228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2651 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008390  Bamb_2651  carboxylesterase  100 
 
 
282 aa  577  1e-164  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2524  S-formylglutathione hydrolase  99.65 
 
 
282 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.225567  normal  0.138843 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5934  carboxylesterase  96.1 
 
 
282 aa  556  1e-157  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.304704  normal  0.802561 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2627  S-formylglutathione hydrolase  94.33 
 
 
282 aa  548  1e-155  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1993  carboxylesterase  94.68 
 
 
282 aa  550  1e-155  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2603  carboxylesterase  94.68 
 
 
282 aa  550  1e-155  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0694  S-formylglutathione hydrolase  93.97 
 
 
282 aa  547  1e-155  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.816955 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0325  esterase, putative  87.9 
 
 
286 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.559374  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1026  S-formylglutathione hydrolase  88.26 
 
 
286 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.199417  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0687  esterase, putative  87.94 
 
 
282 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0623  putative esterase  87.9 
 
 
286 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.778268  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2457  putative esterase  87.9 
 
 
286 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0863  S-formylglutathione hydrolase  88.26 
 
 
286 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0867  S-formylglutathione hydrolase  88.26 
 
 
286 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0071  putative esterase  87.9 
 
 
286 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0714  S-formylglutathione hydrolase (FghA)  82.98 
 
 
285 aa  484  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224272  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3252  S-formylglutathione hydrolase  81.21 
 
 
283 aa  479  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.499772 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0484  S-formylglutathione hydrolase  79.29 
 
 
281 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.329572  hitchhiker  0.0024188 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3999  carboxylesterase  74.82 
 
 
283 aa  432  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.122299  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1229  carboxylesterase  70.61 
 
 
286 aa  424  1e-117  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.335856 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4785  S-formylglutathione hydrolase  72.7 
 
 
282 aa  419  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0295503  normal  0.699592 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2801  carboxylesterase  71.13 
 
 
294 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.234504 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0122  carboxylesterase  72.04 
 
 
288 aa  411  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2291  S-formylglutathione hydrolase  70.42 
 
 
294 aa  412  1e-114  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2413  S-formylglutathione hydrolase  69.5 
 
 
290 aa  400  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0604  hydrolase oxidoreductase protein  68.93 
 
 
289 aa  389  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.197759  normal  0.276629 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0521  S-formylglutathione hydrolase  69.64 
 
 
287 aa  384  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0534  S-formylglutathione hydrolase  68.93 
 
 
287 aa  381  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3256  S-formylglutathione hydrolase  68.93 
 
 
288 aa  376  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1701  S-formylglutathione hydrolase  67.72 
 
 
291 aa  374  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0975891  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2194  carboxylesterase  62.81 
 
 
289 aa  364  1e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.329144  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2496  S-formylglutathione hydrolase  63.77 
 
 
280 aa  355  6.999999999999999e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.881177  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0002  carboxylesterase  60.36 
 
 
283 aa  353  2e-96  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0756  S-formylglutathione hydrolase  60.85 
 
 
282 aa  349  3e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.135614 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1087  putative esterase  56.88 
 
 
278 aa  332  3e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2452  S-formylglutathione hydrolase  56.79 
 
 
279 aa  323  2e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.243797  normal  0.206976 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0105  S-formylglutathione hydrolase  55.16 
 
 
276 aa  319  3e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3515  S-formylglutathione hydrolase  55.2 
 
 
278 aa  319  3e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0807  carboxylesterase  57.35 
 
 
281 aa  318  3.9999999999999996e-86  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0179435  hitchhiker  0.00571706 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4638  S-formylglutathione hydrolase  52.33 
 
 
283 aa  318  5e-86  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.186695  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0986  carboxylesterase  55.52 
 
 
285 aa  317  1e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2838  carboxylesterase  53.57 
 
 
282 aa  317  1e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.796702  normal  0.149576 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0257  Fis family transcriptional regulator  54.96 
 
 
281 aa  317  2e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38740  S-formylglutathione hydrolase  60 
 
 
281 aa  316  3e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3406  carboxylesterase  57.86 
 
 
282 aa  313  9.999999999999999e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1126  putative esterase  56.23 
 
 
281 aa  312  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04413  S-formylglutathione hydrolase  56.27 
 
 
276 aa  312  4.999999999999999e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0080  S-formylglutathione hydrolase  59.21 
 
 
282 aa  311  7.999999999999999e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0827434  hitchhiker  0.00557282 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0698  S-formylglutathione hydrolase  57.5 
 
 
284 aa  311  9e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.380863  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3679  S-formylglutathione hydrolase  53.55 
 
