125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II0297 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007650  BTH_II0297  lpqC, putative  100 
 
 		 306 aa  623  1e-177  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.433259  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3127  phospholipase/Carboxylesterase  39.79 
 
 		 314 aa  209  5e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.539584 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07050  hypothetical protein  39.07 
 
 		 322 aa  189  4e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0646  hypothetical protein  40.14 
 
 		 322 aa  187  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399454  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1400  phospholipase/Carboxylesterase  32.86 
 
 		 325 aa  144  2e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1204  phospholipase/carboxylesterase  35.29 
 
 		 335 aa  137  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.299935  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0579  esterase, putative  30.3 
 
 		 324 aa  122  7e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3485  hypothetical protein  38.11 
 
 		 269 aa  120  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5398  hypothetical protein  33.33 
 
 		 302 aa  119  6e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.330044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1969  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  36.4 
 
 		 363 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0935555 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3891  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  33.62 
 
 		 298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.947481  normal  0.780646 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5085  polyhydroxybutyrate depolymerase  35.02 
 
 		 313 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  normal  0.355318 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3217  hypothetical protein  34.68 
 
 		 282 aa  106  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4595  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  33.21 
 
 		 344 aa  105  9e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1590  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  34.36 
 
 		 353 aa  102  7e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255211  normal  0.12664 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10685  lipoprotein lpqP  38.07 
 
 		 280 aa  100  5e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.132448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2408  carbohydrate esterase family 1 protein  26.91 
 
 		 316 aa  92.8  6e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.211104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0072  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  36.19 
 
 		 392 aa  92.8  7e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0967  putative esterase  34.4 
 
 		 244 aa  92.8  7e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.127871 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4460  polyhydroxybutyrate depolymerase  31.54 
 
 		 322 aa  92.4  8e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.403398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1573  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  29.27 
 
 		 326 aa  89.7  5e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2752  phospholipase/carboxylesterase  31.01 
 
 		 309 aa  87  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1651  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  28.67 
 
 		 323 aa  87  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0627752  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7236  putative LpqP (hydrolase/esterase)  36.48 
 
 		 405 aa  85.9  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0397136  normal  0.31443 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  25.98 
 
 		 1002 aa  85.1  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1493  phospholipase/Carboxylesterase  30.73 
 
 		 317 aa  83.2  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.030471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1290  hypothetical protein  36.97 
 
 		 305 aa  83.2  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3566  phospholipase/carboxylesterase  32.17 
 
 		 331 aa  81.6  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3854  putative lipoprotein  32.44 
 
 		 336 aa  80.5  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.496382  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0373  polyhydroxybutyrate depolymerase  33.16 
 
 		 357 aa  78.2  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0880654  hitchhiker  0.00622899 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3106  putative lipoprotein  30.74 
 
 		 341 aa  77  0.0000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3966  phospholipase/carboxylesterase  25.48 
 
 		 795 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1385  putative Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  26.47 
 
 		 464 aa  68.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.516849  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13327  esterase lipoprotein lpqC  32.5 
 
 		 304 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000167103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1167  hypothetical protein  26.95 
 
 		 471 aa  67  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.428408  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0080  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  31.01 
 
 		 286 aa  66.2  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2261  putative esterase/lipase/thioesterase  30.36 
 
 		 361 aa  65.5  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556081  normal  0.0820217 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4602  esterase, PHB depolymerase  32.84 
 
 		 317 aa  63.2  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.462256  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3576  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  28.06 
 
 		 451 aa  62.8  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.875939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92192  predicted protein  26.61 
 
 		 486 aa  62.8  0.000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.865019  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4749  esterase, PHB depolymerase family  34.56 
 
 		 343 aa  62  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2906  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  26.86 
 
 		 659 aa  60.8  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.686004  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0713  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  29.67 
 
 		 287 aa  60.8  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00180  conserved hypothetical protein  32.37 
 
 		 340 aa  60.5  0.00000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1658  hypothetical protein  33.6 
 
 		 342 aa  58.5  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.32348  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3660  PHB depolymerase family esterase  33.57 
 
 		 381 aa  57  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.741995  normal  0.231581 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1953  putative hydrolase  26.49 
 
 		 308 aa  56.2  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0001445  hitchhiker  0.00199711 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0726  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  28.89 
 
 		 462 aa  56.2  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401494  normal  0.100919 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2991  PHB depolymerase family esterase  38.61 
 
 		 419 aa  55.8  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0082  esterase, PHB depolymerase  25 
 
 		 414 aa  55.5  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0137  esterase, PHB depolymerase  30.18 
 
 		 392 aa  54.3  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0048  esterase, PHB depolymerase family  29.84 
 
