188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0521 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0521  S-formylglutathione hydrolase  100 
 
 		 287 aa  585  1e-166  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0534  S-formylglutathione hydrolase  98.95 
 
 		 287 aa  580  1e-164  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0604  hydrolase oxidoreductase protein  89.01 
 
 		 289 aa  523  1e-147  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.197759  normal  0.276629 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4785  S-formylglutathione hydrolase  71.63 
 
 		 282 aa  412  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0295503  normal  0.699592 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0694  S-formylglutathione hydrolase  71.07 
 
 		 282 aa  401  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.816955 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3999  carboxylesterase  70.11 
 
 		 283 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.122299  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0714  S-formylglutathione hydrolase (FghA)  70.36 
 
 		 285 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1993  carboxylesterase  70.36 
 
 		 282 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2603  carboxylesterase  70.36 
 
 		 282 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1229  carboxylesterase  70.46 
 
 		 286 aa  399  9.999999999999999e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.335856 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3252  S-formylglutathione hydrolase  68.93 
 
 		 283 aa  395  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.499772 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2651  carboxylesterase  69.64 
 
 		 282 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2627  S-formylglutathione hydrolase  69.64 
 
 		 282 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2524  S-formylglutathione hydrolase  69.64 
 
 		 282 aa  394  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.225567  normal  0.138843 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2291  S-formylglutathione hydrolase  69.01 
 
 		 294 aa  393  1e-108  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2413  S-formylglutathione hydrolase  68.66 
 
 		 290 aa  393  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5934  carboxylesterase  69.64 
 
 		 282 aa  393  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.304704  normal  0.802561 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2801  carboxylesterase  69.01 
 
 		 294 aa  394  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.234504 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0687  esterase, putative  69.64 
 
 		 282 aa  389  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0122  carboxylesterase  71.53 
 
 		 288 aa  389  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0325  esterase, putative  68.21 
 
 		 286 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.559374  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1026  S-formylglutathione hydrolase  68.57 
 
 		 286 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.199417  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0484  S-formylglutathione hydrolase  67.74 
 
 		 281 aa  384  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.329572  hitchhiker  0.0024188 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0623  putative esterase  68.21 
 
 		 286 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.778268  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2457  putative esterase  68.21 
 
 		 286 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0863  S-formylglutathione hydrolase  68.57 
 
 		 286 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0867  S-formylglutathione hydrolase  68.57 
 
 		 286 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0071  putative esterase  68.21 
 
 		 286 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3256  S-formylglutathione hydrolase  68.07 
 
 		 288 aa  377  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1701  S-formylglutathione hydrolase  67.01 
 
 		 291 aa  359  3e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0975891  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2194  carboxylesterase  63.19 
 
 		 289 aa  354  6.999999999999999e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.329144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0698  S-formylglutathione hydrolase  61.29 
 
 		 284 aa  334  9e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.380863  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2496  S-formylglutathione hydrolase  61.96 
 
 		 280 aa  333  1e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.881177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0002  carboxylesterase  60.22 
 
 		 283 aa  332  4e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0756  S-formylglutathione hydrolase  58.06 
 
 		 282 aa  326  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.135614 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1087  putative esterase  57.61 
 
 		 278 aa  320  9.999999999999999e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0846  S-formylglutathione hydrolase  61.74 
 
 		 268 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.923853 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0080  S-formylglutathione hydrolase  60.22 
 
 		 282 aa  312  2.9999999999999996e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0827434  hitchhiker  0.00557282 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0607  S-formylglutathione hydrolase  56.74 
 
 		 282 aa  308  5e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38740  S-formylglutathione hydrolase  57.3 
 
 		 281 aa  307  1.0000000000000001e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17410  putative esterase  56.74 
 
 		 283 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1511  S-formylglutathione hydrolase  56.23 
 
 		 283 aa  304  9.000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0986  carboxylesterase  54.29 
 
 		 285 aa  303  2.0000000000000002e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4239  S-formylglutathione hydrolase  52.5 
 
 		 276 aa  300  1e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1126  putative esterase  53.55 
 
 		 281 aa  301  1e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3679  S-formylglutathione hydrolase  52.69 
 
 		 276 aa  298  7e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.182564  normal  0.277984 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4058  S-formylglutathione hydrolase  53.17 
 
 		 284 aa  297  1e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000241575 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0257  Fis family transcriptional regulator  53.02 
 
 		 281 aa  297  2e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0270  S-formylglutathione hydrolase  51.97 
 
 		 279 aa  295  6e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1617  S-formylglutathione hydrolase  52.82 
 
 		 284 aa  295  7e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.117906  normal  0.524398 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1171  S-formylglutathione hydrolase  53.17 
 
 		 284 aa  295  7e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.441797 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4160  S-formylglutathione hydrolase  52.82 
 
