214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2452 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_2452  S-formylglutathione hydrolase  100 
 
 
279 aa  577  1e-164  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.243797  normal  0.206976 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3515  S-formylglutathione hydrolase  64.49 
 
 
278 aa  377  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0002  carboxylesterase  59.29 
 
 
283 aa  333  2e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0694  S-formylglutathione hydrolase  57.71 
 
 
282 aa  330  1e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.816955 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2801  carboxylesterase  57.89 
 
 
294 aa  331  1e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.234504 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2291  S-formylglutathione hydrolase  57.54 
 
 
294 aa  328  4e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5934  carboxylesterase  57.5 
 
 
282 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.304704  normal  0.802561 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1993  carboxylesterase  57.5 
 
 
282 aa  325  7e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2603  carboxylesterase  57.5 
 
 
282 aa  325  7e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2627  S-formylglutathione hydrolase  57.14 
 
 
282 aa  324  8.000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2651  carboxylesterase  56.79 
 
 
282 aa  323  2e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2524  S-formylglutathione hydrolase  56.79 
 
 
282 aa  323  3e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.225567  normal  0.138843 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1229  carboxylesterase  56.79 
 
 
286 aa  323  3e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.335856 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0714  S-formylglutathione hydrolase (FghA)  57.3 
 
 
285 aa  319  3e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224272  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0484  S-formylglutathione hydrolase  56.79 
 
 
281 aa  317  1e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.329572  hitchhiker  0.0024188 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0687  esterase, putative  55.91 
 
 
282 aa  317  2e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3999  carboxylesterase  55.83 
 
 
283 aa  316  3e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.122299  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1026  S-formylglutathione hydrolase  56.43 
 
 
286 aa  315  4e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.199417  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0863  S-formylglutathione hydrolase  56.43 
 
 
286 aa  315  4e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0867  S-formylglutathione hydrolase  56.43 
 
 
286 aa  315  4e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0122  carboxylesterase  57.71 
 
 
288 aa  314  9e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0325  esterase, putative  56.07 
 
 
286 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.559374  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0623  putative esterase  56.07 
 
 
286 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.778268  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2457  putative esterase  56.07 
 
 
286 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0071  putative esterase  56.07 
 
 
286 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0807  carboxylesterase  55.71 
 
 
281 aa  313  1.9999999999999998e-84  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0179435  hitchhiker  0.00571706 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3252  S-formylglutathione hydrolase  55.87 
 
 
283 aa  311  6.999999999999999e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.499772 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2413  S-formylglutathione hydrolase  56.03 
 
 
290 aa  311  9e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0019  carboxylesterase  54.29 
 
 
279 aa  310  1e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06926  esterase  53.02 
 
 
279 aa  310  1e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000930  S-formylglutathione hydrolase  52.67 
 
 
279 aa  308  6.999999999999999e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1393  carboxylesterase  53.71 
 
 
281 aa  306  2.0000000000000002e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0228664  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1541  carboxylesterase  53.21 
 
 
278 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.107015  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2252  carboxylesterase  54.8 
 
 
283 aa  305  6e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.493434  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4785  S-formylglutathione hydrolase  54.61 
 
 
282 aa  304  8.000000000000001e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0295503  normal  0.699592 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0756  S-formylglutathione hydrolase  55.19 
 
 
282 aa  304  9.000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.135614 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0080  S-formylglutathione hydrolase  55.2 
 
 
282 aa  303  2.0000000000000002e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0827434  hitchhiker  0.00557282 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0052  carboxylesterase  55.76 
 
 
277 aa  303  2.0000000000000002e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2496  S-formylglutathione hydrolase  53.99 
 
 
280 aa  300  2e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.881177  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0270  S-formylglutathione hydrolase  53 
 
 
279 aa  300  2e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3256  S-formylglutathione hydrolase  57.5 
 
 
288 aa  300  3e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4023  carboxylesterase  56.34 
 
 
287 aa  298  5e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.707301 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0051  periplasmic nitrate reductase, large subunit  53 
 
 
280 aa  298  6e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.649739 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0099  carboxylesterase  53.55 
 
 
281 aa  298  6e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3426  carboxylesterase  52.84 
 
 
279 aa  298  6e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1177  S-formylglutathione hydrolase  53.71 
 
 
292 aa  297  2e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3448  carboxylesterase  52.69 
 
 
281 aa  296  3e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.775669 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5942  S-formylglutathione hydrolase  51.42 
 
 
281 aa  295  4e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.183278  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2429  S-formylglutathione hydrolase  53.24 
 
 
285 aa  295  8e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.74612 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0376  S-formylglutathione hydrolase  51.25 
 
