80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0490 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0490  hypothetical protein  100 
 
 		 357 aa  703    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.637254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0335  phospholipase/carboxylesterase  85.39 
 
 		 357 aa  610  1e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.64094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0548  phospholipase/Carboxylesterase  75.35 
 
 		 358 aa  545  1e-154  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.185297  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1106  hypothetical protein  64.59 
 
 		 355 aa  450  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.117901 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1052  phospholipase/carboxylesterase  51.11 
 
 		 365 aa  338  7e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2287  phospholipase/Carboxylesterase  34.72 
 
 		 263 aa  84  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.191504  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0409  phospholipase/Carboxylesterase  32.02 
 
 		 277 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00373212  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1148  phospholipase/Carboxylesterase  29.47 
 
 		 239 aa  76.3  0.0000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1368  phospholipase/Carboxylesterase  30.53 
 
 		 239 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0890  phospholipase/carboxylesterase  26.83 
 
 		 417 aa  72.8  0.000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00284338  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1208  phospholipase/carboxylesterase  30 
 
 		 239 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.12535 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6756  phospholipase/carboxylesterase  28.12 
 
 		 225 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.847027  normal  0.369639 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0912  phospholipase/carboxylesterase  26.83 
 
 		 417 aa  70.9  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0349753  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4839  phospholipase/Carboxylesterase  29.47 
 
 		 232 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5584  phospholipase/carboxylesterase  31.4 
 
 		 231 aa  70.1  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4614  phospholipase/Carboxylesterase  30.77 
 
 		 238 aa  67  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.376672 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3855  phospholipase/Carboxylesterase  32.8 
 
 		 226 aa  67  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0242  phospholipase/Carboxylesterase  27.89 
 
 		 412 aa  65.9  0.0000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.080802  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0060  phospholipase/carboxylesterase  32.37 
 
 		 226 aa  65.1  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.885579  normal  0.31865 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1400  phospholipase/Carboxylesterase  28.26 
 
 		 325 aa  64.3  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5020  phospholipase/Carboxylesterase  24.08 
 
 		 563 aa  62.4  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.780509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0063  phospholipase/carboxylesterase  31.44 
 
 		 227 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.982882  normal  0.670301 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1105  phospholipase/carboxylesterase  25.97 
 
 		 253 aa  60.1  0.00000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.320599  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4055  phospholipase/carboxylesterase  28.06 
 
 		 242 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.342724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1493  phospholipase/Carboxylesterase  30.3 
 
 		 317 aa  57.4  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.030471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2269  hypothetical protein  28.91 
 
 		 261 aa  56.2  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.187168  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1716  phospholipase/Carboxylesterase  28.19 
 
 		 217 aa  55.8  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4173  phospholipase/carboxylesterase  23.96 
 
 		 225 aa  53.9  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741665  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4230  phospholipase/Carboxylesterase  26.99 
 
 		 268 aa  53.1  0.000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.58568  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0185  hypothetical protein  23.93 
 
 		 446 aa  53.1  0.000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000162284  hitchhiker  0.000128495 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0696  phospholipase/Carboxylesterase  28.18 
 
 		 218 aa  53.1  0.000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3399  phospholipase/Carboxylesterase  24.88 
 
 		 886 aa  52.4  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0843548  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7236  putative LpqP (hydrolase/esterase)  33.33 
 
 		 405 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0397136  normal  0.31443 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3048  phospholipase/Carboxylesterase  21.05 
 
 		 405 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2408  carbohydrate esterase family 1 protein  26.38 
 
 		 316 aa  50.8  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.211104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2537  phospholipase/carboxylesterase  27.44 
 
 		 219 aa  50.8  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.311842  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1983  phospholipase/Carboxylesterase  30.6 
 
 		 217 aa  50.4  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0573653  normal  0.134179 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1020  hypothetical protein  27.91 
 
 		 260 aa  50.1  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2931  phospholipase/carboxylesterase  32.31 
 
