17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0883 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_0883  hypothetical protein  100 
 
 
682 aa  1408    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.888299  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1987  hypothetical protein  30.16 
 
 
700 aa  281  3e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5020  phospholipase/Carboxylesterase  23.33 
 
 
563 aa  101  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.780509  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1229  hypothetical protein  22.55 
 
 
816 aa  90.9  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.737589  hitchhiker  0.00225369 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5819  hypothetical protein  22.22 
 
 
816 aa  65.9  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.438939  decreased coverage  0.00192823 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0409  phospholipase/Carboxylesterase  30.32 
 
 
277 aa  63.9  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00373212  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3037  hypothetical protein  43.64 
 
 
850 aa  55.1  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.762203  normal  0.221922 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2978  hypothetical protein  23.83 
 
 
777 aa  53.1  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0780  hypothetical protein  26.8 
 
 
752 aa  50.4  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.893714 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0799  hypothetical protein  26.8 
 
 
752 aa  50.1  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.666809  normal  0.067283 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0784  hypothetical protein  26.8 
 
 
752 aa  50.1  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  30.56 
 
 
1002 aa  47  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5113  esterase, PHB depolymerase  38.1 
 
 
370 aa  45.4  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.841359  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5249  phospholipase/carboxylesterase  39.44 
 
 
243 aa  45.1  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0855258  normal  0.417619 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0912  phospholipase/carboxylesterase  24.32 
 
 
417 aa  44.7  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0349753  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1183  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.44 
 
 
910 aa  44.3  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4144  phospholipase/carboxylesterase  28.57 
 
 
217 aa  44.3  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.111836 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>