118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1385 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1385  putative Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  100 
 
 		 464 aa  936    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.516849  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1384  hypothetical protein  97.8 
 
 		 485 aa  362  8e-99  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.539414  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0739  hypothetical protein  69.3 
 
 		 451 aa  301  2e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.66672  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00831  hypothetical protein  77.96 
 
 		 502 aa  299  9e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.752054 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1391  hypothetical protein  79.41 
 
 		 559 aa  282  8.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0741  hypothetical protein  65.75 
 
 		 467 aa  247  3e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15761  hypothetical protein  64.89 
 
 		 580 aa  241  2.9999999999999997e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.141645  normal  0.560169 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00651  hypothetical protein  59.89 
 
 		 363 aa  235  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.2704  normal  0.550522 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1389  C-type lectin  61.05 
 
 		 564 aa  232  1e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0622  hypothetical protein  61.75 
 
 		 1108 aa  231  2e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01021  hypothetical protein  60.22 
 
 		 595 aa  227  4e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.273299 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1403  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  49.59 
 
 		 595 aa  220  5e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.248524  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0743  hypothetical protein  59.16 
 
 		 621 aa  211  2e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0740  hypothetical protein  52.72 
 
 		 700 aa  206  6e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.294236  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0744  hypothetical protein  50 
 
 		 613 aa  197  5.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.316958  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00841  hypothetical protein  53.59 
 
 		 1584 aa  194  3e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0734  hypothetical protein  52.49 
 
 		 1821 aa  191  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0736  hypothetical protein  52.49 
 
 		 1543 aa  189  9e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.487887  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00851  hypothetical protein  58.33 
 
 		 193 aa  173  5e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1222  hypothetical protein  42.53 
 
 		 392 aa  149  9e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.111374  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20971  hypothetical protein  37.29 
 
 		 393 aa  140  7e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.468089 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1397  hypothetical protein  60.61 
 
 		 104 aa  129  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0311355  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1400  phospholipase/Carboxylesterase  31.54 
 
 		 325 aa  120  6e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2408  carbohydrate esterase family 1 protein  29.43 
 
 		 316 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.211104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00961  hypothetical protein  65.82 
 
 		 80 aa  112  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.312984  normal  0.920257 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3966  phospholipase/carboxylesterase  31.14 
 
 		 795 aa  111  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3854  putative lipoprotein  27.18 
 
 		 336 aa  105  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.496382  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1493  phospholipase/Carboxylesterase  27.34 
 
 		 317 aa  103  8e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.030471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2261  putative esterase/lipase/thioesterase  31.89 
 
 		 361 aa  102  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556081  normal  0.0820217 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1651  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  27.34 
 
 		 323 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0627752  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1573  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  28.46 
 
 		 326 aa  99.8  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1204  phospholipase/carboxylesterase  27.61 
 
 		 335 aa  97.1  7e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.299935  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07050  hypothetical protein  28.16 
 
 		 322 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0373  polyhydroxybutyrate depolymerase  29.95 
 
 		 357 aa  90.9  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0880654  hitchhiker  0.00622899 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3487  hypothetical protein  24.64 
 
 		 332 aa  90.9  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0579  esterase, putative  24.83 
 
 		 324 aa  90.1  8e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5085  polyhydroxybutyrate depolymerase  27.74 
 
 		 313 aa  88.2  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  normal  0.355318 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5398  hypothetical protein  27.31 
 
 		 302 aa  84.3  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.330044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1240  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  30.86 
 
 		 370 aa  83.6  0.000000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.194401 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10685  lipoprotein lpqP  27.59 
 
 		 280 aa  83.6  0.000000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.132448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0646  hypothetical protein  27.9 
 
 		 322 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399454  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4218  Allergen V5/Tpx-1 related  42.72 
 
 		 524 aa  81.3  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.245286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1953  putative hydrolase  27.62 
 
 		 308 aa  80.1  0.00000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0001445  hitchhiker  0.00199711 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3127  phospholipase/Carboxylesterase  26.64 
 
 		 314 aa  79  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.539584 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3891  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  24.79 
 
 		 298 aa  76.6  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.947481  normal  0.780646 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3576  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  26.82 
 
 		 451 aa  76.3  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.875939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1167  hypothetical protein  22.87 
 
 		 471 aa  76.6  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.428408  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13327  esterase lipoprotein lpqC  24.02 
 
 		 304 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000167103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0745  hypothetical protein  49.33 
 
 		 615 aa  72.8  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.676987  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0080  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  23.25 
 
