179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_07050 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_07050  hypothetical protein  100 
 
 		 322 aa  643    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0646  hypothetical protein  95.96 
 
 		 322 aa  578  1e-164  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399454  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3127  phospholipase/Carboxylesterase  41.53 
 
 		 314 aa  240  2.9999999999999997e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.539584 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0297  lpqC, putative  38.93 
 
 		 306 aa  190  4e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.433259  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5398  hypothetical protein  32.51 
 
 		 302 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.330044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1400  phospholipase/Carboxylesterase  33.21 
 
 		 325 aa  161  2e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3891  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  33.54 
 
 		 298 aa  153  5e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.947481  normal  0.780646 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3485  hypothetical protein  38.2 
 
 		 269 aa  151  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1969  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  34.77 
 
 		 363 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0935555 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3217  hypothetical protein  37.85 
 
 		 282 aa  139  8.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1204  phospholipase/carboxylesterase  32.52 
 
 		 335 aa  137  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.299935  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0579  esterase, putative  33.22 
 
 		 324 aa  132  6.999999999999999e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3854  putative lipoprotein  36.17 
 
 		 336 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.496382  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10685  lipoprotein lpqP  34.29 
 
 		 280 aa  124  2e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.132448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5085  polyhydroxybutyrate depolymerase  32.7 
 
 		 313 aa  122  7e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  normal  0.355318 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1590  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  33.33 
 
 		 353 aa  108  9.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255211  normal  0.12664 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0373  polyhydroxybutyrate depolymerase  37.04 
 
 		 357 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0880654  hitchhiker  0.00622899 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0967  putative esterase  37.56 
 
 		 244 aa  105  7e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.127871 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1493  phospholipase/Carboxylesterase  36.31 
 
 		 317 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.030471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13327  esterase lipoprotein lpqC  31.56 
 
 		 304 aa  103  6e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000167103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2408  carbohydrate esterase family 1 protein  25.95 
 
 		 316 aa  100  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.211104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2752  phospholipase/carboxylesterase  32.06 
 
 		 309 aa  99.4  8e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1573  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  33.33 
 
 		 326 aa  99  9e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1651  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  29.86 
 
 		 323 aa  98.6  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0627752  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4460  polyhydroxybutyrate depolymerase  33.33 
 
 		 322 aa  97.4  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.403398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3566  phospholipase/carboxylesterase  31.54 
 
 		 331 aa  95.9  9e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3966  phospholipase/carboxylesterase  29.39 
 
 		 795 aa  94  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7236  putative LpqP (hydrolase/esterase)  41.83 
 
 		 405 aa  93.2  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0397136  normal  0.31443 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0080  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  35.88 
 
 		 286 aa  92.4  9e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4595  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  33.33 
 
 		 344 aa  91.3  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1385  putative Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  28.16 
 
 		 464 aa  90.5  4e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.516849  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3106  putative lipoprotein  34.1 
 
 		 341 aa  85.1  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1290  hypothetical protein  39.47 
 
 		 305 aa  84.3  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3487  hypothetical protein  25.33 
 
 		 332 aa  79.7  0.00000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0072  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  35.88 
 
 		 392 aa  78.6  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1953  putative hydrolase  27.32 
 
 		 308 aa  77.8  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0001445  hitchhiker  0.00199711 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2301  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  39.19 
 
 		 232 aa  76.6  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3857  PHB depolymerase family esterase  29.48 
 
 		 414 aa  75.1  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2261  putative esterase/lipase/thioesterase  35.06 
 
 		 361 aa  73.2  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556081  normal  0.0820217 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1167  hypothetical protein  34.27 
 
 		 471 aa  72.4  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.428408  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1173  esterase, PHB depolymerase family  32.37 
 
 		 410 aa  72  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1211  esterase, PHB depolymerase family  34.21 
 
 		 312 aa  71.2  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0349548 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3576  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  32.96 
 
 		 451 aa  69.7  0.00000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.875939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3303  glycoside hydrolase family 62  27.81 
 
 		 436 aa  69.3  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000382833  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2650  hypothetical protein  29.32 
 
 		 355 aa  69.3  0.00000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.376354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3270  esterase, PHB depolymerase  27.48 
 
 		 372 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.67973 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0713  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  32.79 
 
 		 287 aa  68.9  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1240  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  32.45 
 
 		 370 aa  66.6  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.194401 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1990  esterase, PHB depolymerase family  36.64 
 
 		 406 aa  66.2  0.0000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000642829  normal  0.085302 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2576  esterase, PHB depolymerase  33.33 
 
