195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3127 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3127  phospholipase/Carboxylesterase  100 
 
 		 314 aa  654    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.539584 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07050  hypothetical protein  43.86 
 
 		 322 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0646  hypothetical protein  45.26 
 
 		 322 aa  231  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399454  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0297  lpqC, putative  39.79 
 
 		 306 aa  209  6e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.433259  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3891  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  34.62 
 
 		 298 aa  154  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.947481  normal  0.780646 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1400  phospholipase/Carboxylesterase  33.64 
 
 		 325 aa  150  2e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3485  hypothetical protein  38.06 
 
 		 269 aa  150  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1204  phospholipase/carboxylesterase  35.57 
 
 		 335 aa  145  6e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.299935  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0579  esterase, putative  33.82 
 
 		 324 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5085  polyhydroxybutyrate depolymerase  34.01 
 
 		 313 aa  127  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  normal  0.355318 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3217  hypothetical protein  33.33 
 
 		 282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1969  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  31.51 
 
 		 363 aa  118  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0935555 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5398  hypothetical protein  31.06 
 
 		 302 aa  115  7.999999999999999e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.330044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1590  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  33.45 
 
 		 353 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255211  normal  0.12664 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1493  phospholipase/Carboxylesterase  30.77 
 
 		 317 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.030471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10685  lipoprotein lpqP  31.6 
 
 		 280 aa  100  3e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.132448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13327  esterase lipoprotein lpqC  33.81 
 
 		 304 aa  100  3e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000167103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3854  putative lipoprotein  33.46 
 
 		 336 aa  99  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.496382  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2408  carbohydrate esterase family 1 protein  25.08 
 
 		 316 aa  95.9  9e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.211104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0373  polyhydroxybutyrate depolymerase  34.78 
 
 		 357 aa  94.4  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0880654  hitchhiker  0.00622899 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4460  polyhydroxybutyrate depolymerase  31.86 
 
 		 322 aa  94  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.403398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7236  putative LpqP (hydrolase/esterase)  36.9 
 
 		 405 aa  94  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0397136  normal  0.31443 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0967  putative esterase  35.35 
 
 		 244 aa  92.8  7e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.127871 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1167  hypothetical protein  30.66 
 
 		 471 aa  90.1  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.428408  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1573  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  28.9 
 
 		 326 aa  89  9e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0072  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  36.71 
 
 		 392 aa  83.6  0.000000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3576  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  29.12 
 
 		 451 aa  82  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.875939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3106  putative lipoprotein  35.03 
 
 		 341 aa  82  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4595  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  28.34 
 
 		 344 aa  81.3  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1290  hypothetical protein  33.33 
 
 		 305 aa  81.3  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1651  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  27.52 
 
 		 323 aa  80.5  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0627752  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1385  putative Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  26.64 
 
 		 464 aa  79  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.516849  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0080  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  34.94 
 
 		 286 aa  78.6  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1953  putative hydrolase  28.64 
 
 		 308 aa  75.5  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0001445  hitchhiker  0.00199711 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3966  phospholipase/carboxylesterase  26.34 
 
 		 795 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2752  phospholipase/carboxylesterase  26.14 
 
 		 309 aa  73.6  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3566  phospholipase/carboxylesterase  25.11 
 
 		 331 aa  70.5  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1211  esterase, PHB depolymerase family  27.03 
 
 		 312 aa  69.7  0.00000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0349548 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3959  esterase, PHB depolymerase family  32.32 
 
 		 423 aa  67.8  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  26.97 
 
 		 1002 aa  68.2  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0082  esterase, PHB depolymerase  24.92 
 
 		 414 aa  65.1  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1285  esterase, PHB depolymerase family  29.8 
 
 		 367 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.29485  normal  0.060549 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2261  putative esterase/lipase/thioesterase  26.4 
 
 		 361 aa  64.3  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556081  normal  0.0820217 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3990  Poly (3-hydroxybutyrate ) depolymerase  27.73 
 
 		 396 aa  63.9  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1240  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  26.04 
 
 		 370 aa  63.9  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.194401 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0535  esterase, PHB depolymerase family  30.37 
 
 		 338 aa  63.2  0.000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.660761  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2991  PHB depolymerase family esterase  29.84 
 
 		 419 aa  63.2  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2846  esterase, PHB depolymerase  28.57 
 
 		 398 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.222858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3660  PHB depolymerase family esterase  26.84 
 
 		 381 aa  62.4  0.000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.741995  normal  0.231581 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2301  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  31.03 
 
 		 232 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0713  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  28.42 
 
 		 287 aa  61.2  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0493  esterase, PHB depolymerase family  31.29 
 
