228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1021 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_1021  S-formylglutathione hydrolase  100 
 
 
277 aa  580  1.0000000000000001e-165  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.444109  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2510  S-formylglutathione hydrolase  81.32 
 
 
273 aa  484  1e-136  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.566414  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4831  S-formylglutathione hydrolase  70.4 
 
 
278 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.256219 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0141  S-formylglutathione hydrolase  68.84 
 
 
293 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0333539  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4919  S-formylglutathione hydrolase  67.51 
 
 
278 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0127  esterase, putative  69.08 
 
 
251 aa  372  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0122  S-formylglutathione hydrolase  68.67 
 
 
251 aa  369  1e-101  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16316  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1177  S-formylglutathione hydrolase  62.45 
 
 
292 aa  353  2e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0099  carboxylesterase  61.37 
 
 
281 aa  351  7e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5942  S-formylglutathione hydrolase  60.79 
 
 
281 aa  347  1e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.183278  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1834  carboxylesterase  59.71 
 
 
282 aa  335  5e-91  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.018763  normal  0.805615 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2922  carboxylesterase  58.42 
 
 
285 aa  327  1.0000000000000001e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0807  carboxylesterase  56.68 
 
 
281 aa  317  1e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0179435  hitchhiker  0.00571706 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0002  carboxylesterase  55.6 
 
 
283 aa  311  7.999999999999999e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1087  putative esterase  52.75 
 
 
278 aa  305  4.0000000000000004e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04413  S-formylglutathione hydrolase  55.07 
 
 
276 aa  300  2e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0019  carboxylesterase  53.99 
 
 
279 aa  300  2e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0986  carboxylesterase  50.72 
 
 
285 aa  296  2e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0607  S-formylglutathione hydrolase  53.28 
 
 
282 aa  290  2e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0756  S-formylglutathione hydrolase  51.45 
 
 
282 aa  290  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.135614 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4058  carboxylesterase  50.18 
 
 
281 aa  289  3e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.863948  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3945  S-formylglutathione hydrolase  51.45 
 
 
276 aa  289  4e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.897116  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0458  carboxylesterase  52.52 
 
 
278 aa  288  8e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2525  S-formylglutathione hydrolase  50 
 
 
280 aa  287  1e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.81553  normal  0.653671 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0270  S-formylglutathione hydrolase  51.46 
 
 
279 aa  287  1e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2496  S-formylglutathione hydrolase  54.95 
 
 
280 aa  286  2e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.881177  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1941  S-formylglutathione hydrolase  49.64 
 
 
280 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00373445  normal  0.789535 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3766  carboxylesterase  49.45 
 
 
279 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2418  S-formylglutathione hydrolase  49.64 
 
 
280 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1541  carboxylesterase  51.45 
 
 
278 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.107015  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1617  S-formylglutathione hydrolase  52.88 
 
 
284 aa  285  4e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.117906  normal  0.524398 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4160  S-formylglutathione hydrolase  52.88 
 
 
284 aa  285  4e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.394545 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1171  S-formylglutathione hydrolase  52.88 
 
 
284 aa  285  5e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.441797 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3123  carboxylesterase  51.09 
 
 
276 aa  284  9e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00154101 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1559  esterase, putative  51.97 
 
 
281 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.41528  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1126  putative esterase  51.44 
 
 
281 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3027  carboxylesterase  52.52 
 
 
280 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000156847 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2407  S-formylglutathione hydrolase  49.27 
 
 
280 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2838  carboxylesterase  47.48 
 
 
282 aa  283  3.0000000000000004e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.796702  normal  0.149576 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2173  carboxylesterase  49.27 
 
 
280 aa  282  5.000000000000001e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.116345  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38740  S-formylglutathione hydrolase  52 
 
 
281 aa  281  7.000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0852  S-formylglutathione hydrolase  50 
 
 
276 aa  281  7.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0397354  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2511  carboxylesterase  50.36 
 
 
276 aa  281  7.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.863748  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1368  carboxylesterase  51.25 
 
 
281 aa  280  1e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3406  carboxylesterase  50.72 
 
 
282 aa  281  1e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4785  S-formylglutathione hydrolase  52.48 
 
 
282 aa  281  1e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0295503  normal  0.699592 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3448  carboxylesterase  50 
 
 
281 aa  280  1e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.775669 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2190  carboxylesterase  49.64 
 
 
279 aa  280  1e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0003  carboxylesterase  50.92 
 
 
281 aa  280  1e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000616557 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06926  esterase  49.82 
 
 
279 aa  281  1e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0484  S-formylglutathione hydrolase  50.36 
 