 		 286 aa  72  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3983  serralysin  33.56 
 
 		 785 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  25.91 
 
 		 1002 aa  70.9  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3847  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.8 
 
 		 862 aa  70.5  0.00000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0267301  normal  0.766221 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1557  hypothetical protein  35.14 
 
 		 681 aa  68.6  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.208661 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0297  lpqC, putative  26.47 
 
 		 306 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.433259  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3106  putative lipoprotein  24.86 
 
 		 341 aa  68.2  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00180  conserved hypothetical protein  26.92 
 
 		 340 aa  67.8  0.0000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2059  phospholipase/carboxylesterase  23.64 
 
 		 343 aa  65.9  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.550035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0967  putative esterase  24.26 
 
 		 244 aa  63.9  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.127871 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1590  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  22.76 
 
 		 353 aa  64.3  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255211  normal  0.12664 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2257  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  26.92 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0876  hypothetical protein  33.91 
 
 		 1121 aa  63.5  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.728524 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0931  hemolysin-type calcium-binding region  35.4 
 
 		 484 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0749025  normal  0.0361729 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2301  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  25 
 
 		 232 aa  62.4  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1227  hypothetical protein  39.36 
 
 		 1037 aa  60.8  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3488  hypothetical protein  20.13 
 
 		 447 aa  60.8  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4595  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  29.38 
 
 		 344 aa  60.5  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21051  hypothetical protein  36.78 
 
 		 2178 aa  60.5  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.466354 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2149  hypothetical protein  23.51 
 
 		 343 aa  59.7  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000536767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0243  hemolysin-type calcium-binding region  28.09 
 
 		 768 aa  59.7  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2056  esterase, PHB depolymerase family  25.17 
 
 		 334 aa  58.5  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4883  PHB depolymerase family esterase  20.28 
 
 		 369 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103512  hitchhiker  0.0011428 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1794  hypothetical protein  36.14 
 
 		 480 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0790951 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1990  esterase, PHB depolymerase family  23.64 
 
 		 406 aa  56.2  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000642829  normal  0.085302 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0072  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  27.11 
 
 		 392 aa  55.5  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3217  hypothetical protein  25.15 
 
 		 282 aa  55.5  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05267  feruloyl esterase (Eurofung)  22.27 
 
 		 270 aa  55.1  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4460  polyhydroxybutyrate depolymerase  24.86 
 
 		 322 aa  54.7  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.403398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0713  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  24.72 
 
 		 287 aa  54.7  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1945  esterase, PHB depolymerase family  21.03 
 
 		 344 aa  54.3  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.198099  normal  0.0353299 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2268  esterase, PHB depolymerase family  21.03 
 
 		 344 aa  53.9  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.493113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1285  esterase, PHB depolymerase family  26.36 
 
 		 367 aa  53.9  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.29485  normal  0.060549 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7236  putative LpqP (hydrolase/esterase)  23.08 
 
 		 405 aa  53.5  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0397136  normal  0.31443 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3270  esterase, PHB depolymerase  25.58 
 
 		 372 aa  53.5  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.67973 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92192  predicted protein  25.11 
 
 		 486 aa  53.5  0.000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.865019  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  22.99 
 
 		 461 aa  52.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3198  putative polyhydroxybutyrate depolymerase  22.92 
 
 		 279 aa  52  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.396095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2906  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  25.74 
 
 		 659 aa  52  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.686004  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0242  cellulose-binding family II  25.15 
 
 		 447 aa  52.4  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3823  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  20.9 
 
 		 374 aa  51.6  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3566  phospholipase/carboxylesterase  21.48 
 
 		 331 aa  51.6  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4407  PHB depolymerase family esterase  20.74 
 
 		 398 aa  51.2  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.32684  normal  0.707171 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2234  esterase, PHB depolymerase  24.65 
 
 		 369 aa  50.4  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.111052  normal  0.321017 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1219  putative ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system ATPase component  33.33 
 
 		 459 aa  50.1  0.00008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.179515  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2752  phospholipase/carboxylesterase  23.3 
 
 		 309 aa  49.3  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4502  esterase, PHB depolymerase  20.95 
 
 		 365 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.42248  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3862  PHB depolymerase family esterase  20.95 
 
 		 365 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0810078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1290  hypothetical protein  22.15 
 
 		 305 aa  48.9  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1403  hemolysin-type calcium-binding region  32.14 
 
 		 482 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3665  PHB depolymerase family esterase  20.95 
 
 		 365 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.131134  normal  0.75521 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>