233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0099 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0099  carboxylesterase  100 
 
 		 281 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5942  S-formylglutathione hydrolase  80.65 
 
 		 281 aa  467  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.183278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1177  S-formylglutathione hydrolase  75.71 
 
 		 292 aa  433  1e-120  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2922  carboxylesterase  73.5 
 
 		 285 aa  424  1e-118  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1834  carboxylesterase  66.9 
 
 		 282 aa  388  1e-107  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.018763  normal  0.805615 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4831  S-formylglutathione hydrolase  62.82 
 
 		 278 aa  359  4e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.256219 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0141  S-formylglutathione hydrolase  59.79 
 
 		 293 aa  358  6e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0333539  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4919  S-formylglutathione hydrolase  61.01 
 
 		 278 aa  352  4e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1021  S-formylglutathione hydrolase  61.37 
 
 		 277 aa  351  7e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.444109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2510  S-formylglutathione hydrolase  60.95 
 
 		 273 aa  342  2.9999999999999997e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.566414  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0127  esterase, putative  63.1 
 
 		 251 aa  336  2.9999999999999997e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0002  carboxylesterase  58.78 
 
 		 283 aa  332  3e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0122  S-formylglutathione hydrolase  62.7 
 
 		 251 aa  333  3e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16316  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1617  S-formylglutathione hydrolase  56.38 
 
 		 284 aa  316  2e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.117906  normal  0.524398 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4160  S-formylglutathione hydrolase  56.38 
 
 		 284 aa  316  2e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.394545 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3406  carboxylesterase  57.97 
 
 		 282 aa  316  3e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0607  S-formylglutathione hydrolase  56.32 
 
 		 282 aa  315  6e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1126  putative esterase  55.32 
 
 		 281 aa  314  8e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1171  S-formylglutathione hydrolase  56.38 
 
 		 284 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.441797 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0051  periplasmic nitrate reductase, large subunit  55.16 
 
 		 280 aa  314  9.999999999999999e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.649739 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4058  S-formylglutathione hydrolase  55.67 
 
 		 284 aa  312  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000241575 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0807  carboxylesterase  54.84 
 
 		 281 aa  306  2.0000000000000002e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0179435  hitchhiker  0.00571706 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1559  esterase, putative  53.9 
 
 		 281 aa  301  1e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.41528  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4058  carboxylesterase  49.82 
 
 		 281 aa  301  1e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.863948  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3027  carboxylesterase  55 
 
 		 280 aa  300  2e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000156847 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1511  S-formylglutathione hydrolase  53.76 
 
 		 283 aa  300  2e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3766  carboxylesterase  49.82 
 
 		 279 aa  299  4e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1368  carboxylesterase  53.9 
 
 		 281 aa  298  5e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38740  S-formylglutathione hydrolase  55.36 
 
 		 281 aa  298  5e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17410  putative esterase  53.93 
 
 		 283 aa  298  5e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2452  S-formylglutathione hydrolase  53.55 
 
 		 279 aa  298  6e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.243797  normal  0.206976 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04413  S-formylglutathione hydrolase  55.4 
 
 		 276 aa  298  9e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0694  S-formylglutathione hydrolase  54.64 
 
 		 282 aa  297  1e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.816955 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0019  carboxylesterase  51.25 
 
 		 279 aa  297  1e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3448  carboxylesterase  52.52 
 
 		 281 aa  297  2e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.775669 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0003  carboxylesterase  52 
 
 		 281 aa  296  2e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000616557 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1026  S-formylglutathione hydrolase  53.96 
 
 		 286 aa  296  3e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.199417  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2651  carboxylesterase  55.36 
 
 		 282 aa  296  3e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0863  S-formylglutathione hydrolase  53.96 
 
 		 286 aa  296  3e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0867  S-formylglutathione hydrolase  53.96 
 
 		 286 aa  296  3e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2496  S-formylglutathione hydrolase  55.84 
 
 		 280 aa  296  4e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.881177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2524  S-formylglutathione hydrolase  55.36 
 
 		 282 aa  295  4e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.225567  normal  0.138843 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0986  carboxylesterase  51.44 
 
 		 285 aa  295  6e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0325  esterase, putative  53.6 
 
 		 286 aa  294  9e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.559374  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0071  putative esterase  53.6 
 
 		 286 aa  294  9e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0623  putative esterase  53.6 
 
 		 286 aa  294  9e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.778268  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2457  putative esterase  53.6 
 
 		 286 aa  294  9e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1229  carboxylesterase  54.81 
 
 		 286 aa  293  2e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.335856 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5934  carboxylesterase  55.23 
 
 		 282 aa  293  3e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.304704  normal  0.802561 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1993  carboxylesterase  55 
 
