178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3966 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3966  phospholipase/carboxylesterase  100 
 
 		 795 aa  1608    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3723  phospholipase/carboxylesterase  53.94 
 
 		 427 aa  380  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.247112 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12041  hypothetical protein  36.3 
 
 		 641 aa  198  4.0000000000000005e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.681037 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2408  carbohydrate esterase family 1 protein  32.01 
 
 		 316 aa  154  8e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.211104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1240  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  32.22 
 
 		 370 aa  116  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.194401 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3854  putative lipoprotein  30.03 
 
 		 336 aa  115  4.0000000000000004e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.496382  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1400  phospholipase/Carboxylesterase  28.32 
 
 		 325 aa  114  7.000000000000001e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2261  putative esterase/lipase/thioesterase  30.65 
 
 		 361 aa  114  9e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556081  normal  0.0820217 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1385  putative Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  31.14 
 
 		 464 aa  111  5e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.516849  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0726  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  31.02 
 
 		 462 aa  107  7e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401494  normal  0.100919 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1493  phospholipase/Carboxylesterase  28.47 
 
 		 317 aa  105  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.030471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  31.72 
 
 		 1002 aa  104  7e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1573  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  28.99 
 
 		 326 aa  103  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1651  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  28.62 
 
 		 323 aa  99  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0627752  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3487  hypothetical protein  27.46 
 
 		 332 aa  97.8  6e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0579  esterase, putative  28.47 
 
 		 324 aa  96.7  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3106  putative lipoprotein  29.39 
 
 		 341 aa  94.7  6e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3566  phospholipase/carboxylesterase  28.57 
 
 		 331 aa  94.7  6e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0373  polyhydroxybutyrate depolymerase  28.73 
 
 		 357 aa  94.4  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0880654  hitchhiker  0.00622899 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07050  hypothetical protein  29.39 
 
 		 322 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13327  esterase lipoprotein lpqC  28.11 
 
 		 304 aa  93.2  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000167103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1204  phospholipase/carboxylesterase  28.24 
 
 		 335 aa  92.8  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.299935  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5085  polyhydroxybutyrate depolymerase  26.87 
 
 		 313 aa  92  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  normal  0.355318 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3217  hypothetical protein  29.55 
 
 		 282 aa  90.9  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00180  conserved hypothetical protein  32.4 
 
 		 340 aa  87.4  9e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4595  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  27.71 
 
 		 344 aa  85.5  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1167  hypothetical protein  27.64 
 
 		 471 aa  85.5  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.428408  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1953  putative hydrolase  30.99 
 
 		 308 aa  84.3  0.000000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0001445  hitchhiker  0.00199711 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3891  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  25.94 
 
 		 298 aa  82.8  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.947481  normal  0.780646 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0646  hypothetical protein  28.72 
 
 		 322 aa  83.2  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399454  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2752  phospholipase/carboxylesterase  25.86 
 
 		 309 aa  82.8  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1969  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  23.86 
 
 		 363 aa  80.9  0.00000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0935555 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5398  hypothetical protein  29.57 
 
 		 302 aa  80.5  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.330044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2301  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  29.79 
 
 		 232 aa  79.3  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  28.57 
 
 		 461 aa  79  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0072  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  31.72 
 
 		 392 aa  78.2  0.0000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2056  esterase, PHB depolymerase family  27.61 
 
 		 334 aa  78.2  0.0000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3576  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  26.23 
 
 		 451 aa  77.8  0.0000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.875939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4460  polyhydroxybutyrate depolymerase  26.67 
 
 		 322 aa  77.8  0.0000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.403398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1590  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  25.18 
 
 		 353 aa  77.8  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255211  normal  0.12664 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7236  putative LpqP (hydrolase/esterase)  27.65 
 
 		 405 aa  77.8  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0397136  normal  0.31443 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10685  lipoprotein lpqP  27.14 
 
 		 280 aa  77  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.132448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3303  glycoside hydrolase family 62  27.34 
 
 		 436 aa  76.6  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000382833  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0967  putative esterase  28.4 
 
 		 244 aa  75.9  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.127871 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24870  predicted xylanase/chitin deacetylase  48.51 
 
 		 503 aa  74.7  0.000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3127  phospholipase/Carboxylesterase  26.34 
 
 		 314 aa  74.3  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.539584 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3488  hypothetical protein  21.72 
 
 		 447 aa  74.3  0.000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2770  PHB depolymerase family esterase  22.79 
 
 		 544 aa  73.9  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33500  esterase, poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  24.9 
 
 		 429 aa  73.6  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3270  esterase, PHB depolymerase  26.69 
 
 		 372 aa  71.2  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.67973 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0297  lpqC, putative  25.59 
 
 		 306 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.433259  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0364  putative polyhydroxybutyrate depolymerase  28.12 
 
