240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5942 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_5942  S-formylglutathione hydrolase  100 
 
 
281 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.183278  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0099  carboxylesterase  80.65 
 
 
281 aa  467  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1177  S-formylglutathione hydrolase  75.63 
 
 
292 aa  440  9.999999999999999e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2922  carboxylesterase  70.82 
 
 
285 aa  410  1e-113  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1834  carboxylesterase  67.5 
 
 
282 aa  395  1e-109  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.018763  normal  0.805615 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4831  S-formylglutathione hydrolase  61.15 
 
 
278 aa  357  8e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.256219 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4919  S-formylglutathione hydrolase  60.07 
 
 
278 aa  355  5e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0141  S-formylglutathione hydrolase  59.14 
 
 
293 aa  355  5e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0333539  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1021  S-formylglutathione hydrolase  60.79 
 
 
277 aa  347  1e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.444109  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0002  carboxylesterase  58.42 
 
 
283 aa  335  5e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2510  S-formylglutathione hydrolase  58.03 
 
 
273 aa  334  9e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.566414  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0127  esterase, putative  60.8 
 
 
251 aa  326  2.0000000000000001e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0122  S-formylglutathione hydrolase  60.4 
 
 
251 aa  323  2e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16316  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0019  carboxylesterase  53.9 
 
 
279 aa  313  1.9999999999999998e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0607  S-formylglutathione hydrolase  56.93 
 
 
282 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3406  carboxylesterase  56.93 
 
 
282 aa  311  5.999999999999999e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38740  S-formylglutathione hydrolase  56.07 
 
 
281 aa  311  6.999999999999999e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3766  carboxylesterase  52.86 
 
 
279 aa  311  1e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0051  periplasmic nitrate reductase, large subunit  54.06 
 
 
280 aa  309  2.9999999999999997e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.649739 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1126  putative esterase  55.36 
 
 
281 aa  308  5e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2651  carboxylesterase  56.03 
 
 
282 aa  308  5e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2496  S-formylglutathione hydrolase  56.57 
 
 
280 aa  308  8e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.881177  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2524  S-formylglutathione hydrolase  56.03 
 
 
282 aa  308  8e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.225567  normal  0.138843 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3027  carboxylesterase  55.71 
 
 
280 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000156847 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17410  putative esterase  54.84 
 
 
283 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1617  S-formylglutathione hydrolase  54.23 
 
 
284 aa  305  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.117906  normal  0.524398 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0694  S-formylglutathione hydrolase  54.96 
 
 
282 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.816955 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4160  S-formylglutathione hydrolase  54.23 
 
 
284 aa  305  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.394545 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1171  S-formylglutathione hydrolase  54.58 
 
 
284 aa  305  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.441797 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0714  S-formylglutathione hydrolase (FghA)  54.09 
 
 
285 aa  304  9.000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224272  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0986  carboxylesterase  52.5 
 
 
285 aa  304  1.0000000000000001e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4058  S-formylglutathione hydrolase  54.58 
 
 
284 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000241575 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1511  S-formylglutathione hydrolase  54.12 
 
 
283 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0807  carboxylesterase  53.93 
 
 
281 aa  303  2.0000000000000002e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0179435  hitchhiker  0.00571706 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3679  S-formylglutathione hydrolase  52.52 
 
 
276 aa  302  4.0000000000000003e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.182564  normal  0.277984 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3515  S-formylglutathione hydrolase  54.12 
 
 
278 aa  302  5.000000000000001e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5934  carboxylesterase  54.96 
 
 
282 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.304704  normal  0.802561 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4239  S-formylglutathione hydrolase  53.6 
 
 
276 aa  301  6.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1026  S-formylglutathione hydrolase  53.71 
 
 
286 aa  300  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.199417  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0484  S-formylglutathione hydrolase  52.69 
 
 
281 aa  300  1e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.329572  hitchhiker  0.0024188 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3252  S-formylglutathione hydrolase  53.38 
 
 
283 aa  300  1e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.499772 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0863  S-formylglutathione hydrolase  53.71 
 
 
286 aa  300  1e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0867  S-formylglutathione hydrolase  53.71 
 
 
286 aa  300  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1993  carboxylesterase  54.61 
 
 
282 aa  299  3e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2603  carboxylesterase  54.61 
 
 
282 aa  299  3e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0325  esterase, putative  53.36 
 
 
286 aa  299  4e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.559374  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0071  putative esterase  53.36 
 
 
286 aa  299  4e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0623  putative esterase  53.36 
 
 
286 aa  299  4e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.778268  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2457  putative esterase  53.36 
 