 		 282 aa  292  4e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2603  carboxylesterase  55 
 
 		 282 aa  292  4e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2627  S-formylglutathione hydrolase  54.64 
 
 		 282 aa  291  7e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3252  S-formylglutathione hydrolase  52.67 
 
 		 283 aa  291  1e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.499772 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3515  S-formylglutathione hydrolase  53.6 
 
 		 278 aa  290  1e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4785  S-formylglutathione hydrolase  54.77 
 
 		 282 aa  289  3e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0295503  normal  0.699592 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1941  S-formylglutathione hydrolase  47.86 
 
 		 280 aa  289  4e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00373445  normal  0.789535 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3679  S-formylglutathione hydrolase  50.36 
 
 		 276 aa  288  5.0000000000000004e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.182564  normal  0.277984 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0714  S-formylglutathione hydrolase (FghA)  52.31 
 
 		 285 aa  288  6e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0052  carboxylesterase  52.35 
 
 		 277 aa  288  7e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1838  putative esterase  48.21 
 
 		 279 aa  288  7e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.236801 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0745  putative esterase  48.94 
 
 		 280 aa  287  1e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.474716  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3999  carboxylesterase  54.23 
 
 		 283 aa  287  1e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.122299  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2525  S-formylglutathione hydrolase  47.86 
 
 		 280 aa  287  1e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.81553  normal  0.653671 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2413  S-formylglutathione hydrolase  55.28 
 
 		 290 aa  287  1e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0105  S-formylglutathione hydrolase  51.44 
 
 		 276 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0484  S-formylglutathione hydrolase  51.25 
 
 		 281 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.329572  hitchhiker  0.0024188 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2418  S-formylglutathione hydrolase  47.5 
 
 		 280 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1787  carboxylesterase  48.21 
 
 		 279 aa  285  4e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2412  S-formylglutathione hydrolase  52.14 
 
 		 281 aa  285  4e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.246644  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1087  putative esterase  49.45 
 
 		 278 aa  285  5e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2190  carboxylesterase  48.21 
 
 		 279 aa  285  5.999999999999999e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1937  S-formylglutathione hydrolase  53.6 
 
 		 280 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.446926  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0270  S-formylglutathione hydrolase  49.29 
 
 		 279 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2055  esterase, putative  47.5 
 
 		 279 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0687  esterase, putative  52.71 
 
 		 282 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4239  S-formylglutathione hydrolase  51.25 
 
 		 276 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2407  S-formylglutathione hydrolase  47.14 
 
 		 280 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2312  S-formylglutathione hydrolase  51.96 
 
 		 280 aa  282  4.0000000000000003e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.770707  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3123  carboxylesterase  50.54 
 
 		 276 aa  282  4.0000000000000003e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00154101 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2173  carboxylesterase  47.14 
 
 		 280 aa  282  4.0000000000000003e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.116345  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0756  S-formylglutathione hydrolase  51.31 
 
 		 282 aa  281  7.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.135614 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0852  S-formylglutathione hydrolase  50.18 
 
 		 276 aa  280  1e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0397354  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1541  carboxylesterase  50.18 
 
 		 278 aa  280  1e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.107015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2511  carboxylesterase  50.54 
 
 		 276 aa  280  1e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.863748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0458  carboxylesterase  54.68 
 
 		 278 aa  280  2e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1666  S-formylglutathione hydrolase  52.88 
 
 		 281 aa  279  3e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.37813  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2291  S-formylglutathione hydrolase  51.75 
 
 		 294 aa  279  4e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1393  carboxylesterase  47.87 
 
 		 281 aa  279  4e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0228664  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2801  carboxylesterase  51.75 
 
 		 294 aa  278  5e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.234504 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03627  Carboxylesterase  48.2 
 
 		 280 aa  278  6e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2433  S-formylglutathione hydrolase  50.53 
 
 		 285 aa  278  6e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.511168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0122  carboxylesterase  53.21 
 
 		 288 aa  278  9e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4023  carboxylesterase  54.31 
 
 		 287 aa  278  9e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.707301 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2385  S-formylglutathione hydrolase  50.53 
 
 		 285 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.72074 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2429  S-formylglutathione hydrolase  50.53 
 
 		 285 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.74612 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2340  S-formylglutathione hydrolase  50.53 
 
 		 285 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.723017  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2543  S-formylglutathione hydrolase  50.53 
 
 		 285 aa  277  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.420997  normal  0.167647 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0080  S-formylglutathione hydrolase  53.55 
 
 		 282 aa  276  2e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0827434  hitchhiker  0.00557282 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1556  S-formylglutathione hydrolase  51.97 
 
 		 280 aa  276  3e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0698  S-formylglutathione hydrolase  51.8 
 
 		 284 aa  276  4e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.380863  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>