152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2906 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_2906  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  100 
 
 		 659 aa  1342    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.686004  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  30.3 
 
 		 1002 aa  81.3  0.00000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3966  phospholipase/carboxylesterase  31.41 
 
 		 795 aa  73.9  0.000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2408  carbohydrate esterase family 1 protein  26.52 
 
 		 316 aa  71.2  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.211104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1573  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  26.67 
 
 		 326 aa  70.9  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1493  phospholipase/Carboxylesterase  30.94 
 
 		 317 aa  69.7  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.030471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5954  PHB depolymerase family esterase  29.89 
 
 		 438 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.159743 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1400  phospholipase/Carboxylesterase  26.39 
 
 		 325 aa  68.9  0.0000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1167  hypothetical protein  30.2 
 
 		 471 aa  68.9  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.428408  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1953  putative hydrolase  27.68 
 
 		 308 aa  68.9  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0001445  hitchhiker  0.00199711 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1204  phospholipase/carboxylesterase  25.54 
 
 		 335 aa  67  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.299935  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1990  esterase, PHB depolymerase family  29.35 
 
 		 406 aa  65.9  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000642829  normal  0.085302 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2846  esterase, PHB depolymerase  31.78 
 
 		 398 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.222858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0535  esterase, PHB depolymerase family  27.49 
 
 		 338 aa  65.9  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.660761  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1651  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  25.43 
 
 		 323 aa  66.6  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0627752  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7221  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  29.59 
 
 		 363 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201442  normal  0.80823 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0080  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  26.8 
 
 		 286 aa  63.2  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1285  esterase, PHB depolymerase family  27.33 
 
 		 367 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.29485  normal  0.060549 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2059  phospholipase/carboxylesterase  25.4 
 
 		 343 aa  63.2  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.550035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0297  lpqC, putative  26.86 
 
 		 306 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.433259  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07050  hypothetical protein  25.96 
 
 		 322 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1945  esterase, PHB depolymerase family  34.62 
 
 		 344 aa  62.4  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.198099  normal  0.0353299 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2056  esterase, PHB depolymerase family  31.54 
 
 		 334 aa  62.8  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10962  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33500  esterase, poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  31.34 
 
 		 429 aa  62.4  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00180  conserved hypothetical protein  30.27 
 
 		 340 aa  61.6  0.00000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4883  PHB depolymerase family esterase  30 
 
 		 369 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103512  hitchhiker  0.0011428 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1211  esterase, PHB depolymerase family  26.53 
 
 		 312 aa  61.6  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0349548 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0595  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  31.49 
 
 		 364 aa  61.2  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1480  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  34.62 
 
 		 382 aa  60.8  0.00000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.289263  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1676  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  34.62 
 
 		 382 aa  60.8  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.254076  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2562  depolymerase  34.62 
 
 		 382 aa  60.8  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2425  PHB depolymerase family esterase  34.62 
 
 		 382 aa  60.8  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0332  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  34.62 
 
 		 364 aa  60.8  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.203676  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0301  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  34.62 
 
 		 367 aa  60.8  0.00000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0865  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  34.62 
 
 		 367 aa  60.8  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.208532  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2234  esterase, PHB depolymerase  31.01 
 
 		 369 aa  60.8  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.111052  normal  0.321017 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3270  esterase, PHB depolymerase  32.06 
 
 		 372 aa  60.8  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.67973 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6802  esterase, PHB depolymerase family  30.23 
 
 		 398 aa  60.5  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0419644  decreased coverage  0.000000125026 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4018  hypothetical protein  26.84 
 
 		 355 aa  60.5  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2268  esterase, PHB depolymerase family  33.85 
 
 		 344 aa  60.5  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.493113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1173  esterase, PHB depolymerase family  29.24 
 
 		 410 aa  58.9  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4502  esterase, PHB depolymerase  30.23 
 
 		 365 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.42248  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3862  PHB depolymerase family esterase  30.23 
 
 		 365 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0810078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3127  phospholipase/Carboxylesterase  23.53 
 
 		 314 aa  59.7  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.539584 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3665  PHB depolymerase family esterase  30.23 
 
 		 365 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.131134  normal  0.75521 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2770  PHB depolymerase family esterase  24.86 
 
 		 544 aa  58.9  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0579  esterase, putative  25.44 
 
 		 324 aa  58.9  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5085  polyhydroxybutyrate depolymerase  28.48 
 
 		 313 aa  58.5  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  normal  0.355318 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1969  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  24.47 
 
 		 363 aa  58.5  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0935555 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3360  esterase, PHB depolymerase family  31.03 
 
 		 419 aa  58.2  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.995755 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3344  PHB depolymerase family esterase  30.3 
 
