176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0852 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_0852  S-formylglutathione hydrolase  100 
 
 
276 aa  577  1e-164  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0397354  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2511  carboxylesterase  99.28 
 
 
276 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.863748  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3123  carboxylesterase  96 
 
 
276 aa  558  1e-158  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00154101 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3448  carboxylesterase  69.09 
 
 
281 aa  417  1e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.775669 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0052  carboxylesterase  70.18 
 
 
277 aa  414  9.999999999999999e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0019  carboxylesterase  68.86 
 
 
279 aa  411  1e-114  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3945  S-formylglutathione hydrolase  62.77 
 
 
276 aa  375  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.897116  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0474  S-formylglutathione hydrolase  62.36 
 
 
275 aa  369  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0002  carboxylesterase  55.6 
 
 
283 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1541  carboxylesterase  52.35 
 
 
278 aa  316  3e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.107015  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0141  S-formylglutathione hydrolase  53.07 
 
 
293 aa  306  3e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0333539  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4831  S-formylglutathione hydrolase  51.8 
 
 
278 aa  305  6e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.256219 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06926  esterase  51.26 
 
 
279 aa  301  5.000000000000001e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2312  S-formylglutathione hydrolase  55.07 
 
 
280 aa  301  6.000000000000001e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.770707  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4919  S-formylglutathione hydrolase  52.17 
 
 
278 aa  301  8.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0986  carboxylesterase  51.26 
 
 
285 aa  300  2e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0270  S-formylglutathione hydrolase  52.17 
 
 
279 aa  299  3e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2252  carboxylesterase  52.9 
 
 
283 aa  299  3e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.493434  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2543  S-formylglutathione hydrolase  53.05 
 
 
285 aa  298  5e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.420997  normal  0.167647 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2385  S-formylglutathione hydrolase  53.05 
 
 
285 aa  298  5e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.72074 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000930  S-formylglutathione hydrolase  50.54 
 
 
279 aa  298  5e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2340  S-formylglutathione hydrolase  53.05 
 
 
285 aa  298  5e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.723017  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2429  S-formylglutathione hydrolase  53.05 
 
 
285 aa  298  5e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.74612 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1556  S-formylglutathione hydrolase  53.62 
 
 
280 aa  297  1e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3426  carboxylesterase  51.45 
 
 
279 aa  297  1e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2433  S-formylglutathione hydrolase  52.69 
 
 
285 aa  297  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.511168  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0160  esterase, putative  51.09 
 
 
279 aa  296  2e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.471398  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1439  carboxylesterase  52.54 
 
 
285 aa  296  2e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1177  S-formylglutathione hydrolase  51.99 
 
 
292 aa  295  4e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3406  carboxylesterase  51.81 
 
 
282 aa  295  8e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03627  Carboxylesterase  50.91 
 
 
280 aa  294  1e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2474  S-formylglutathione hydrolase  53.09 
 
 
280 aa  293  2e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2572  S-formylglutathione hydrolase  53.09 
 
 
280 aa  293  3e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0807  carboxylesterase  52 
 
 
281 aa  292  4e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0179435  hitchhiker  0.00571706 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2412  S-formylglutathione hydrolase  51.64 
 
 
281 aa  292  5e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.246644  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3766  carboxylesterase  51.62 
 
 
279 aa  291  6e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3010  S-formylglutathione hydrolase  52.73 
 
 
280 aa  291  8e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00182867  hitchhiker  0.00074389 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2922  carboxylesterase  53.76 
 
 
285 aa  290  1e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4058  carboxylesterase  49.82 
 
 
281 aa  290  1e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.863948  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0105  S-formylglutathione hydrolase  49.45 
 
 
276 aa  290  1e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5942  S-formylglutathione hydrolase  50.9 
 
 
281 aa  290  1e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.183278  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0376  S-formylglutathione hydrolase  50 
 
 
289 aa  290  2e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4226  carboxylesterase  50.72 
 
 
279 aa  290  2e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0152295 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0607  S-formylglutathione hydrolase  51.45 
 
 
282 aa  289  4e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0819  putative esterase  50 
 
 
283 aa  288  5.0000000000000004e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2510  S-formylglutathione hydrolase  50.55 
 
 
273 aa  286  2e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.566414  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4239  S-formylglutathione hydrolase  49.64 
 
 
276 aa  286  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1941  S-formylglutathione hydrolase  48.54 
 
 
280 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00373445  normal  0.789535 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0756  S-formylglutathione hydrolase  50.36 
 
 
282 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.135614 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2407  S-formylglutathione hydrolase  48.18 
 
 
280 aa  285  8e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1116  S-formylglutathione hydrolase  49.82 
 
