171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1020 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_1020  hypothetical protein  100 
 
 
260 aa  527  1e-149  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1105  phospholipase/carboxylesterase  47.69 
 
 
253 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.320599  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4230  phospholipase/Carboxylesterase  42.61 
 
 
268 aa  181  9.000000000000001e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.58568  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6990  phospholipase/Carboxylesterase  38.79 
 
 
276 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0030979 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3522  phospholipase/carboxylesterase  36.55 
 
 
237 aa  149  6e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.406594  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02216  phospholipase/carboxylesterase superfamily  36.28 
 
 
245 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.195432  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0696  phospholipase/Carboxylesterase  37.31 
 
 
218 aa  130  3e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0944  hypothetical protein  36.4 
 
 
265 aa  129  5.0000000000000004e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.992264  normal  0.367367 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5249  phospholipase/carboxylesterase  36.27 
 
 
243 aa  129  7.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0855258  normal  0.417619 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0409  phospholipase/Carboxylesterase  38.03 
 
 
277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00373212  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1716  phospholipase/Carboxylesterase  38.54 
 
 
217 aa  126  3e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3641  phospholipase/carboxylesterase  30.74 
 
 
257 aa  116  5e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0890  phospholipase/carboxylesterase  30.08 
 
 
417 aa  116  5e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00284338  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0088  phospholipase/Carboxylesterase  29.53 
 
 
255 aa  115  6e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0912  phospholipase/carboxylesterase  31.67 
 
 
417 aa  115  6e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0349753  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6203  phospholipase/Carboxylesterase  36.22 
 
 
292 aa  109  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5409  phospholipase/Carboxylesterase  33.49 
 
 
468 aa  109  6e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.301225 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0242  phospholipase/Carboxylesterase  29.46 
 
 
412 aa  108  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.080802  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3399  phospholipase/Carboxylesterase  31.03 
 
 
886 aa  105  7e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0843548  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3048  phospholipase/Carboxylesterase  29.26 
 
 
405 aa  102  7e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0514  phospholipase/carboxylesterase  28.46 
 
 
249 aa  100  3e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.463342  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4144  phospholipase/carboxylesterase  30.27 
 
 
217 aa  99  7e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.111836 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4415  peptidase-like protein  29.96 
 
 
384 aa  98.6  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2160  peptidase-like protein  43.48 
 
 
474 aa  97.4  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.762197 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2269  hypothetical protein  30.47 
 
 
261 aa  93.6  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.187168  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3746  peptidase-like  37.5 
 
 
325 aa  93.2  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.841468 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6506  phospholipase/Carboxylesterase  30.7 
 
 
264 aa  90.9  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0298565  normal  0.36318 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3714  PKD domain containing protein  31.14 
 
 
1771 aa  90.5  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333758  normal  0.0659323 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3742  peptidase-like protein  36.29 
 
 
326 aa  88.2  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3704  PA14 domain protein  29.56 
 
 
2334 aa  81.6  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.205023 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1124  phospholipase/Carboxylesterase  25.89 
 
 
257 aa  77  0.0000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5020  phospholipase/Carboxylesterase  28.12 
 
 
563 aa  74.3  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.780509  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1400  phospholipase/Carboxylesterase  29.93 
 
 
325 aa  64.3  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3696  peptidase-like protein  28.38 
 
 
261 aa  63.5  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.826453  normal  0.469025 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2408  carbohydrate esterase family 1 protein  27.96 
 
 
316 aa  63.2  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.211104  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07050  hypothetical protein  32.53 
 
 
322 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1603  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.53 
 
 
328 aa  60.1  0.00000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5113  esterase, PHB depolymerase  26.04 
 
 
370 aa  59.7  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.841359  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0548  phospholipase/Carboxylesterase  28.16 
 
 
358 aa  58.9  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.185297  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1493  phospholipase/Carboxylesterase  25.44 
 
 
317 aa  58.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.030471  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1204  phospholipase/carboxylesterase  30.47 
 
 
335 aa  57.4  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.299935  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1651  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  25.71 
 
 
323 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0627752  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1573  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  29.17 
 
 
326 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1229  hypothetical protein  30.68 
 
 
816 aa  53.9  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.737589  hitchhiker  0.00225369 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2825  putative esterase  28.15 
 
 
319 aa  53.5  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0646  hypothetical protein  33.33 
 
 
322 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399454  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3306  phospholipase/carboxylesterase family protein  27.8 
 
