53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3566 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3566  phospholipase/carboxylesterase  100 
 
 		 331 aa  649    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2752  phospholipase/carboxylesterase  50.71 
 
 		 309 aa  295  6e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3217  hypothetical protein  37.7 
 
 		 282 aa  139  4.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1969  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  32.82 
 
 		 363 aa  133  3.9999999999999996e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0935555 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1400  phospholipase/Carboxylesterase  26.35 
 
 		 325 aa  120  3e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1493  phospholipase/Carboxylesterase  30.27 
 
 		 317 aa  101  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.030471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0579  esterase, putative  28.57 
 
 		 324 aa  97.4  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07050  hypothetical protein  30.54 
 
 		 322 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3966  phospholipase/carboxylesterase  28.17 
 
 		 795 aa  96.3  7e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1204  phospholipase/carboxylesterase  26.18 
 
 		 335 aa  95.9  8e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.299935  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2408  carbohydrate esterase family 1 protein  22.41 
 
 		 316 aa  94.7  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.211104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0646  hypothetical protein  32.05 
 
 		 322 aa  92.4  9e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399454  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0967  putative esterase  28.98 
 
 		 244 aa  91.3  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.127871 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5085  polyhydroxybutyrate depolymerase  26.38 
 
 		 313 aa  87  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  normal  0.355318 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13327  esterase lipoprotein lpqC  29.47 
 
 		 304 aa  87  4e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000167103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1573  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  27.3 
 
 		 326 aa  83.2  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7236  putative LpqP (hydrolase/esterase)  32.51 
 
 		 405 aa  83.6  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0397136  normal  0.31443 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0297  lpqC, putative  32.17 
 
 		 306 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.433259  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1651  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  25.98 
 
 		 323 aa  79.7  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0627752  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3891  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  29.76 
 
 		 298 aa  78.2  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.947481  normal  0.780646 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3854  putative lipoprotein  26.7 
 
 		 336 aa  73.6  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.496382  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4595  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  28.85 
 
 		 344 aa  73.2  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4460  polyhydroxybutyrate depolymerase  25.72 
 
 		 322 aa  72.8  0.000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.403398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3127  phospholipase/Carboxylesterase  24.14 
 
 		 314 aa  72.4  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.539584 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0373  polyhydroxybutyrate depolymerase  30.32 
 
 		 357 aa  71.2  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0880654  hitchhiker  0.00622899 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3106  putative lipoprotein  30.49 
 
 		 341 aa  70.9  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1590  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  26.81 
 
 		 353 aa  70.5  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255211  normal  0.12664 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0072  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  28.32 
 
 		 392 aa  69.7  0.00000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5398  hypothetical protein  24.46 
 
 		 302 aa  69.3  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.330044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10685  lipoprotein lpqP  26.36 
 
 		 280 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.132448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2301  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  28.42 
 
 		 232 aa  66.2  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3487  hypothetical protein  25 
 
 		 332 aa  65.9  0.0000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2261  putative esterase/lipase/thioesterase  27.24 
 
 		 361 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556081  normal  0.0820217 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0726  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  27.8 
 
 		 462 aa  63.9  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401494  normal  0.100919 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1290  hypothetical protein  26.94 
 
 		 305 aa  62.8  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1953  putative hydrolase  24.32 
 
 		 308 aa  60.8  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0001445  hitchhiker  0.00199711 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3576  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  31.77 
 
 		 451 aa  60.8  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.875939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0080  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  29.32 
 
 		 286 aa  58.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  26.71 
 
 		 1002 aa  56.2  0.0000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26429  predicted protein  26.34 
 
 		 363 aa  55.8  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000229905  normal  0.222049 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05267  feruloyl esterase (Eurofung)  25.99 
 
 		 270 aa  55.5  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1240  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  28.7 
 
 		 370 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.194401 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1167  hypothetical protein  27.24 
 
 		 471 aa  54.3  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.428408  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  23.53 
 
 		 461 aa  53.5  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1385  putative Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  21.48 
 
 		 464 aa  51.2  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.516849  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0713  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  26.79 
 
 		 287 aa  51.6  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3303  glycoside hydrolase family 62  23.96 
 
 		 436 aa  49.7  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000382833  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0967  carboxylesterase  34.65 
 
 		 221 aa  45.8  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000584217 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3485  hypothetical protein  23.69 
 
 		 269 aa  44.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04140  carboxylesterase  30.48 
 
 		 222 aa  43.5  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.628824  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0242  cellulose-binding family II  22.8 
 
 		 447 aa  43.9  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4407  PHB depolymerase family esterase  25.6 
 
 		 398 aa  43.5  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.32684  normal  0.707171 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6529  hypothetical protein  24.26 
 
 		 222 aa  43.5  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0555425 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>