 
286 aa  299  4e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3448  carboxylesterase  52.14 
 
 
281 aa  298  6e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.775669 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2627  S-formylglutathione hydrolase  54.26 
 
 
282 aa  298  9e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0003  carboxylesterase  50.89 
 
 
281 aa  298  9e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000616557 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3426  carboxylesterase  51.06 
 
 
279 aa  297  1e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1559  esterase, putative  53.02 
 
 
281 aa  296  2e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.41528  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0160  esterase, putative  51.42 
 
 
279 aa  295  4e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.471398  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2452  S-formylglutathione hydrolase  51.42 
 
 
279 aa  295  4e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.243797  normal  0.206976 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0105  S-formylglutathione hydrolase  51.25 
 
 
276 aa  294  1e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3999  carboxylesterase  52.46 
 
 
283 aa  293  2e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.122299  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3123  carboxylesterase  51.26 
 
 
276 aa  293  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00154101 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1087  putative esterase  50.18 
 
 
278 aa  292  3e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2273  carboxylesterase  52.31 
 
 
289 aa  293  3e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1368  carboxylesterase  52.14 
 
 
281 aa  292  5e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0687  esterase, putative  53.19 
 
 
282 aa  291  7e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2511  carboxylesterase  51.26 
 
 
276 aa  291  7e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.863748  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4226  carboxylesterase  50.35 
 
 
279 aa  291  8e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0152295 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0852  S-formylglutathione hydrolase  50.9 
 
 
276 aa  290  1e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0397354  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1393  carboxylesterase  48.93 
 
 
281 aa  290  2e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0228664  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4058  carboxylesterase  48.39 
 
 
281 aa  290  2e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.863948  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04413  S-formylglutathione hydrolase  53.07 
 
 
276 aa  289  4e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1666  S-formylglutathione hydrolase  51.08 
 
 
281 aa  288  5.0000000000000004e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.37813  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3531  carboxylesterase  48.75 
 
 
283 aa  287  1e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00419783 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1937  S-formylglutathione hydrolase  51.8 
 
 
280 aa  286  2e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.446926  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0380  S-formylglutathione hydrolase  48.92 
 
 
277 aa  286  2e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1229  carboxylesterase  50.53 
 
 
286 aa  286  2e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.335856 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4023  carboxylesterase  55.06 
 
 
287 aa  286  2e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.707301 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06926  esterase  50.18 
 
 
279 aa  286  2.9999999999999996e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2252  carboxylesterase  50.89 
 
 
283 aa  286  2.9999999999999996e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.493434  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1541  carboxylesterase  49.46 
 
 
278 aa  285  4e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.107015  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0745  putative esterase  48.76 
 
 
280 aa  286  4e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.474716  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0386  S-formylglutathione hydrolase  48.56 
 
 
277 aa  285  5e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.94847  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0420  S-formylglutathione hydrolase  48.56 
 
 
277 aa  285  8e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0270  S-formylglutathione hydrolase  48.93 
 
 
279 aa  284  9e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2572  S-formylglutathione hydrolase  50 
 
 
280 aa  284  9e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1439  carboxylesterase  48.23 
 
 
285 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2838  carboxylesterase  47.31 
 
 
282 aa  284  1.0000000000000001e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.796702  normal  0.149576 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03627  Carboxylesterase  46.59 
 
 
280 aa  284  1.0000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0430  S-formylglutathione hydrolase  48.2 
 
 
277 aa  283  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4785  S-formylglutathione hydrolase  52.3 
 
 
282 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0295503  normal  0.699592 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00309  predicted esterase  48.2 
 
 
277 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00313  hypothetical protein  48.2 
 
 
277 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0756  S-formylglutathione hydrolase  48.75 
 
 
282 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.135614 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3270  S-formylglutathione hydrolase  48.2 
 
 
277 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.103024  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2474  S-formylglutathione hydrolase  50 
 
 
280 aa  283  3.0000000000000004e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1556  S-formylglutathione hydrolase  49.82 
 
 
280 aa  282  4.0000000000000003e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1787  carboxylesterase  48.19 
 
 
279 aa  281  6.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1838  putative esterase  48.19 
 
 
279 aa  281  6.000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.236801 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3010  S-formylglutathione hydrolase  49.64 
 
 
280 aa  281  8.000000000000001e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00182867  hitchhiker  0.00074389 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3251  S-formylglutathione hydrolase  47.84 
 
 
277 aa  281  9e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0376  S-formylglutathione hydrolase  48.23 
 
 
289 aa  281  1e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2190  carboxylesterase  48.19 
 
 
279 aa  281  1e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>