 		 396 aa  65.1  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.225739  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2245  esterase, PHB depolymerase family  28.9 
 
 		 432 aa  65.1  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.386893 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0493  esterase, PHB depolymerase family  35.56 
 
 		 378 aa  65.5  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1285  esterase, PHB depolymerase family  30.99 
 
 		 367 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.29485  normal  0.060549 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4749  esterase, PHB depolymerase family  28.4 
 
 		 343 aa  65.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33500  esterase, poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  27.46 
 
 		 429 aa  65.1  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2770  PHB depolymerase family esterase  30.87 
 
 		 544 aa  64.3  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3344  PHB depolymerase family esterase  29.05 
 
 		 429 aa  63.5  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.335799  normal  0.68562 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92192  predicted protein  27.83 
 
 		 486 aa  63.2  0.000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.865019  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  26.53 
 
 		 1002 aa  62.8  0.000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0179  PHB depolymerase family esterase  27.59 
 
 		 656 aa  62.8  0.000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.18087  normal  0.428012 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2149  hypothetical protein  35.62 
 
 		 343 aa  62  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000536767  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0780  PHB depolymerase family esterase  27.34 
 
 		 436 aa  62  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3959  esterase, PHB depolymerase family  29.12 
 
 		 423 aa  62  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26429  predicted protein  40.66 
 
 		 363 aa  62.4  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000229905  normal  0.222049 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2065  esterase, PHB depolymerase  26.77 
 
 		 359 aa  61.6  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0523522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1020  hypothetical protein  32.53 
 
 		 260 aa  61.6  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2906  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  29.93 
 
 		 659 aa  61.2  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.686004  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1969  esterase, PHB depolymerase  29.23 
 
 		 373 aa  60.8  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.127109  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0301  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  31.82 
 
 		 367 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0865  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  31.82 
 
 		 367 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.208532  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1480  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  31.82 
 
 		 382 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.289263  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1676  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  31.82 
 
 		 382 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.254076  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2562  depolymerase  31.82 
 
 		 382 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2425  PHB depolymerase family esterase  31.82 
 
 		 382 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0388  PHB depolymerase family esterase  27.24 
 
 		 442 aa  60.1  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.140919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0332  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  31.82 
 
 		 364 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.203676  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00180  conserved hypothetical protein  30.3 
 
 		 340 aa  59.7  0.00000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5113  esterase, PHB depolymerase  29.66 
 
 		 370 aa  59.7  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.841359  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2056  esterase, PHB depolymerase family  29.44 
 
 		 334 aa  59.3  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4502  esterase, PHB depolymerase  30.8 
 
 		 365 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.42248  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3862  PHB depolymerase family esterase  30.8 
 
 		 365 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0810078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3665  PHB depolymerase family esterase  30.8 
 
 		 365 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.131134  normal  0.75521 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9052  polyhydroxybutyrate depolymerase  30.16 
 
 		 366 aa  58.9  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3290  esterase, PHB depolymerase family  27.2 
 
 		 450 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1984  esterase, PHB depolymerase family  35.77 
 
 		 337 aa  57.8  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000502853  normal  0.034342 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6240  PHB depolymerase family esterase  31.38 
 
 		 466 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.721378 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4883  PHB depolymerase family esterase  30.42 
 
 		 369 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103512  hitchhiker  0.0011428 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0595  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  30.88 
 
 		 364 aa  57  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2509  esterase, PHB depolymerase family  31.17 
 
 		 489 aa  57  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.821888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3660  PHB depolymerase family esterase  29.23 
 
 		 381 aa  56.6  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.741995  normal  0.231581 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2287  phospholipase/Carboxylesterase  35.83 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.191504  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0711  esterase, PHB depolymerase  26.23 
 
 		 392 aa  56.2  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.612274  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1945  esterase, PHB depolymerase family  32.88 
 
 		 344 aa  56.2  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.198099  normal  0.0353299 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0726  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  30.69 
 
 		 462 aa  56.2  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401494  normal  0.100919 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0082  esterase, PHB depolymerase  28.83 
 
 		 414 aa  55.8  0.0000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4602  esterase, PHB depolymerase  29.46 
 
 		 317 aa  55.8  0.0000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.462256  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2268  esterase, PHB depolymerase family  32.88 
 
 		 344 aa  55.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.493113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2066  phospholipase/carboxylesterase  30.23 
 
 		 238 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.565731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4958  esterase, PHB depolymerase family  23.66 
 
 		 451 aa  55.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.348858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7065  esterase, PHB depolymerase family  28.77 
 
 		 426 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.185362  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>