149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3399 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_3399  phospholipase/Carboxylesterase  100 
 
 
886 aa  1786    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0843548  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0696  phospholipase/Carboxylesterase  37.62 
 
 
218 aa  143  9.999999999999999e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0409  phospholipase/Carboxylesterase  33.2 
 
 
277 aa  138  4e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00373212  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02216  phospholipase/carboxylesterase superfamily  34.18 
 
 
245 aa  134  6.999999999999999e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.195432  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1105  phospholipase/carboxylesterase  33.48 
 
 
253 aa  127  7e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.320599  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5409  phospholipase/Carboxylesterase  30.53 
 
 
468 aa  121  6e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.301225 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4230  phospholipase/Carboxylesterase  35.29 
 
 
268 aa  121  7e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.58568  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2269  hypothetical protein  30.51 
 
 
261 aa  113  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.187168  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1716  phospholipase/Carboxylesterase  33.33 
 
 
217 aa  112  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3641  phospholipase/carboxylesterase  31.39 
 
 
257 aa  110  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6990  phospholipase/Carboxylesterase  32.35 
 
 
276 aa  110  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0030979 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1020  hypothetical protein  31.03 
 
 
260 aa  105  4e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0890  phospholipase/carboxylesterase  29.95 
 
 
417 aa  103  1e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00284338  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0912  phospholipase/carboxylesterase  29.49 
 
 
417 aa  101  6e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0349753  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0944  hypothetical protein  31.18 
 
 
265 aa  100  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.992264  normal  0.367367 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0242  phospholipase/Carboxylesterase  28.7 
 
 
412 aa  95.1  5e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.080802  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3742  peptidase-like protein  30.1 
 
 
326 aa  94.4  8e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4144  phospholipase/carboxylesterase  32.68 
 
 
217 aa  92.4  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.111836 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5249  phospholipase/carboxylesterase  28.84 
 
 
243 aa  92.8  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0855258  normal  0.417619 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0514  phospholipase/carboxylesterase  28.88 
 
 
249 aa  92.4  3e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.463342  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1124  phospholipase/Carboxylesterase  28.57 
 
 
257 aa  92  4e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2160  peptidase-like protein  28.84 
 
 
474 aa  90.9  9e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.762197 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0088  phospholipase/Carboxylesterase  26.19 
 
 
255 aa  90.5  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6506  phospholipase/Carboxylesterase  28.7 
 
 
264 aa  82.8  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0298565  normal  0.36318 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3048  phospholipase/Carboxylesterase  28.89 
 
 
405 aa  82.4  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3746  peptidase-like  26.07 
 
 
325 aa  78.6  0.0000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.841468 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5020  phospholipase/Carboxylesterase  25 
 
 
563 aa  73.2  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.780509  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1106  hypothetical protein  28.5 
 
 
355 aa  69.3  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.117901 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3704  PA14 domain protein  26.18 
 
 
2334 aa  69.3  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.205023 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0185  hypothetical protein  29.5 
 
 
446 aa  67  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000162284  hitchhiker  0.000128495 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1850  putative esterase  31.85 
 
 
276 aa  65.1  0.000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0548  phospholipase/Carboxylesterase  26.67 
 
 
358 aa  64.7  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.185297  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0718  hypothetical protein  29.13 
 
 
452 aa  63.2  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0790  hypothetical protein  29.13 
 
 
452 aa  63.2  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3037  hypothetical protein  26.71 
 
 
850 aa  63.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.762203  normal  0.221922 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5584  phospholipase/carboxylesterase  28.83 
 
 
231 aa  60.8  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33500  esterase, poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  24.48 
 
 
429 aa  60.1  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3714  PKD domain containing protein  27.47 
 
 
1771 aa  59.3  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333758  normal  0.0659323 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2312  carboxylesterase  25.36 
 
 
223 aa  58.5  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0295169  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4415  peptidase-like protein  27.96 
 
 
384 aa  58.5  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1603  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.76 
 
 
328 aa  58.2  0.0000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2701  carboxylesterase  26.46 
 
 
223 aa  57.8  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0223431  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1999  phospholipase/carboxylesterase family protein  26.46 
 
 
221 aa  57  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5113  esterase, PHB depolymerase  27.81 
 
 
370 aa  57.8  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.841359  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2136  carboxylesterase  27.18 
 
 
224 aa  57  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000191828  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1578  putative esterase  31.02 
 
 
295 aa  56.6  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.56731  normal  0.469655 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2265  carboxylesterase  27.13 
 
 
221 aa  56.6  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2337  carboxylesterase  27.13 
 
 
221 aa  56.6  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.387077  normal  0.0702195 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2626  carboxylesterase  25.93 
 
 
223 aa  56.6  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000180149  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5282  hypothetical protein  28 
 
