70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1208 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1208  phospholipase/carboxylesterase  100 
 
 		 239 aa  473  1e-132  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.12535 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1368  phospholipase/Carboxylesterase  99.16 
 
 		 239 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1148  phospholipase/Carboxylesterase  89.5 
 
 		 239 aa  424  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4839  phospholipase/Carboxylesterase  79.11 
 
 		 232 aa  348  4e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5584  phospholipase/carboxylesterase  73.78 
 
 		 231 aa  319  3e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4055  phospholipase/carboxylesterase  80.27 
 
 		 242 aa  309  2e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.342724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0060  phospholipase/carboxylesterase  69.06 
 
 		 226 aa  273  1.0000000000000001e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.885579  normal  0.31865 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6756  phospholipase/carboxylesterase  58.48 
 
 		 225 aa  262  4e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.847027  normal  0.369639 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4173  phospholipase/carboxylesterase  56.5 
 
 		 225 aa  257  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741665  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4614  phospholipase/Carboxylesterase  43.84 
 
 		 238 aa  158  7e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.376672 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1773  phospholipase/Carboxylesterase  43.58 
 
 		 239 aa  153  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2287  phospholipase/Carboxylesterase  43.22 
 
 		 263 aa  152  5e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.191504  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0063  phospholipase/carboxylesterase  40.09 
 
 		 227 aa  145  5e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.982882  normal  0.670301 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3855  phospholipase/Carboxylesterase  43.75 
 
 		 226 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1052  phospholipase/carboxylesterase  35.38 
 
 		 365 aa  92  7e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0548  phospholipase/Carboxylesterase  32.12 
 
 		 358 aa  77  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.185297  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0335  phospholipase/carboxylesterase  32.64 
 
 		 357 aa  75.9  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.64094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1106  hypothetical protein  32.43 
 
 		 355 aa  75.9  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.117901 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0490  hypothetical protein  30 
 
 		 357 aa  71.6  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.637254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3106  putative lipoprotein  28.28 
 
 		 341 aa  59.7  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2261  putative esterase/lipase/thioesterase  30.72 
 
 		 361 aa  56.6  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556081  normal  0.0820217 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3966  phospholipase/carboxylesterase  26.11 
 
 		 795 aa  54.7  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1204  phospholipase/carboxylesterase  27.4 
 
 		 335 aa  54.7  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.299935  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0054  carboxylesterase  25.21 
 
 		 248 aa  53.9  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.691003  normal  0.104617 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3399  phospholipase/Carboxylesterase  27.18 
 
 		 886 aa  51.6  0.000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0843548  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2306  phospholipase/carboxylesterase  29.38 
 
 		 235 aa  50.4  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.412885  hitchhiker  0.00320087 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0297  lpqC, putative  27.87 
 
 		 306 aa  50.4  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.433259  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5020  phospholipase/Carboxylesterase  24.39 
 
 		 563 aa  49.7  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.780509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  27.47 
 
 		 461 aa  49.7  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5017  phospholipase/Carboxylesterase  26.63 
 
 		 205 aa  49.7  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122217  normal  0.0411034 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1493  phospholipase/Carboxylesterase  26.01 
 
 		 317 aa  49.7  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.030471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3487  hypothetical protein  28.78 
 
 		 332 aa  48.9  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3127  phospholipase/Carboxylesterase  24.48 
 
 		 314 aa  48.9  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.539584 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2257  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  28.8 
 
 		 270 aa  48.5  0.00008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03001  esterase  25.39 
 
 		 205 aa  48.5  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.66751  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05267  feruloyl esterase (Eurofung)  25 
 
 		 270 aa  48.5  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1536  putative polyhydroxybutyrate depolymerase  25.13 
 
 		 276 aa  47.8  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.26582  normal  0.221996 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1240  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  30.36 
 
 		 370 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.194401 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2931  phospholipase/carboxylesterase  31.82 
 
 		 222 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1272  Carboxylesterase  24.35 
 
 		 220 aa  47  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4488  phospholipase/Carboxylesterase  23.44 
 
 		 204 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.332778 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3866  hypothetical protein  29.94 
 
 		 302 aa  46.6  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.178954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2408  carbohydrate esterase family 1 protein  29.63 
 
 		 316 aa  46.6  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.211104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4424  phospholipase/Carboxylesterase  23.44 
 
 		 204 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1983  phospholipase/Carboxylesterase  26.29 
 
 		 217 aa  45.4  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0573653  normal  0.134179 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2297  phospholipase/carboxylesterase  28.06 
 
 		 238 aa  44.7  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.563406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1208  phospholipase/Carboxylesterase  25.14 
 
 		 223 aa  44.7  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0941  phospholipase/carboxylesterase  28.09 
 
 		 552 aa  45.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.443784 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5170  phospholipase/Carboxylesterase  25.78 
 
 		 255 aa  44.7  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.649523 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0092  phospholipase/Carboxylesterase  20.79 
 
 		 248 aa  44.7  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.898581  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0353  hypothetical protein  26.67 
 
 		 261 aa  44.7  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.528975 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3198  putative polyhydroxybutyrate depolymerase  26.17 
 
 		 279 aa  44.3  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.396095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2412  phospholipase/carboxylesterase  30.17 
 
 		 227 aa  43.9  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0536257  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1899  Carboxylesterase  32.03 
 
 		 226 aa  44.3  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0365567  normal  0.41049 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3842  phospholipase/carboxylesterase  28.98 
 
 		 236 aa  44.3  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0373  polyhydroxybutyrate depolymerase  29.45 
 
 		 357 aa  43.5  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0880654  hitchhiker  0.00622899 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7236  putative LpqP (hydrolase/esterase)  26.95 
 
 		 405 aa  43.1  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0397136  normal  0.31443 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0355  phospholipase/Carboxylesterase  24.44 
 
 		 207 aa  42.7  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0220103  normal  0.29368 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00900  dienelactone hydrolase-like enzyme  26.63 
 
 		 241 aa  42.7  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3639  Carboxylesterase  27.52 
 
 		 223 aa  42.7  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3402  carboxylesterase  23.92 
 
 		 220 aa  42.7  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10685  lipoprotein lpqP  29.41 
 
 		 280 aa  42.4  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.132448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1590  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  29.86 
 
 		 353 aa  42.4  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255211  normal  0.12664 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2724  phospholipase/carboxylesterase  30.09 
 
 		 237 aa  42.4  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.124054  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2498  phospholipase/carboxylesterase  22.62 
 
 		 220 aa  42.4  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02941  esterase  23.9 
 
 		 201 aa  42.4  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.545653  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2932  hypothetical protein  29.08 
 
 		 399 aa  42  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00180  conserved hypothetical protein  28.25 
 
 		 340 aa  42  0.009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_52268  lysophospholipase  25 
 
 		 209 aa  41.6  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1955  phospholipase/carboxylesterase  31.55 
 
 		 222 aa  41.6  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>