50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3742 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_3742  peptidase-like protein  100 
 
 
326 aa  674    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2160  peptidase-like protein  63.8 
 
 
474 aa  445  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.762197 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5409  phospholipase/Carboxylesterase  42.81 
 
 
468 aa  235  6e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.301225 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0088  phospholipase/Carboxylesterase  37.44 
 
 
255 aa  152  5e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0890  phospholipase/carboxylesterase  34.84 
 
 
417 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00284338  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0912  phospholipase/carboxylesterase  34.84 
 
 
417 aa  127  3e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0349753  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6506  phospholipase/Carboxylesterase  32.03 
 
 
264 aa  125  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0298565  normal  0.36318 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3641  phospholipase/carboxylesterase  30.8 
 
 
257 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0242  phospholipase/Carboxylesterase  33.78 
 
 
412 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.080802  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0696  phospholipase/Carboxylesterase  38.1 
 
 
218 aa  117  3.9999999999999997e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1105  phospholipase/carboxylesterase  34.54 
 
 
253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.320599  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0514  phospholipase/carboxylesterase  32.02 
 
 
249 aa  105  8e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.463342  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6990  phospholipase/Carboxylesterase  43.22 
 
 
276 aa  105  8e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0030979 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3048  phospholipase/Carboxylesterase  30.51 
 
 
405 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0409  phospholipase/Carboxylesterase  28.09 
 
 
277 aa  102  6e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00373212  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1716  phospholipase/Carboxylesterase  34.15 
 
 
217 aa  101  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1124  phospholipase/Carboxylesterase  26.89 
 
 
257 aa  100  5e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02216  phospholipase/carboxylesterase superfamily  29.52 
 
 
245 aa  98.6  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.195432  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4230  phospholipase/Carboxylesterase  37.6 
 
 
268 aa  97.8  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.58568  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3399  phospholipase/Carboxylesterase  30.1 
 
 
886 aa  94.7  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0843548  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3522  phospholipase/carboxylesterase  34.78 
 
 
237 aa  91.3  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.406594  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1020  hypothetical protein  36.29 
 
 
260 aa  88.2  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5020  phospholipase/Carboxylesterase  27.91 
 
 
563 aa  77  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.780509  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3746  peptidase-like  35.04 
 
 
325 aa  77  0.0000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.841468 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0944  hypothetical protein  32.39 
 
 
265 aa  76.3  0.0000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.992264  normal  0.367367 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2269  hypothetical protein  28.63 
 
 
261 aa  75.5  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.187168  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5249  phospholipase/carboxylesterase  27.65 
 
 
243 aa  72.8  0.000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0855258  normal  0.417619 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4144  phospholipase/carboxylesterase  31.41 
 
 
217 aa  72.4  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.111836 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3704  PA14 domain protein  31.82 
 
 
2334 aa  61.6  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.205023 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2781  hypothetical protein  32.35 
 
 
796 aa  57.8  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.216427  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0335  phospholipase/carboxylesterase  30.29 
 
 
357 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.64094  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1861  phospholipase/carboxylesterase  30.47 
 
 
228 aa  51.6  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.25946  normal  0.203182 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02809  dipeptidyl peptidase IV  26.97 
 
 
729 aa  51.6  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0541  putative esterase  31.58 
 
 
210 aa  51.2  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3767  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.34 
 
 
680 aa  50.1  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26429  predicted protein  32.94 
 
 
363 aa  50.1  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000229905  normal  0.222049 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6203  phospholipase/Carboxylesterase  25.62 
 
 
292 aa  50.1  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0185  hypothetical protein  25.14 
 
 
446 aa  48.5  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000162284  hitchhiker  0.000128495 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1603  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.18 
 
 
328 aa  48.1  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1106  hypothetical protein  27.48 
 
 
355 aa  47  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.117901 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0490  hypothetical protein  27.14 
 
 
357 aa  47  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.637254  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2817  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.77 
 
 
822 aa  47.4  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0548  phospholipase/Carboxylesterase  26.79 
 
 
358 aa  46.2  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.185297  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3037  hypothetical protein  24.84 
 
 
850 aa  46.2  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.762203  normal  0.221922 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4415  peptidase-like protein  33.75 
 
 
384 aa  45.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0718  hypothetical protein  24.87 
 
 
452 aa  44.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0790  hypothetical protein  24.87 
 
 
452 aa  44.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1229  hypothetical protein  26.8 
 
 
816 aa  43.1  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.737589  hitchhiker  0.00225369 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3798  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.6 
 
 
634 aa  43.1  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0600  dipeptidyl peptidase IV  22.03 
 
 
768 aa  42.7  0.009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0141822  normal  0.0367187 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>