 		 222 aa  49.7  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1773  phospholipase/Carboxylesterase  28.57 
 
 		 239 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4424  phospholipase/Carboxylesterase  29.51 
 
 		 204 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1893  phospholipase/Carboxylesterase  32.14 
 
 		 223 aa  48.5  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4488  phospholipase/Carboxylesterase  29.51 
 
 		 204 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.332778 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3106  putative lipoprotein  28.16 
 
 		 341 aa  48.1  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3966  phospholipase/carboxylesterase  24.38 
 
 		 795 aa  48.1  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1204  phospholipase/carboxylesterase  31.71 
 
 		 335 aa  48.5  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.299935  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6990  phospholipase/Carboxylesterase  23.53 
 
 		 276 aa  48.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030979 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5085  polyhydroxybutyrate depolymerase  31.25 
 
 		 313 aa  47.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  normal  0.355318 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  27.08 
 
 		 1002 aa  47.4  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0686  phospholipase/carboxylesterase  27.43 
 
 		 232 aa  47.4  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1955  phospholipase/carboxylesterase  27.42 
 
 		 222 aa  47.4  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3742  peptidase-like protein  27.14 
 
 		 326 aa  47  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1633  carboxylesterase  32.69 
 
 		 223 aa  46.6  0.0006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00846065 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0718  hypothetical protein  23.08 
 
 		 452 aa  46.6  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0790  hypothetical protein  23.08 
 
 		 452 aa  46.6  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0297  lpqC, putative  27.27 
 
 		 306 aa  46.2  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.433259  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02216  phospholipase/carboxylesterase superfamily  27.42 
 
 		 245 aa  46.2  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.195432  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2092  phospholipase/Carboxylesterase  30.36 
 
 		 224 aa  45.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.907639 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1454  phospholipase/carboxylesterase family protein  31.73 
 
 		 223 aa  44.7  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.105501  normal  0.208922 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0967  carboxylesterase  30.93 
 
 		 221 aa  45.1  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000584217 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5409  phospholipase/Carboxylesterase  23.04 
 
 		 468 aa  45.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.301225 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3244  phospholipase/carboxylesterase  23.59 
 
 		 245 aa  44.3  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1107  carboxylesterase  30.39 
 
 		 225 aa  44.7  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.175918  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0108  phospholipase/carboxylesterase family protein  28.44 
 
 		 222 aa  43.9  0.004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000237023  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4415  peptidase-like protein  25.29 
 
 		 384 aa  43.9  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2056  esterase, PHB depolymerase family  28.64 
 
 		 334 aa  43.9  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2160  peptidase-like protein  27.59 
 
 		 474 aa  43.9  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.762197 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5026  hypothetical protein  26.7 
 
 		 326 aa  43.5  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1632  phospholipase/carboxylesterase  33.06 
 
 		 224 aa  43.5  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2074  carboxylesterase  28.44 
 
 		 236 aa  43.5  0.006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.439919  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2061  phospholipase/Carboxylesterase  27.81 
 
 		 223 aa  43.5  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2724  phospholipase/carboxylesterase  27.27 
 
 		 237 aa  43.5  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.124054  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0353  hypothetical protein  24.23 
 
 		 261 aa  43.5  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.528975 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3813  phospholipase/carboxylesterase  25.52 
 
 		 230 aa  43.1  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0993955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2297  phospholipase/carboxylesterase  25.81 
 
 		 238 aa  43.1  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.563406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1698  phospholipase/Carboxylesterase  26.29 
 
 		 222 aa  43.1  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.675921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  24.2 
 
 		 837 aa  43.1  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2752  phospholipase/carboxylesterase  28.47 
 
 		 309 aa  42.7  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05267  feruloyl esterase (Eurofung)  25.32 
 
 		 270 aa  42.7  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3891  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  24.32 
 
 		 298 aa  42.7  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.947481  normal  0.780646 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>