 
289 aa  295  8e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2340  S-formylglutathione hydrolase  53.24 
 
 
285 aa  295  8e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.723017  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2543  S-formylglutathione hydrolase  53.24 
 
 
285 aa  295  8e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.420997  normal  0.167647 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2385  S-formylglutathione hydrolase  53.24 
 
 
285 aa  295  8e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.72074 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3406  carboxylesterase  55.68 
 
 
282 aa  294  1e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1701  S-formylglutathione hydrolase  54.55 
 
 
291 aa  293  2e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0975891  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0160  esterase, putative  52.48 
 
 
279 aa  293  2e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.471398  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2433  S-formylglutathione hydrolase  52.88 
 
 
285 aa  293  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.511168  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1439  carboxylesterase  51.25 
 
 
285 aa  293  2e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4226  carboxylesterase  52.48 
 
 
279 aa  293  3e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0152295 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2755  carboxylesterase  53.6 
 
 
278 aa  292  4e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.936506  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2922  carboxylesterase  53.17 
 
 
285 aa  291  7e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2312  S-formylglutathione hydrolase  52.33 
 
 
280 aa  290  2e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.770707  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1937  S-formylglutathione hydrolase  52.33 
 
 
280 aa  290  2e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.446926  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3945  S-formylglutathione hydrolase  53.24 
 
 
276 aa  290  2e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.897116  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1087  putative esterase  50.18 
 
 
278 aa  289  3e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2838  carboxylesterase  51.43 
 
 
282 aa  288  5.0000000000000004e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.796702  normal  0.149576 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4239  S-formylglutathione hydrolase  52.17 
 
 
276 aa  288  9e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3766  carboxylesterase  50.71 
 
 
279 aa  286  2e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04413  S-formylglutathione hydrolase  51.44 
 
 
276 aa  286  2e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0604  hydrolase oxidoreductase protein  53.74 
 
 
289 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.197759  normal  0.276629 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1787  carboxylesterase  51.77 
 
 
279 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2190  carboxylesterase  51.77 
 
 
279 aa  286  4e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3027  carboxylesterase  54.04 
 
 
280 aa  286  4e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000156847 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1171  S-formylglutathione hydrolase  52.5 
 
 
284 aa  285  5.999999999999999e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.441797 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2511  carboxylesterase  52.88 
 
 
276 aa  285  5.999999999999999e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.863748  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2450  S-formylglutathione hydrolase  52.52 
 
 
278 aa  285  5.999999999999999e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02083  predicted esterase  52.52 
 
 
278 aa  283  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.229266  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1504  S-formylglutathione hydrolase  52.52 
 
 
278 aa  283  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0638079  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1617  S-formylglutathione hydrolase  52.14 
 
 
284 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.117906  normal  0.524398 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2412  S-formylglutathione hydrolase  52.33 
 
 
281 aa  284  1.0000000000000001e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.246644  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0607  S-formylglutathione hydrolase  53.41 
 
 
282 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0852  S-formylglutathione hydrolase  52.52 
 
 
276 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0397354  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2288  S-formylglutathione hydrolase  52.52 
 
 
278 aa  283  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1834  carboxylesterase  51.24 
 
 
282 aa  284  1.0000000000000001e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.018763  normal  0.805615 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0812  S-formylglutathione hydrolase  52.52 
 
 
278 aa  283  1.0000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.631287  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0745  putative esterase  49.12 
 
 
280 aa  284  1.0000000000000001e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.474716  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3531  carboxylesterase  48.94 
 
 
283 aa  284  1.0000000000000001e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00419783 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02042  hypothetical protein  52.52 
 
 
278 aa  283  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214105  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1494  S-formylglutathione hydrolase  52.52 
 
 
278 aa  283  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.777132 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4160  S-formylglutathione hydrolase  52.14 
 
 
284 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.394545 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0105  S-formylglutathione hydrolase  49.28 
 
 
276 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1838  putative esterase  51.42 
 
 
279 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.236801 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0003  carboxylesterase  53.24 
 
 
281 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000616557 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1666  S-formylglutathione hydrolase  51.25 
 
 
281 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.37813  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2474  S-formylglutathione hydrolase  51.25 
 
 
280 aa  282  3.0000000000000004e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3289  S-formylglutathione hydrolase  52.52 
 
 
278 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.410888  normal  0.795091 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2194  carboxylesterase  49.47 
 
 
289 aa  282  3.0000000000000004e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.329144  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3123  carboxylesterase  52.16 
 
 
276 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00154101 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0986  carboxylesterase  49.64 
 
 
285 aa  282  4.0000000000000003e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38740  S-formylglutathione hydrolase  52.14 
 
 
281 aa  282  4.0000000000000003e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>