40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6529 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6529  hypothetical protein  100 
 
 		 222 aa  449  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0555425 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0284  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  65.4 
 
 		 215 aa  274  7e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1290  hypothetical protein  36 
 
 		 305 aa  67.4  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3854  putative lipoprotein  30.08 
 
 		 336 aa  57.8  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.496382  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3217  hypothetical protein  28.26 
 
 		 282 aa  55.5  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2149  hypothetical protein  29.27 
 
 		 343 aa  51.2  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000536767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3127  phospholipase/Carboxylesterase  27.83 
 
 		 314 aa  49.3  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.539584 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07050  hypothetical protein  29.93 
 
 		 322 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2268  esterase, PHB depolymerase family  26.83 
 
 		 344 aa  48.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.493113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0080  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  27.05 
 
 		 286 aa  47  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2906  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  26.09 
 
 		 659 aa  46.6  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.686004  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0646  hypothetical protein  29.37 
 
 		 322 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399454  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10685  lipoprotein lpqP  26.09 
 
 		 280 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.132448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4407  PHB depolymerase family esterase  32.14 
 
 		 398 aa  45.4  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.32684  normal  0.707171 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1400  phospholipase/Carboxylesterase  21.85 
 
 		 325 aa  45.4  0.0006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0568  esterase, PHB depolymerase family  29.66 
 
 		 395 aa  45.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0579  esterase, putative  22.67 
 
 		 324 aa  45.4  0.0007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4749  esterase, PHB depolymerase family  31.39 
 
 		 343 aa  45.1  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2752  phospholipase/carboxylesterase  24.59 
 
 		 309 aa  45.1  0.0009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7236  putative LpqP (hydrolase/esterase)  27.01 
 
 		 405 aa  44.7  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0397136  normal  0.31443 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  22 
 
 		 1002 aa  44.3  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1651  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  25.56 
 
 		 323 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0627752  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1945  esterase, PHB depolymerase family  26.98 
 
 		 344 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.198099  normal  0.0353299 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1573  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  26.01 
 
 		 326 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2770  PHB depolymerase family esterase  22.45 
 
 		 544 aa  43.5  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1590  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  26.77 
 
 		 353 aa  43.9  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255211  normal  0.12664 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3966  phospholipase/carboxylesterase  27.82 
 
 		 795 aa  43.5  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0072  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  26.72 
 
 		 392 aa  42.7  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3566  phospholipase/carboxylesterase  24.26 
 
 		 331 aa  42.4  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9052  polyhydroxybutyrate depolymerase  26.32 
 
 		 366 aa  42.7  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3665  PHB depolymerase family esterase  27.46 
 
 		 365 aa  42.4  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.131134  normal  0.75521 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4883  PHB depolymerase family esterase  28.33 
 
 		 369 aa  42.4  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103512  hitchhiker  0.0011428 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3862  PHB depolymerase family esterase  27.46 
 
 		 365 aa  42.4  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0810078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4502  esterase, PHB depolymerase  27.46 
 
 		 365 aa  42.4  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.42248  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5085  polyhydroxybutyrate depolymerase  24.42 
 
 		 313 aa  42.4  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  normal  0.355318 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2234  esterase, PHB depolymerase  27.27 
 
 		 369 aa  42.4  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.111052  normal  0.321017 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4602  esterase, PHB depolymerase  28.91 
 
 		 317 aa  42  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.462256  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0082  esterase, PHB depolymerase  27.33 
 
 		 414 aa  42  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0371  esterase, PHB depolymerase  25.73 
 
 		 394 aa  41.6  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2059  phospholipase/carboxylesterase  26.23 
 
 		 343 aa  41.6  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.550035  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>