 		 378 aa  60.5  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3270  esterase, PHB depolymerase  31.1 
 
 		 372 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.67973 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92192  predicted protein  28.42 
 
 		 486 aa  60.8  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.865019  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4602  esterase, PHB depolymerase  24.05 
 
 		 317 aa  60.1  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.462256  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1990  esterase, PHB depolymerase family  27.27 
 
 		 406 aa  60.1  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000642829  normal  0.085302 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0780  PHB depolymerase family esterase  33.87 
 
 		 436 aa  60.1  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0388  PHB depolymerase family esterase  23.13 
 
 		 442 aa  59.7  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.140919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3823  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  23.62 
 
 		 374 aa  59.7  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3290  esterase, PHB depolymerase family  26.62 
 
 		 450 aa  59.3  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1984  esterase, PHB depolymerase family  26.57 
 
 		 337 aa  58.5  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000502853  normal  0.034342 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3344  PHB depolymerase family esterase  31.64 
 
 		 429 aa  58.5  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.335799  normal  0.68562 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3842  phospholipase/carboxylesterase  28.75 
 
 		 236 aa  58.9  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2770  PHB depolymerase family esterase  25.73 
 
 		 544 aa  57.4  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26429  predicted protein  31.11 
 
 		 363 aa  57  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000229905  normal  0.222049 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2268  esterase, PHB depolymerase family  23.02 
 
 		 344 aa  56.6  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.493113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4407  PHB depolymerase family esterase  25.3 
 
 		 398 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.32684  normal  0.707171 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0726  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  25.19 
 
 		 462 aa  56.6  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401494  normal  0.100919 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0048  esterase, PHB depolymerase family  25.41 
 
 		 417 aa  56.6  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616843 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1945  esterase, PHB depolymerase family  23.08 
 
 		 344 aa  56.2  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.198099  normal  0.0353299 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2066  phospholipase/carboxylesterase  23.71 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.565731  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2633  PHB depolymerase family esterase  25.62 
 
 		 422 aa  55.1  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.655829 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3591  esterase, PHB depolymerase family  25.42 
 
 		 518 aa  55.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4958  esterase, PHB depolymerase family  25.42 
 
 		 451 aa  55.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.348858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2906  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  23.53 
 
 		 659 aa  55.5  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.686004  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6802  esterase, PHB depolymerase family  25.2 
 
 		 398 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0419644  decreased coverage  0.000000125026 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2149  hypothetical protein  29.13 
 
 		 343 aa  53.9  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000536767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3487  hypothetical protein  22.19 
 
 		 332 aa  53.9  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2061  phospholipase/Carboxylesterase  27.37 
 
 		 223 aa  54.3  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0179  PHB depolymerase family esterase  23.6 
 
 		 656 aa  53.5  0.000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.18087  normal  0.428012 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0568  esterase, PHB depolymerase family  27.56 
 
 		 395 aa  53.5  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0209  esterase, PHB depolymerase family  32.92 
 
 		 342 aa  53.5  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2650  hypothetical protein  24.66 
 
 		 355 aa  53.1  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.376354  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34810  esterase, poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  30.49 
 
 		 501 aa  53.1  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0371  esterase, PHB depolymerase  32.26 
 
 		 394 aa  52.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33500  esterase, poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  26.37 
 
 		 429 aa  52.4  0.000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3857  PHB depolymerase family esterase  25.88 
 
 		 414 aa  52  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4102  hypothetical protein  33.57 
 
 		 385 aa  52  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.943667 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1494  phospholipase/carboxylesterase  25.12 
 
 		 256 aa  52  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.259302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3258  phospholipase/carboxylesterase  24.59 
 
 		 228 aa  51.2  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2576  esterase, PHB depolymerase  30.88 
 
 		 396 aa  51.6  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.225739  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2065  esterase, PHB depolymerase  25.11 
 
 		 359 aa  51.6  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0523522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3665  PHB depolymerase family esterase  23.53 
 
 		 365 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.131134  normal  0.75521 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4502  esterase, PHB depolymerase  23.53 
 
 		 365 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.42248  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3862  PHB depolymerase family esterase  23.53 
 
 		 365 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0810078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2101  phospholipase/carboxylesterase  27.69 
 
 		 223 aa  51.6  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9052  polyhydroxybutyrate depolymerase  24.12 
 
 		 366 aa  51.6  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0063  phospholipase/carboxylesterase  25 
 
 		 227 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.982882  normal  0.670301 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0301  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  23.98 
 
 		 367 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2931  phospholipase/carboxylesterase  26.63 
 
 		 222 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>