 
334 aa  55.8  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1759  Carboxylesterase  25.93 
 
 
223 aa  55.8  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000153879  hitchhiker  0.00754405 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1987  hypothetical protein  31.82 
 
 
700 aa  55.5  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2670  carboxylesterase  26.06 
 
 
223 aa  55.8  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000549714  hitchhiker  0.00990238 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0063  phospholipase/carboxylesterase  31.5 
 
 
227 aa  55.5  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.982882  normal  0.670301 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1211  esterase, PHB depolymerase family  30.05 
 
 
312 aa  55.5  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0349548 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2918  phospholipase/carboxylesterase  27.65 
 
 
218 aa  55.1  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2310  carboxylesterase  24.52 
 
 
222 aa  54.7  0.000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0300805  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3855  phospholipase/Carboxylesterase  34.52 
 
 
226 aa  54.7  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2455  phospholipase/carboxylesterase  26.6 
 
 
221 aa  54.7  0.000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2731  beta-lactamase  26.88 
 
 
640 aa  54.3  0.000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1071  carboxylesterase  27.54 
 
 
219 aa  53.9  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2138  carboxylesterase  26.67 
 
 
234 aa  53.9  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000145278  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0335  phospholipase/carboxylesterase  25.73 
 
 
357 aa  54.3  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.64094  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2408  carbohydrate esterase family 1 protein  30.77 
 
 
316 aa  53.9  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.211104  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14080  carboxylesterase  28.23 
 
 
215 aa  54.3  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.022206 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6203  phospholipase/Carboxylesterase  27.17 
 
 
292 aa  53.9  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3522  phospholipase/carboxylesterase  23.88 
 
 
237 aa  53.9  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.406594  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5819  hypothetical protein  25.66 
 
 
816 aa  53.5  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.438939  decreased coverage  0.00192823 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1246  carboxylesterase  27.75 
 
 
215 aa  53.5  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4136  putative esterase  31.55 
 
 
327 aa  52.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.520814 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4097  putative esterase  31.55 
 
 
327 aa  52.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0490  hypothetical protein  24.88 
 
 
357 aa  52.4  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.637254  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11300  Carboxylesterase I  27.5 
 
 
219 aa  51.6  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1955  phospholipase/carboxylesterase  27.78 
 
 
222 aa  51.6  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3966  phospholipase/carboxylesterase  31.75 
 
 
795 aa  51.6  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6756  phospholipase/carboxylesterase  29.05 
 
 
225 aa  51.6  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.847027  normal  0.369639 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1254  carboxylesterase  25.84 
 
 
219 aa  51.6  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2204  esterase, PHB depolymerase  25.63 
 
 
367 aa  49.7  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.667331  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1514  carboxylesterase  26.67 
 
 
231 aa  50.1  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0210024  hitchhiker  0.000187448 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2101  phospholipase/carboxylesterase  24.77 
 
 
223 aa  49.7  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2022  carboxylesterase  26.9 
 
 
226 aa  50.4  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000559029  normal  0.99764 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2650  hypothetical protein  28.95 
 
 
355 aa  50.1  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.376354  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0345  carboxylesterase  26.09 
 
 
223 aa  49.3  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.268278  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1594  putative esterase  24.17 
 
 
409 aa  49.7  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.48746  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1473  putative esterase  29.08 
 
 
381 aa  49.7  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.305881  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6240  PHB depolymerase family esterase  28.12 
 
 
466 aa  49.3  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.721378 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4018  hypothetical protein  28.87 
 
 
355 aa  48.9  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2287  phospholipase/Carboxylesterase  29.77 
 
 
263 aa  48.9  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.191504  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2297  phospholipase/carboxylesterase  23.11 
 
 
238 aa  48.9  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.563406  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1950  carboxylesterase  25 
 
 
223 aa  48.9  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000802695  normal  0.0250693 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2056  esterase, PHB depolymerase family  27.91 
 
 
334 aa  48.9  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10962  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0551  carboxylesterase protein  26.98 
 
 
226 aa  48.5  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.315382  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2404  carboxylesterase, putative  25.35 
 
 
319 aa  48.9  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0171467  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1208  phospholipase/carboxylesterase  27.53 
 
 
239 aa  48.5  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.12535 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1368  phospholipase/Carboxylesterase  29.17 
 
 
239 aa  48.5  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2130  carboxylesterase  27.87 
 
 
222 aa  48.5  0.0006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.939077  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3639  Carboxylesterase  27.84 
 
 
223 aa  48.1  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2412  phospholipase/carboxylesterase  23.85 
 
 
227 aa  48.1  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0536257  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1229  hypothetical protein  25 
 
 
816 aa  48.1  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.737589  hitchhiker  0.00225369 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3823  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  26.09 
 
 
374 aa  47.8  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>