 
240 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.703144  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3244  phospholipase/carboxylesterase  25 
 
 
245 aa  52.8  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33500  esterase, poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  27.6 
 
 
429 aa  52.8  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2731  beta-lactamase  30 
 
 
640 aa  52.4  0.000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1167  hypothetical protein  27.54 
 
 
471 aa  52.4  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.428408  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2066  phospholipase/carboxylesterase  25.62 
 
 
238 aa  52  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.565731  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4615  PHB depolymerase family esterase  33.68 
 
 
359 aa  51.6  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4595  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  38.55 
 
 
344 aa  52  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0490  hypothetical protein  27.91 
 
 
357 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.637254  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1987  hypothetical protein  28.23 
 
 
700 aa  51.2  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0185  hypothetical protein  26.97 
 
 
446 aa  50.8  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000162284  hitchhiker  0.000128495 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3140  phospholipase/carboxylesterase  25.25 
 
 
240 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0649605  normal  0.347756 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3911  peptidase-like protein  29.85 
 
 
286 aa  50.4  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.363292  normal  0.0153976 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3106  putative lipoprotein  29.14 
 
 
341 aa  50.1  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4362  PHB depolymerase family esterase  26.04 
 
 
576 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1106  hypothetical protein  28.21 
 
 
355 aa  49.7  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.117901 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0718  hypothetical protein  26.37 
 
 
452 aa  50.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0790  hypothetical protein  26.37 
 
 
452 aa  50.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3966  phospholipase/carboxylesterase  34.57 
 
 
795 aa  49.7  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  28.57 
 
 
1002 aa  49.7  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5085  polyhydroxybutyrate depolymerase  28.57 
 
 
313 aa  49.7  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  normal  0.355318 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1052  phospholipase/carboxylesterase  28.76 
 
 
365 aa  49.7  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0243  carboxymethylenebutenolidase  26.54 
 
 
278 aa  49.7  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3127  phospholipase/Carboxylesterase  25.5 
 
 
314 aa  49.3  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.539584 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1289  putative esterase  28.47 
 
 
290 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2544  putative esterase  28.47 
 
 
290 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110736  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0267  putative esterase  28.47 
 
 
281 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0537  putative esterase  28.47 
 
 
281 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1370  putative esterase  28.47 
 
 
281 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0298  putative esterase  25.32 
 
 
286 aa  48.1  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.777822  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1290  putative esterase  28.47 
 
 
281 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.601203  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3933  Carboxymethylenebutenolidase  26.26 
 
 
275 aa  48.5  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1030  putative esterase  28.47 
 
 
281 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2978  hypothetical protein  31.3 
 
 
777 aa  48.5  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1701  hypothetical protein  27.54 
 
 
291 aa  47.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.202768  normal  0.542752 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2846  esterase, PHB depolymerase  26.91 
 
 
398 aa  47.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.222858  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0335  phospholipase/carboxylesterase  26.7 
 
 
357 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.64094  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3867  esterase, PHB depolymerase  28.3 
 
 
404 aa  47.4  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.10201  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0373  polyhydroxybutyrate depolymerase  30.25 
 
 
357 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0880654  hitchhiker  0.00622899 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2656  putative esterase  27.13 
 
 
299 aa  47.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.224607  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4302  dienelactone hydrolase family protein  28.95 
 
 
270 aa  47.8  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6802  esterase, PHB depolymerase family  26.77 
 
 
398 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0419644  decreased coverage  0.000000125026 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2216  dienelactone hydrolase  30.77 
 
 
291 aa  47.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.60917  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1211  esterase, PHB depolymerase family  26.24 
 
 
312 aa  47  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0349548 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3270  esterase, PHB depolymerase  26.18 
 
 
372 aa  47  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.67973 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0579  esterase, putative  29.33 
 
 
324 aa  47  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2650  hypothetical protein  27.86 
 
 
355 aa  47  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.376354  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1285  esterase, PHB depolymerase family  26.24 
 
 
367 aa  47  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.29485  normal  0.060549 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03717  predicted hydrolase  28.95 
 
 
269 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4351  dienelactone hydrolase family protein  28.95 
 
 
271 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2918  phospholipase/carboxylesterase  25.15 
 
 
218 aa  46.6  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4825  carboxymethylenebutenolidase  30.77 
 
 
291 aa  46.6  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00463404  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4301  PHB depolymerase family esterase  29.45 
 
 
368 aa  46.6  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4206  dienelactone hydrolase family protein  29.7 
 
 
269 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000877073 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>