 
276 aa  310  1e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.182564  normal  0.277984 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1087  S-formylglutathione hydrolase  51.96 
 
 
283 aa  311  1e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1116  S-formylglutathione hydrolase  51.96 
 
 
283 aa  311  1e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.714854  normal  0.85145 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4239  S-formylglutathione hydrolase  55.71 
 
 
276 aa  310  2e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1617  S-formylglutathione hydrolase  55.83 
 
 
284 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.117906  normal  0.524398 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1171  S-formylglutathione hydrolase  56.18 
 
 
284 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.441797 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0607  S-formylglutathione hydrolase  56.99 
 
 
282 aa  309  2.9999999999999997e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4160  S-formylglutathione hydrolase  55.83 
 
 
284 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.394545 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5942  S-formylglutathione hydrolase  56.03 
 
 
281 aa  308  5e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.183278  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1541  carboxylesterase  52.67 
 
 
278 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.107015  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4058  S-formylglutathione hydrolase  55.83 
 
 
284 aa  306  3e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000241575 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17410  putative esterase  56.58 
 
 
283 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2922  carboxylesterase  55.52 
 
 
285 aa  301  6.000000000000001e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1511  S-formylglutathione hydrolase  55.87 
 
 
283 aa  301  7.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0846  S-formylglutathione hydrolase  58.49 
 
 
268 aa  300  2e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.923853 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1439  carboxylesterase  52.48 
 
 
285 aa  299  3e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3385  S-formylglutathione hydrolase  55.56 
 
 
276 aa  298  6e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.217643  normal  0.707698 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0270  S-formylglutathione hydrolase  52.13 
 
 
279 aa  298  7e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2273  carboxylesterase  54.09 
 
 
289 aa  297  1e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3027  carboxylesterase  56.38 
 
 
280 aa  297  1e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000156847 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0458  carboxylesterase  56.74 
 
 
278 aa  296  3e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0099  carboxylesterase  55.36 
 
 
281 aa  296  3e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4023  carboxylesterase  56.51 
 
 
287 aa  296  3e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.707301 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3766  carboxylesterase  51.79 
 
 
279 aa  295  5e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0019  carboxylesterase  53.24 
 
 
279 aa  295  6e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2312  S-formylglutathione hydrolase  52.69 
 
 
280 aa  293  2e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.770707  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1559  esterase, putative  54.45 
 
 
281 aa  293  2e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.41528  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06926  esterase  50.36 
 
 
279 aa  292  5e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1834  carboxylesterase  53.38 
 
 
282 aa  291  8e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.018763  normal  0.805615 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1393  carboxylesterase  51.62 
 
 
281 aa  290  2e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0228664  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0420  S-formylglutathione hydrolase  49.46 
 
 
277 aa  290  2e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0380  S-formylglutathione hydrolase  49.46 
 
 
277 aa  290  2e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2755  carboxylesterase  51.25 
 
 
278 aa  290  2e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.936506  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3426  carboxylesterase  51.42 
 
 
279 aa  289  3e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0376  S-formylglutathione hydrolase  50.71 
 
 
289 aa  289  3e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0141  S-formylglutathione hydrolase  50.9 
 
 
293 aa  289  5.0000000000000004e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0333539  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0160  esterase, putative  51.77 
 
 
279 aa  288  6e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.471398  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1368  carboxylesterase  53.02 
 
 
281 aa  288  7e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00309  predicted esterase  49.1 
 
 
277 aa  287  1e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00313  hypothetical protein  49.1 
 
 
277 aa  287  1e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3270  S-formylglutathione hydrolase  49.1 
 
 
277 aa  287  1e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.103024  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000930  S-formylglutathione hydrolase  50.36 
 
 
279 aa  287  1e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4058  carboxylesterase  50.89 
 
 
281 aa  288  1e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.863948  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4226  carboxylesterase  51.42 
 
 
279 aa  288  1e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0152295 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0003  carboxylesterase  50.35 
 
 
281 aa  286  2e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000616557 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0386  S-formylglutathione hydrolase  48.75 
 
 
277 aa  286  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.94847  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3251  S-formylglutathione hydrolase  48.75 
 
 
277 aa  286  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2412  S-formylglutathione hydrolase  52.69 
 
 
281 aa  286  4e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.246644  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2190  carboxylesterase  50.54 
 
 
279 aa  285  4e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1177  S-formylglutathione hydrolase  54.29 
 
 
292 aa  285  4e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1787  carboxylesterase  50.54 
 
 
279 aa  285  7e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>