25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2781 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_2781  hypothetical protein  100 
 
 
796 aa  1635    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.216427  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0242  phospholipase/Carboxylesterase  31.03 
 
 
412 aa  63.9  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.080802  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0409  phospholipase/Carboxylesterase  34.53 
 
 
277 aa  63.5  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00373212  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0912  phospholipase/carboxylesterase  24.87 
 
 
417 aa  61.6  0.00000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0349753  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0890  phospholipase/carboxylesterase  26.15 
 
 
417 aa  59.7  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00284338  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3742  peptidase-like protein  32.35 
 
 
326 aa  57.8  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3048  phospholipase/Carboxylesterase  23.42 
 
 
405 aa  55.8  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2160  peptidase-like protein  29.05 
 
 
474 aa  54.7  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.762197 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1716  phospholipase/Carboxylesterase  32.84 
 
 
217 aa  54.3  0.000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5020  phospholipase/Carboxylesterase  25.85 
 
 
563 aa  52.8  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.780509  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1105  phospholipase/carboxylesterase  24.52 
 
 
253 aa  52.8  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.320599  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3037  hypothetical protein  34.52 
 
 
850 aa  52  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.762203  normal  0.221922 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0088  phospholipase/Carboxylesterase  27.27 
 
 
255 aa  48.9  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02216  phospholipase/carboxylesterase superfamily  39.29 
 
 
245 aa  48.5  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.195432  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2194  carbohydrate-binding family 6 protein  22.17 
 
 
501 aa  47.8  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.29628  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0696  phospholipase/Carboxylesterase  30.77 
 
 
218 aa  46.2  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6990  phospholipase/Carboxylesterase  27.71 
 
 
276 aa  46.2  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0030979 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1603  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.36 
 
 
328 aa  45.8  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1823  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.93 
 
 
633 aa  45.8  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.272231  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5409  phospholipase/Carboxylesterase  25.17 
 
 
468 aa  45.4  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.301225 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5249  phospholipase/carboxylesterase  23.27 
 
 
243 aa  45.4  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0855258  normal  0.417619 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1987  hypothetical protein  34.78 
 
 
700 aa  45.1  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0272  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.39 
 
 
686 aa  44.7  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1229  hypothetical protein  31.33 
 
 
816 aa  44.3  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.737589  hitchhiker  0.00225369 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5819  hypothetical protein  31.33 
 
 
816 aa  44.3  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.438939  decreased coverage  0.00192823 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>