90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_7236 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_7236  putative LpqP (hydrolase/esterase)  100 
 
 		 405 aa  785    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0397136  normal  0.31443 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0072  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  56.9 
 
 		 392 aa  376  1e-103  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1493  phospholipase/Carboxylesterase  40.72 
 
 		 317 aa  130  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.030471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5085  polyhydroxybutyrate depolymerase  37.57 
 
 		 313 aa  126  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  normal  0.355318 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3854  putative lipoprotein  37.13 
 
 		 336 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.496382  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0373  polyhydroxybutyrate depolymerase  41.22 
 
 		 357 aa  119  9e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0880654  hitchhiker  0.00622899 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10685  lipoprotein lpqP  34.46 
 
 		 280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.132448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3106  putative lipoprotein  34.73 
 
 		 341 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1590  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  37.31 
 
 		 353 aa  110  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255211  normal  0.12664 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1573  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  32.13 
 
 		 326 aa  99.8  7e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4460  polyhydroxybutyrate depolymerase  29.72 
 
 		 322 aa  98.2  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.403398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1290  hypothetical protein  38.01 
 
 		 305 aa  97.4  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1969  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  34.39 
 
 		 363 aa  94.7  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0935555 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3127  phospholipase/Carboxylesterase  37.35 
 
 		 314 aa  94  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.539584 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07050  hypothetical protein  41.83 
 
 		 322 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0967  putative esterase  32.59 
 
 		 244 aa  90.1  6e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.127871 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1651  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  35.92 
 
 		 323 aa  89.4  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0627752  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0646  hypothetical protein  41.51 
 
 		 322 aa  86.7  7e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399454  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0297  lpqC, putative  34.87 
 
 		 306 aa  86.3  8e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.433259  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2408  carbohydrate esterase family 1 protein  34.18 
 
 		 316 aa  85.5  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.211104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3217  hypothetical protein  33.51 
 
 		 282 aa  82.4  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3566  phospholipase/carboxylesterase  32.51 
 
 		 331 aa  82  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1953  putative hydrolase  36.21 
 
 		 308 aa  80.9  0.00000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0001445  hitchhiker  0.00199711 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1400  phospholipase/Carboxylesterase  27.43 
 
 		 325 aa  79.7  0.00000000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2261  putative esterase/lipase/thioesterase  34.24 
 
 		 361 aa  79.3  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556081  normal  0.0820217 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13327  esterase lipoprotein lpqC  32.92 
 
 		 304 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000167103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3966  phospholipase/carboxylesterase  27.65 
 
 		 795 aa  76.6  0.0000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2752  phospholipase/carboxylesterase  29.53 
 
 		 309 aa  73.9  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  29.55 
 
 		 1002 aa  73.6  0.000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1240  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  36.71 
 
 		 370 aa  70.5  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.194401 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1204  phospholipase/carboxylesterase  36.84 
 
 		 335 aa  68.9  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.299935  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92192  predicted protein  28.29 
 
 		 486 aa  67.4  0.0000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.865019  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0713  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  25.34 
 
 		 287 aa  66.2  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0080  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  32.62 
 
 		 286 aa  64.7  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4595  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  34.03 
 
 		 344 aa  63.2  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0579  esterase, putative  34.02 
 
 		 324 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3891  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  29.13 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.947481  normal  0.780646 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1167  hypothetical protein  29.11 
 
 		 471 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.428408  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0726  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  29.73 
 
 		 462 aa  57  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401494  normal  0.100919 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5398  hypothetical protein  28.31 
 
 		 302 aa  55.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.330044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3485  hypothetical protein  32.95 
 
 		 269 aa  55.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2301  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  40 
 
 		 232 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0284  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  34.78 
 
 		 215 aa  53.9  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34810  esterase, poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  33.58 
 
 		 501 aa  53.9  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3303  glycoside hydrolase family 62  24.36 
 
 		 436 aa  52.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000382833  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7674  putative polyhydroxy-alkanoate/butyrate(PHA/PHB) depolymerase  31.3 
 
 		 529 aa  52  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1385  putative Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  22.95 
 