 		 265 aa  70.5  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.81916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2906  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  33.6 
 
 		 659 aa  70.5  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.686004  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0242  cellulose-binding family II  27.31 
 
 		 447 aa  69.3  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2383  putative surface protein  44.87 
 
 		 929 aa  66.2  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.13211  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2633  PHB depolymerase family esterase  26.43 
 
 		 422 aa  66.6  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.655829 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1285  esterase, PHB depolymerase family  25.54 
 
 		 367 aa  65.5  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.29485  normal  0.060549 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1990  esterase, PHB depolymerase family  23.89 
 
 		 406 aa  65.1  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000642829  normal  0.085302 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1290  hypothetical protein  27.97 
 
 		 305 aa  64.7  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3823  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  22.22 
 
 		 374 aa  62.8  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0048  esterase, PHB depolymerase family  25.42 
 
 		 417 aa  62  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616843 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0080  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  25.73 
 
 		 286 aa  62  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0493  esterase, PHB depolymerase family  24.2 
 
 		 378 aa  61.6  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3344  PHB depolymerase family esterase  28.37 
 
 		 429 aa  61.2  0.00000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.335799  normal  0.68562 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05267  feruloyl esterase (Eurofung)  30.11 
 
 		 270 aa  60.8  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2059  phospholipase/carboxylesterase  24.81 
 
 		 343 aa  60.1  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.550035  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4230  phospholipase/Carboxylesterase  28.22 
 
 		 268 aa  60.1  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.58568  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1211  esterase, PHB depolymerase family  22.49 
 
 		 312 aa  60.1  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0349548 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2245  esterase, PHB depolymerase family  25.11 
 
 		 432 aa  58.9  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.386893 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2287  phospholipase/Carboxylesterase  25.31 
 
 		 263 aa  58.5  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.191504  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3857  PHB depolymerase family esterase  25.55 
 
 		 414 aa  57.8  0.0000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2257  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  27.78 
 
 		 270 aa  57.4  0.0000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4173  phospholipase/carboxylesterase  24 
 
 		 225 aa  57  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741665  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1975  hypothetical protein  43 
 
 		 967 aa  57  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000301767  hitchhiker  0.0000479173 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1984  esterase, PHB depolymerase family  24.79 
 
 		 337 aa  56.6  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000502853  normal  0.034342 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26429  predicted protein  27.16 
 
 		 363 aa  56.6  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000229905  normal  0.222049 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6990  phospholipase/Carboxylesterase  27.1 
 
 		 276 aa  56.6  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030979 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5249  phospholipase/carboxylesterase  46 
 
 		 243 aa  55.5  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0855258  normal  0.417619 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1173  esterase, PHB depolymerase family  24.27 
 
 		 410 aa  55.1  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1536  putative polyhydroxybutyrate depolymerase  25.69 
 
 		 276 aa  54.7  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.26582  normal  0.221996 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7065  esterase, PHB depolymerase family  25.98 
 
 		 426 aa  54.7  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.185362  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0371  esterase, PHB depolymerase  23.87 
 
 		 394 aa  54.7  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0696  phospholipase/Carboxylesterase  30.84 
 
 		 218 aa  54.7  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1698  phospholipase/Carboxylesterase  27.93 
 
 		 222 aa  54.7  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.675921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6240  PHB depolymerase family esterase  24.76 
 
 		 466 aa  54.7  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.721378 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3959  esterase, PHB depolymerase family  23.08 
 
 		 423 aa  54.3  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2066  phospholipase/carboxylesterase  31.18 
 
 		 238 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.565731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2204  esterase, PHB depolymerase  23.05 
 
 		 367 aa  53.5  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.667331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2650  hypothetical protein  23.25 
 
 		 355 aa  53.9  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.376354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1208  phospholipase/carboxylesterase  26.11 
 
 		 239 aa  53.5  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.12535 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2149  hypothetical protein  27.55 
 
 		 343 aa  53.1  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000536767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6802  esterase, PHB depolymerase family  24.13 
 
 		 398 aa  53.1  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0419644  decreased coverage  0.000000125026 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2820  esterase, PHB depolymerase family  22.15 
 
 		 352 aa  53.1  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000611867  hitchhiker  0.00921779 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4027  PHB depolymerase family esterase  21.99 
 
 		 387 aa  53.1  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.391886 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0713  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  25.14 
 
 		 287 aa  53.5  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1368  phospholipase/Carboxylesterase  26.11 
 
 		 239 aa  52.8  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34810  esterase, poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  39.74 
 
 		 501 aa  52.8  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92192  predicted protein  19.72 
 
 		 486 aa  52  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.865019  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4362  PHB depolymerase family esterase  40 
 
 		 576 aa  52.4  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0388  PHB depolymerase family esterase  25.3 
 
 		 442 aa  52  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.140919  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>