 		 284 aa  295  7e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.394545 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1439  carboxylesterase  51.43 
 
 		 285 aa  295  8e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3426  carboxylesterase  51.61 
 
 		 279 aa  295  8e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1541  carboxylesterase  51.97 
 
 		 278 aa  295  8e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.107015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1087  S-formylglutathione hydrolase  51.25 
 
 		 283 aa  294  1e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1116  S-formylglutathione hydrolase  51.25 
 
 		 283 aa  294  1e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.714854  normal  0.85145 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4023  carboxylesterase  55.56 
 
 		 287 aa  292  5e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.707301 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2412  S-formylglutathione hydrolase  53.38 
 
 		 281 aa  291  8e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.246644  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3406  carboxylesterase  55.63 
 
 		 282 aa  290  1e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0160  esterase, putative  51.61 
 
 		 279 aa  289  3e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.471398  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2838  carboxylesterase  49.82 
 
 		 282 aa  289  3e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.796702  normal  0.149576 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3027  carboxylesterase  53.93 
 
 		 280 aa  289  3e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000156847 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0376  S-formylglutathione hydrolase  48.94 
 
 		 289 aa  289  3e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4058  carboxylesterase  50.53 
 
 		 281 aa  289  4e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.863948  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0807  carboxylesterase  53.41 
 
 		 281 aa  288  5.0000000000000004e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0179435  hitchhiker  0.00571706 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1393  carboxylesterase  50.18 
 
 		 281 aa  288  6e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0228664  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4638  S-formylglutathione hydrolase  49.46 
 
 		 283 aa  288  6e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.186695  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06926  esterase  50.18 
 
 		 279 aa  288  6e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0458  carboxylesterase  55.71 
 
 		 278 aa  288  8e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2273  carboxylesterase  51.6 
 
 		 289 aa  287  1e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2922  carboxylesterase  52.48 
 
 		 285 aa  286  2e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2252  carboxylesterase  51.61 
 
 		 283 aa  286  2.9999999999999996e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.493434  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3766  carboxylesterase  49.82 
 
 		 279 aa  286  4e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04413  S-formylglutathione hydrolase  53.57 
 
 		 276 aa  286  4e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1368  carboxylesterase  52.67 
 
 		 281 aa  285  5e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4226  carboxylesterase  50.18 
 
 		 279 aa  285  5e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0152295 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000930  S-formylglutathione hydrolase  50.54 
 
 		 279 aa  284  9e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1559  esterase, putative  51.96 
 
 		 281 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.41528  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3385  S-formylglutathione hydrolase  55.22 
 
 		 276 aa  284  1.0000000000000001e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.217643  normal  0.707698 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0819  putative esterase  48.75 
 
 		 283 aa  283  2.0000000000000002e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1177  S-formylglutathione hydrolase  53.9 
 
 		 292 aa  283  2.0000000000000002e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2452  S-formylglutathione hydrolase  53.57 
 
 		 279 aa  283  3.0000000000000004e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.243797  normal  0.206976 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2474  S-formylglutathione hydrolase  53.02 
 
 		 280 aa  282  4.0000000000000003e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1941  S-formylglutathione hydrolase  48.75 
 
 		 280 aa  282  5.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00373445  normal  0.789535 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2312  S-formylglutathione hydrolase  52.84 
 
 		 280 aa  282  5.000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.770707  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2407  S-formylglutathione hydrolase  48.75 
 
 		 280 aa  281  8.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2572  S-formylglutathione hydrolase  53.02 
 
 		 280 aa  281  9e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0003  carboxylesterase  51.09 
 
 		 281 aa  281  9e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000616557 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1787  carboxylesterase  50.18 
 
 		 279 aa  281  1e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2190  carboxylesterase  50.18 
 
 		 279 aa  281  1e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1838  putative esterase  50.18 
 
 		 279 aa  280  2e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.236801 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2433  S-formylglutathione hydrolase  49.64 
 
 		 285 aa  280  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.511168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3010  S-formylglutathione hydrolase  52.67 
 
 		 280 aa  279  3e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00182867  hitchhiker  0.00074389 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2418  S-formylglutathione hydrolase  48.4 
 
 		 280 aa  279  4e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2429  S-formylglutathione hydrolase  49.64 
 
 		 285 aa  279  5e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.74612 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2340  S-formylglutathione hydrolase  49.64 
 
 		 285 aa  279  5e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.723017  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2385  S-formylglutathione hydrolase  49.64 
 
 		 285 aa  279  5e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.72074 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2543  S-formylglutathione hydrolase  49.64 
 
 		 285 aa  278  7e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.420997  normal  0.167647 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2173  carboxylesterase  48.23 
 
 		 280 aa  278  7e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.116345  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>