36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2978 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2978  hypothetical protein  100 
 
 
777 aa  1567    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5020  phospholipase/Carboxylesterase  26.8 
 
 
563 aa  122  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.780509  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0409  phospholipase/Carboxylesterase  26.05 
 
 
277 aa  83.6  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00373212  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1105  phospholipase/carboxylesterase  26.96 
 
 
253 aa  75.1  0.000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.320599  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0242  phospholipase/Carboxylesterase  26.2 
 
 
412 aa  73.6  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.080802  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0912  phospholipase/carboxylesterase  23.73 
 
 
417 aa  73.2  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0349753  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1229  hypothetical protein  21.9 
 
 
816 aa  72.4  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.737589  hitchhiker  0.00225369 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0890  phospholipase/carboxylesterase  22.88 
 
 
417 aa  70.1  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00284338  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1987  hypothetical protein  29.02 
 
 
700 aa  67.4  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6990  phospholipase/Carboxylesterase  32.56 
 
 
276 aa  67.4  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0030979 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0883  hypothetical protein  23.83 
 
 
682 aa  66.2  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.888299  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3037  hypothetical protein  22.03 
 
 
850 aa  65.9  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.762203  normal  0.221922 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4230  phospholipase/Carboxylesterase  29.13 
 
 
268 aa  65.1  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.58568  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5409  phospholipase/Carboxylesterase  25.84 
 
 
468 aa  63.2  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.301225 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3048  phospholipase/Carboxylesterase  28.83 
 
 
405 aa  60.8  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5819  hypothetical protein  20.55 
 
 
816 aa  60.1  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.438939  decreased coverage  0.00192823 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0514  phospholipase/carboxylesterase  31.62 
 
 
249 aa  60.1  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.463342  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1716  phospholipase/Carboxylesterase  32.81 
 
 
217 aa  59.3  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0088  phospholipase/Carboxylesterase  24.37 
 
 
255 aa  57.8  0.0000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1020  hypothetical protein  31.3 
 
 
260 aa  57.4  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0696  phospholipase/Carboxylesterase  35.71 
 
 
218 aa  56.2  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0780  hypothetical protein  30.77 
 
 
752 aa  55.1  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.893714 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0799  hypothetical protein  30.77 
 
 
752 aa  54.3  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.666809  normal  0.067283 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0784  hypothetical protein  30.77 
 
 
752 aa  54.3  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6506  phospholipase/Carboxylesterase  33.65 
 
 
264 aa  52  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0298565  normal  0.36318 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3399  phospholipase/Carboxylesterase  27.27 
 
 
886 aa  50.4  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0843548  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4144  phospholipase/carboxylesterase  27.82 
 
 
217 aa  48.1  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.111836 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3188  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.57 
 
 
612 aa  47.8  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2160  peptidase-like protein  30.21 
 
 
474 aa  47.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.762197 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2538  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  37.1 
 
 
611 aa  45.8  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3742  peptidase-like protein  28.57 
 
 
326 aa  45.8  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1149  Acylaminoacyl-peptidase  30.36 
 
 
618 aa  45.8  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0889139 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02216  phospholipase/carboxylesterase superfamily  26.24 
 
 
245 aa  45.4  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.195432  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3746  peptidase-like  26.09 
 
 
325 aa  45.4  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.841468 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2269  hypothetical protein  21.4 
 
 
261 aa  45.1  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.187168  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3641  phospholipase/carboxylesterase  29.59 
 
 
257 aa  44.3  0.009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>