46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2160 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2160  peptidase-like protein  100 
 
 		 474 aa  971    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.762197 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3742  peptidase-like protein  63.8 
 
 		 326 aa  458  9.999999999999999e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5409  phospholipase/Carboxylesterase  32.98 
 
 		 468 aa  266  8.999999999999999e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.301225 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0088  phospholipase/Carboxylesterase  36.67 
 
 		 255 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0912  phospholipase/carboxylesterase  38.74 
 
 		 417 aa  145  1e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0349753  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0890  phospholipase/carboxylesterase  38.74 
 
 		 417 aa  146  1e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00284338  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6506  phospholipase/Carboxylesterase  35.06 
 
 		 264 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0298565  normal  0.36318 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0696  phospholipase/Carboxylesterase  36.49 
 
 		 218 aa  128  2.0000000000000002e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1105  phospholipase/carboxylesterase  36.79 
 
 		 253 aa  126  9e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.320599  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3641  phospholipase/carboxylesterase  31.02 
 
 		 257 aa  125  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3048  phospholipase/Carboxylesterase  33.6 
 
 		 405 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0409  phospholipase/Carboxylesterase  30.33 
 
 		 277 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00373212  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0242  phospholipase/Carboxylesterase  33.78 
 
 		 412 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.080802  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0514  phospholipase/carboxylesterase  32.31 
 
 		 249 aa  118  1.9999999999999998e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.463342  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02216  phospholipase/carboxylesterase superfamily  31.36 
 
 		 245 aa  116  7.999999999999999e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.195432  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6990  phospholipase/Carboxylesterase  35.55 
 
 		 276 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030979 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1124  phospholipase/Carboxylesterase  28.69 
 
 		 257 aa  108  3e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4230  phospholipase/Carboxylesterase  41.07 
 
 		 268 aa  107  6e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.58568  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0944  hypothetical protein  33.33 
 
 		 265 aa  103  6e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.992264  normal  0.367367 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1716  phospholipase/Carboxylesterase  30.91 
 
 		 217 aa  99.4  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1020  hypothetical protein  43.48 
 
 		 260 aa  97.1  6e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3399  phospholipase/Carboxylesterase  28.84 
 
 		 886 aa  90.9  4e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0843548  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3522  phospholipase/carboxylesterase  28.64 
 
 		 237 aa  88.6  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.406594  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5249  phospholipase/carboxylesterase  29.74 
 
 		 243 aa  82.4  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0855258  normal  0.417619 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2269  hypothetical protein  28.4 
 
 		 261 aa  78.2  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.187168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3741  hypothetical protein  50 
 
 		 100 aa  76.6  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.538582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5020  phospholipase/Carboxylesterase  26.95 
 
 		 563 aa  75.1  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.780509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3746  peptidase-like  33.33 
 
 		 325 aa  73.9  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.841468 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3704  PA14 domain protein  35.71 
 
 		 2334 aa  72.8  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.205023 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4144  phospholipase/carboxylesterase  28.66 
 
 		 217 aa  63.9  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.111836 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4415  peptidase-like protein  30.1 
 
 		 384 aa  60.5  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2781  hypothetical protein  29.05 
 
 		 796 aa  55.5  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.216427  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0185  hypothetical protein  26.78 
 
 		 446 aa  54.7  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000162284  hitchhiker  0.000128495 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1603  pyrroline-5-carboxylate reductase  29 
 
 		 328 aa  52.4  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6203  phospholipase/Carboxylesterase  30.23 
 
 		 292 aa  49.7  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0718  hypothetical protein  26.46 
 
 		 452 aa  50.1  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0790  hypothetical protein  26.46 
 
 		 452 aa  50.1  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3037  hypothetical protein  25.49 
 
 		 850 aa  48.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.762203  normal  0.221922 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3767  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.5 
 
 		 680 aa  46.2  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1208  phospholipase/Carboxylesterase  28.97 
 
 		 223 aa  45.1  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02809  dipeptidyl peptidase IV  26.61 
 
 		 729 aa  45.1  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0541  putative esterase  30.89 
 
 		 210 aa  44.7  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0600  dipeptidyl peptidase IV  25.83 
 
 		 768 aa  44.3  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0141822  normal  0.0367187 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04800  dipeptidyl aminopeptidase IV  24.03 
 
 		 721 aa  44.3  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.315702  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0814  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  24.23 
 
 		 765 aa  43.9  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000313146  hitchhiker  0.0000639736 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0490  hypothetical protein  27.59 
 
 		 357 aa  43.5  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.637254  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>