 		 464 aa  51.6  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.516849  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0335  phospholipase/carboxylesterase  32.86 
 
 		 357 aa  50.8  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.64094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0490  hypothetical protein  33.33 
 
 		 357 aa  50.8  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.637254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3270  esterase, PHB depolymerase  28.78 
 
 		 372 aa  50.8  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.67973 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9052  polyhydroxybutyrate depolymerase  32.54 
 
 		 366 aa  50.1  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0082  esterase, PHB depolymerase  32.54 
 
 		 414 aa  49.7  0.00009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3576  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  27.3 
 
 		 451 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.875939  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0048  esterase, PHB depolymerase family  28.79 
 
 		 417 aa  49.3  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616843 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1285  esterase, PHB depolymerase family  29.69 
 
 		 367 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.29485  normal  0.060549 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05267  feruloyl esterase (Eurofung)  24.86 
 
 		 270 aa  48.9  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1963  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  35.58 
 
 		 669 aa  48.5  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.159211  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0137  esterase, PHB depolymerase  26.8 
 
 		 392 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26429  predicted protein  30.61 
 
 		 363 aa  48.1  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000229905  normal  0.222049 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0364  putative polyhydroxybutyrate depolymerase  29.27 
 
 		 265 aa  48.1  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.81916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3487  hypothetical protein  24.48 
 
 		 332 aa  48.1  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6990  phospholipase/Carboxylesterase  23.81 
 
 		 276 aa  47  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030979 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1211  esterase, PHB depolymerase family  31.63 
 
 		 312 aa  47  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0349548 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1106  hypothetical protein  29.89 
 
 		 355 aa  46.6  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.117901 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0568  esterase, PHB depolymerase family  28.76 
 
 		 395 aa  46.6  0.0009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3665  PHB depolymerase family esterase  31.75 
 
 		 365 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.131134  normal  0.75521 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5113  esterase, PHB depolymerase  29.41 
 
 		 370 aa  46.2  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.841359  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4602  esterase, PHB depolymerase  30.89 
 
 		 317 aa  46.2  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.462256  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4502  esterase, PHB depolymerase  31.75 
 
 		 365 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.42248  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3862  PHB depolymerase family esterase  31.75 
 
 		 365 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0810078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1208  phospholipase/Carboxylesterase  30 
 
 		 223 aa  45.1  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3959  esterase, PHB depolymerase family  32.06 
 
 		 423 aa  45.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4027  PHB depolymerase family esterase  29.27 
 
 		 387 aa  45.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.391886 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2287  phospholipase/Carboxylesterase  30.07 
 
 		 263 aa  45.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.191504  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1148  phospholipase/Carboxylesterase  28.1 
 
 		 239 aa  45.1  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0388  PHB depolymerase family esterase  29.89 
 
 		 442 aa  45.1  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.140919  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2245  esterase, PHB depolymerase family  31.3 
 
 		 432 aa  44.7  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.386893 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  25.11 
 
 		 461 aa  44.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1463  esterase, PHB depolymerase family  27.94 
 
 		 363 aa  44.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0308241  normal  0.241375 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3857  PHB depolymerase family esterase  29.46 
 
 		 414 aa  45.1  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1940  PHB depolymerase family esterase  27.45 
 
 		 433 aa  44.7  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00180  conserved hypothetical protein  27.81 
 
 		 340 aa  44.7  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4362  PHB depolymerase family esterase  31.73 
 
 		 576 aa  44.3  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3488  hypothetical protein  26.67 
 
 		 447 aa  43.5  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6529  hypothetical protein  26.87 
 
 		 222 aa  43.5  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0555425 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2650  hypothetical protein  32.14 
 
 		 355 aa  43.5  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.376354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1052  phospholipase/carboxylesterase  29.41 
 
 		 365 aa  43.1  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3198  putative polyhydroxybutyrate depolymerase  26.54 
 
 		 279 aa  43.1  0.009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.396095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1173  esterase, PHB depolymerase family  31.75 
 
 		 410 aa  43.1  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2846  esterase, PHB depolymerase  30.23 
 
 		 398 aa  42.7  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.222858  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>