1e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00313  hypothetical protein  54.38 
 
 		 277 aa  331  1e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3270  S-formylglutathione hydrolase  54.38 
 
 		 277 aa  331  1e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.103024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0430  S-formylglutathione hydrolase  54.38 
 
 		 277 aa  330  2e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1559  esterase, putative  57.04 
 
 		 281 aa  328  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.41528  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1171  S-formylglutathione hydrolase  58.12 
 
 		 284 aa  326  3e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.441797 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1617  S-formylglutathione hydrolase  57.76 
 
 		 284 aa  325  5e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.117906  normal  0.524398 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4160  S-formylglutathione hydrolase  57.76 
 
 		 284 aa  325  5e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.394545 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3945  S-formylglutathione hydrolase  57.3 
 
 		 276 aa  322  5e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.897116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4058  S-formylglutathione hydrolase  56.68 
 
 		 284 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000241575 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0745  putative esterase  54.32 
 
 		 280 aa  320  1.9999999999999998e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.474716  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0257  Fis family transcriptional regulator  53.96 
 
 		 281 aa  313  9.999999999999999e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3448  carboxylesterase  53.55 
 
 		 281 aa  308  5.9999999999999995e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.775669 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0052  carboxylesterase  54.35 
 
 		 277 aa  306  3e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1177  S-formylglutathione hydrolase  53.02 
 
 		 292 aa  304  1.0000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0807  carboxylesterase  55.26 
 
 		 281 aa  301  7.000000000000001e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0179435  hitchhiker  0.00571706 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1087  S-formylglutathione hydrolase  51.96 
 
 		 283 aa  300  1e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1116  S-formylglutathione hydrolase  51.96 
 
 		 283 aa  300  1e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.714854  normal  0.85145 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0002  carboxylesterase  54.06 
 
 		 283 aa  300  1e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0019  carboxylesterase  53.05 
 
 		 279 aa  300  2e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0756  S-formylglutathione hydrolase  53.07 
 
 		 282 aa  299  3e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.135614 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3252  S-formylglutathione hydrolase  53.02 
 
 		 283 aa  298  6e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.499772 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0269  S-formylglutathione hydrolase  56.02 
 
 		 251 aa  297  2e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0714  S-formylglutathione hydrolase (FghA)  53.74 
 
 		 285 aa  296  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0474  S-formylglutathione hydrolase  53.28 
 
 		 275 aa  296  3e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1087  putative esterase  52.73 
 
 		 278 aa  295  6e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2838  carboxylesterase  50.53 
 
 		 282 aa  295  7e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.796702  normal  0.149576 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0122  carboxylesterase  54.26 
 
 		 288 aa  294  1e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>