 
281 aa  280  1e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.329572  hitchhiker  0.0024188 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2412  S-formylglutathione hydrolase  51.09 
 
 
281 aa  280  2e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.246644  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0051  periplasmic nitrate reductase, large subunit  50.72 
 
 
280 aa  280  2e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.649739 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1439  carboxylesterase  48.92 
 
 
285 aa  280  2e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1787  carboxylesterase  49.64 
 
 
279 aa  280  2e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1838  putative esterase  49.64 
 
 
279 aa  280  2e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.236801 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000930  S-formylglutathione hydrolase  50.54 
 
 
279 aa  280  2e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17410  putative esterase  51.08 
 
 
283 aa  279  4e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1511  S-formylglutathione hydrolase  50.72 
 
 
283 aa  278  5e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4058  S-formylglutathione hydrolase  51.8 
 
 
284 aa  278  7e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000241575 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2312  S-formylglutathione hydrolase  49.64 
 
 
280 aa  278  8e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.770707  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0052  carboxylesterase  50.72 
 
 
277 aa  277  1e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3426  carboxylesterase  49.28 
 
 
279 aa  277  1e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1229  carboxylesterase  49.46 
 
 
286 aa  277  1e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.335856 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1393  carboxylesterase  48.56 
 
 
281 aa  276  2e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0228664  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0714  S-formylglutathione hydrolase (FghA)  50 
 
 
285 aa  276  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224272  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0160  esterase, putative  49.28 
 
 
279 aa  276  3e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.471398  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1556  S-formylglutathione hydrolase  49.28 
 
 
280 aa  275  4e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3252  S-formylglutathione hydrolase  49.64 
 
 
283 aa  275  4e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.499772 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3679  S-formylglutathione hydrolase  48.19 
 
 
276 aa  275  5e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.182564  normal  0.277984 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2524  S-formylglutathione hydrolase  50.9 
 
 
282 aa  274  9e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.225567  normal  0.138843 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2055  esterase, putative  48.19 
 
 
279 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4226  carboxylesterase  48.92 
 
 
279 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0152295 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2651  carboxylesterase  50.9 
 
 
282 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0376  S-formylglutathione hydrolase  48.01 
 
 
289 aa  273  3e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2429  S-formylglutathione hydrolase  48.93 
 
 
285 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.74612 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2385  S-formylglutathione hydrolase  48.93 
 
 
285 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.72074 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2340  S-formylglutathione hydrolase  48.93 
 
 
285 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.723017  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0694  S-formylglutathione hydrolase  50.18 
 
 
282 aa  273  3e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.816955 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2755  carboxylesterase  49.82 
 
 
278 aa  273  3e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.936506  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0819  putative esterase  48.2 
 
 
283 aa  272  4.0000000000000004e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2543  S-formylglutathione hydrolase  48.93 
 
 
285 aa  272  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.420997  normal  0.167647 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0420  S-formylglutathione hydrolase  47.29 
 
 
277 aa  272  5.000000000000001e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1937  S-formylglutathione hydrolase  49.28 
 
 
280 aa  271  6e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.446926  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4239  S-formylglutathione hydrolase  49.82 
 
 
276 aa  271  7e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2433  S-formylglutathione hydrolase  48.57 
 
 
285 aa  271  9e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.511168  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1116  S-formylglutathione hydrolase  45.99 
 
 
283 aa  271  1e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.714854  normal  0.85145 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0380  S-formylglutathione hydrolase  46.93 
 
 
277 aa  271  1e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3385  S-formylglutathione hydrolase  52.08 
 
 
276 aa  270  1e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.217643  normal  0.707698 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4023  carboxylesterase  53.38 
 
 
287 aa  270  1e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.707301 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1087  S-formylglutathione hydrolase  45.99 
 
 
283 aa  271  1e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1026  S-formylglutathione hydrolase  50 
 
 
286 aa  270  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.199417  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0474  S-formylglutathione hydrolase  48.55 
 
 
275 aa  270  2e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2252  carboxylesterase  48.56 
 
 
283 aa  270  2e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.493434  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0863  S-formylglutathione hydrolase  50 
 
 
286 aa  270  2e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0867  S-formylglutathione hydrolase  50 
 
 
286 aa  270  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0386  S-formylglutathione hydrolase  46.93 
 
 
277 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.94847  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1666  S-formylglutathione hydrolase  48.55 
 
 
281 aa  269  4e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.37813  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2801  carboxylesterase  49.47 
 
 
294 aa  269  4e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.234504 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2291  S-formylglutathione hydrolase  49.47 
 
 
294 aa  268  5e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>