 
283 aa  284  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.714854  normal  0.85145 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1087  S-formylglutathione hydrolase  49.82 
 
 
283 aa  284  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2525  S-formylglutathione hydrolase  48.54 
 
 
280 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.81553  normal  0.653671 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1937  S-formylglutathione hydrolase  51.81 
 
 
280 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.446926  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2452  S-formylglutathione hydrolase  52.52 
 
 
279 aa  284  1.0000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.243797  normal  0.206976 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0257  Fis family transcriptional regulator  49.82 
 
 
281 aa  283  2.0000000000000002e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2418  S-formylglutathione hydrolase  48.18 
 
 
280 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2755  carboxylesterase  50 
 
 
278 aa  283  2.0000000000000002e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.936506  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0003  carboxylesterase  50.92 
 
 
281 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000616557 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1838  putative esterase  48.18 
 
 
279 aa  282  4.0000000000000003e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.236801 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2055  esterase, putative  48.91 
 
 
279 aa  282  5.000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2173  carboxylesterase  48.18 
 
 
280 aa  281  7.000000000000001e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.116345  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1021  S-formylglutathione hydrolase  50 
 
 
277 aa  281  7.000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.444109  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1666  S-formylglutathione hydrolase  52.16 
 
 
281 aa  281  8.000000000000001e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.37813  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0099  carboxylesterase  50.18 
 
 
281 aa  280  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1834  carboxylesterase  52.33 
 
 
282 aa  281  1e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.018763  normal  0.805615 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1787  carboxylesterase  48.18 
 
 
279 aa  280  1e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2450  S-formylglutathione hydrolase  50.9 
 
 
278 aa  280  1e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1368  carboxylesterase  50.36 
 
 
281 aa  280  2e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02083  predicted esterase  50.9 
 
 
278 aa  280  3e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.229266  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1504  S-formylglutathione hydrolase  50.9 
 
 
278 aa  280  3e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0638079  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1617  S-formylglutathione hydrolase  50.71 
 
 
284 aa  279  3e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.117906  normal  0.524398 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02042  hypothetical protein  50.9 
 
 
278 aa  280  3e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214105  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0812  S-formylglutathione hydrolase  50.9 
 
 
278 aa  280  3e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.631287  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04413  S-formylglutathione hydrolase  48.36 
 
 
276 aa  279  3e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1494  S-formylglutathione hydrolase  50.9 
 
 
278 aa  280  3e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.777132 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4160  S-formylglutathione hydrolase  50.71 
 
 
284 aa  279  3e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.394545 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2288  S-formylglutathione hydrolase  50.9 
 
 
278 aa  280  3e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1559  esterase, putative  49.64 
 
 
281 aa  279  4e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.41528  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2190  carboxylesterase  47.81 
 
 
279 aa  279  4e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1126  putative esterase  50.36 
 
 
281 aa  278  5e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3289  S-formylglutathione hydrolase  50.9 
 
 
278 aa  278  5e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.410888  normal  0.795091 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2273  carboxylesterase  52.31 
 
 
289 aa  278  6e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3385  S-formylglutathione hydrolase  49.62 
 
 
276 aa  278  7e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.217643  normal  0.707698 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1171  S-formylglutathione hydrolase  50 
 
 
284 aa  277  1e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.441797 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1828  carboxylesterase  50.36 
 
 
298 aa  277  1e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0463121  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1087  putative esterase  47.27 
 
 
278 aa  276  2e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0458  carboxylesterase  50 
 
 
278 aa  276  2e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2627  S-formylglutathione hydrolase  49.1 
 
 
282 aa  276  3e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3027  carboxylesterase  51.08 
 
 
280 aa  276  3e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000156847 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3679  S-formylglutathione hydrolase  48.55 
 
 
276 aa  275  6e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.182564  normal  0.277984 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2301  S-formylglutathione hydrolase  50.54 
 
 
278 aa  275  7e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.014444 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0694  S-formylglutathione hydrolase  49.1 
 
 
282 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.816955 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1993  carboxylesterase  48.75 
 
 
282 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2603  carboxylesterase  48.75 
 
 
282 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38740  S-formylglutathione hydrolase  49.64 
 
 
281 aa  274  1.0000000000000001e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3999  carboxylesterase  51.6 
 
 
283 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.122299  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0051  periplasmic nitrate reductase, large subunit  50 
 
 
280 aa  273  2.0000000000000002e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.649739 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4058  S-formylglutathione hydrolase  49.29 
 
 
284 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000241575 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5934  carboxylesterase  48.75 
 
 
282 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.304704  normal  0.802561 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>