 		 417 aa  53.9  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616843 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2633  PHB depolymerase family esterase  28.68 
 
 		 422 aa  53.9  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.655829 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4839  phospholipase/Carboxylesterase  30.54 
 
 		 232 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3290  esterase, PHB depolymerase family  31.01 
 
 		 450 aa  53.5  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2301  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  28.96 
 
 		 232 aa  52.8  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1514  carboxylesterase  32.56 
 
 		 231 aa  52  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0210024  hitchhiker  0.000187448 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0108  phospholipase/carboxylesterase family protein  29.41 
 
 		 222 aa  52  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000237023  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9052  polyhydroxybutyrate depolymerase  29.77 
 
 		 366 aa  52  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1167  carboxylesterase, putative  40.79 
 
 		 228 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00098882  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2107  carboxylesterase  40.79 
 
 		 228 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.213325  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2404  carboxylesterase, putative  37.25 
 
 		 319 aa  51.6  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0171467  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0364  putative polyhydroxybutyrate depolymerase  30.3 
 
 		 265 aa  51.6  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.81916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1610  phospholipase/carboxylesterase  40.79 
 
 		 228 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.247692  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0272  putative carboxylesterase  40.79 
 
 		 228 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0149548  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1942  phospholipase/carboxylesterase  40.79 
 
 		 228 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1958  phospholipase/carboxylesterase  40.79 
 
 		 228 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0275939  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2074  carboxylesterase  28.93 
 
 		 236 aa  51.6  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.439919  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4407  PHB depolymerase family esterase  27.21 
 
 		 398 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.32684  normal  0.707171 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04140  carboxylesterase  34.88 
 
 		 222 aa  51.2  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.628824  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1211  esterase, PHB depolymerase family  27.33 
 
 		 312 aa  51.2  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0349548 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4958  esterase, PHB depolymerase family  29.66 
 
 		 451 aa  50.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.348858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1148  phospholipase/Carboxylesterase  28.49 
 
 		 239 aa  49.3  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2257  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  23.91 
 
 		 270 aa  49.7  0.00007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3533  Carboxylesterase  32.95 
 
 		 219 aa  49.7  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.755115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0568  esterase, PHB depolymerase family  29.17 
 
 		 395 aa  49.3  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0711  esterase, PHB depolymerase  28.38 
 
 		 392 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.612274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3591  esterase, PHB depolymerase family  28.77 
 
 		 518 aa  48.9  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2061  phospholipase/Carboxylesterase  27.23 
 
 		 223 aa  48.5  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7674  putative polyhydroxy-alkanoate/butyrate(PHA/PHB) depolymerase  30.77 
 
 		 529 aa  47.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2931  phospholipase/carboxylesterase  27.87 
 
 		 222 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1368  phospholipase/Carboxylesterase  28 
 
 		 239 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0335  phospholipase/carboxylesterase  27.59 
 
 		 357 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.64094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1990  esterase, PHB depolymerase family  30.56 
 
 		 406 aa  47  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000642829  normal  0.085302 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1208  phospholipase/carboxylesterase  27.27 
 
 		 239 aa  47  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.12535 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2846  esterase, PHB depolymerase  28.03 
 
 		 398 aa  46.6  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.222858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31730  esterase, PHB depolymerase family  28.35 
 
 		 331 aa  46.6  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4883  PHB depolymerase family esterase  29.46 
 
 		 369 aa  46.6  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103512  hitchhiker  0.0011428 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0490  hypothetical protein  27.27 
 
 		 357 aa  46.2  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.637254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4502  esterase, PHB depolymerase  26.47 
 
 		 365 aa  46.2  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.42248  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3862  PHB depolymerase family esterase  26.47 
 
 		 365 aa  46.2  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0810078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3665  PHB depolymerase family esterase  26.47 
 
 		 365 aa  46.2  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.131134  normal  0.75521 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1463  esterase, PHB depolymerase family  30.65 
 
 		 363 aa  46.2  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0308241  normal  0.241375 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1633  carboxylesterase  29.73 
 
 		 223 aa  45.1  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00846065 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0640  Alpha/beta hydrolase  23.28 
 
 		 303 aa  45.4  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.225482 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1173  esterase, PHB depolymerase family  25.17 
 
 		 410 aa  45.4  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4301  PHB depolymerase family esterase  31.78 
 
 		 368 aa  45.8  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0371  esterase, PHB depolymerase  32.43 
 
 		 394 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1228  carboxylesterase  27.97 
 
 		 224 aa  44.3  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3487  hypothetical protein  21.43 
 
 		 332 aa  44.3  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>