 		 429 aa  58.2  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.335799  normal  0.68562 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3854  putative lipoprotein  25.43 
 
 		 336 aa  58.2  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.496382  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4602  esterase, PHB depolymerase  27.13 
 
 		 317 aa  57.8  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.462256  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5982  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  27.67 
 
 		 358 aa  57.4  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.221901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3660  PHB depolymerase family esterase  29.56 
 
 		 381 aa  57.4  0.0000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.741995  normal  0.231581 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3823  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  26.42 
 
 		 374 aa  57  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6278  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  27.71 
 
 		 358 aa  57  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2149  hypothetical protein  31.54 
 
 		 343 aa  55.8  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000536767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2820  esterase, PHB depolymerase family  24.43 
 
 		 352 aa  55.8  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000611867  hitchhiker  0.00921779 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4595  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  26.11 
 
 		 344 aa  56.2  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2509  esterase, PHB depolymerase family  26.49 
 
 		 489 aa  56.2  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.821888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6025  PHB depolymerase family esterase  24.77 
 
 		 416 aa  56.2  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.950963  normal  0.103792 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5706  PHB depolymerase family esterase  30.09 
 
 		 438 aa  56.6  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.137114  hitchhiker  0.00469436 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3959  esterase, PHB depolymerase family  27.27 
 
 		 423 aa  55.5  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0646  hypothetical protein  28.79 
 
 		 322 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399454  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2576  esterase, PHB depolymerase  26.67 
 
 		 396 aa  55.1  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.225739  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2650  hypothetical protein  27.33 
 
 		 355 aa  54.7  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.376354  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2633  PHB depolymerase family esterase  25.83 
 
 		 422 aa  54.7  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.655829 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2204  esterase, PHB depolymerase  28.79 
 
 		 367 aa  54.3  0.000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.667331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1940  PHB depolymerase family esterase  30.65 
 
 		 433 aa  53.9  0.000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2991  PHB depolymerase family esterase  24.74 
 
 		 419 aa  53.9  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4749  esterase, PHB depolymerase family  31.51 
 
 		 343 aa  53.5  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3217  hypothetical protein  25.53 
 
 		 282 aa  53.5  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3591  esterase, PHB depolymerase family  30.47 
 
 		 518 aa  53.9  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1385  putative Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  24.24 
 
 		 464 aa  53.1  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.516849  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5020  phospholipase/Carboxylesterase  26.59 
 
 		 563 aa  53.1  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.780509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  26.67 
 
 		 461 aa  53.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5937  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  24.41 
 
 		 421 aa  52.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0409  phospholipase/Carboxylesterase  28.16 
 
 		 277 aa  52.8  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00373212  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0493  esterase, PHB depolymerase family  26.44 
 
 		 378 aa  52.4  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2235  polyhydroxyalkanoate depolymerase domain-containing protein  27.03 
 
 		 427 aa  52  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00861555  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5573  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  25.68 
 
 		 421 aa  52.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.95415  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4958  esterase, PHB depolymerase family  29.69 
 
 		 451 aa  52.4  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.348858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6439  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  25.68 
 
 		 445 aa  52.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4407  PHB depolymerase family esterase  22.87 
 
 		 398 aa  52.4  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.32684  normal  0.707171 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3819  PHB depolymerase family esterase  29.71 
 
 		 419 aa  52  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2931  phospholipase/carboxylesterase  35.87 
 
 		 222 aa  51.6  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0242  cellulose-binding family II  25.55 
 
 		 447 aa  51.2  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1012  polyhydroxyalkanoate depolymerase domain-containing protein  27.03 
 
 		 427 aa  51.2  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2179  esterase, PHB depolymerase family  46.15 
 
 		 419 aa  51.2  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0072  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  27.42 
 
 		 392 aa  50.4  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1984  esterase, PHB depolymerase family  27.49 
 
 		 337 aa  50.4  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000502853  normal  0.034342 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4127  esterase, PHB depolymerase family  29.14 
 
 		 419 aa  50.4  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2245  esterase, PHB depolymerase family  28.12 
 
 		 432 aa  50.4  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.386893 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0364  putative polyhydroxybutyrate depolymerase  26.01 
 
 		 265 aa  50.1  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.81916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3198  putative polyhydroxybutyrate depolymerase  26.21 
 
 		 279 aa  50.1  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.396095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0242  phospholipase/Carboxylesterase  25.14 
 
 		 412 aa  50.1  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.080802  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10685  lipoprotein lpqP  26.42 
 
 		 280 aa  50.1  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.132448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0373  polyhydroxybutyrate depolymerase  27.08 
 
 		 357 aa  50.1  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0880654  hitchhiker  0.00622899 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3626  esterase, PHB depolymerase  24.61 
 
 		 362 aa  49.3  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.155827  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>