58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5398 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5398  hypothetical protein  100 
 
 		 302 aa  632  1e-180  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.330044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3891  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  52.53 
 
 		 298 aa  325  7e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.947481  normal  0.780646 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07050  hypothetical protein  34.03 
 
 		 322 aa  163  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0646  hypothetical protein  35.13 
 
 		 322 aa  159  7e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399454  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0579  esterase, putative  31.64 
 
 		 324 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1204  phospholipase/carboxylesterase  33.33 
 
 		 335 aa  134  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.299935  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1400  phospholipase/Carboxylesterase  33.5 
 
 		 325 aa  120  3e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0297  lpqC, putative  33.33 
 
 		 306 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.433259  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3127  phospholipase/Carboxylesterase  31.06 
 
 		 314 aa  115  7.999999999999999e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.539584 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3217  hypothetical protein  31.98 
 
 		 282 aa  99  9e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1651  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  29.64 
 
 		 323 aa  98.2  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0627752  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2408  carbohydrate esterase family 1 protein  27.45 
 
 		 316 aa  89.4  7e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.211104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3485  hypothetical protein  28.57 
 
 		 269 aa  87.4  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1573  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  28.06 
 
 		 326 aa  85.5  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1385  putative Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  27.31 
 
 		 464 aa  84.3  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.516849  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13327  esterase lipoprotein lpqC  30.32 
 
 		 304 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000167103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0373  polyhydroxybutyrate depolymerase  30.63 
 
 		 357 aa  83.6  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0880654  hitchhiker  0.00622899 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3966  phospholipase/carboxylesterase  29.57 
 
 		 795 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1969  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  25.41 
 
 		 363 aa  80.1  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0935555 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3854  putative lipoprotein  27.92 
 
 		 336 aa  79.3  0.00000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.496382  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1493  phospholipase/Carboxylesterase  29.89 
 
 		 317 aa  79  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.030471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5085  polyhydroxybutyrate depolymerase  27.86 
 
 		 313 aa  78.2  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  normal  0.355318 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2752  phospholipase/carboxylesterase  22.81 
 
 		 309 aa  76.3  0.0000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3566  phospholipase/carboxylesterase  24.46 
 
 		 331 aa  69.7  0.00000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1953  putative hydrolase  30.53 
 
 		 308 aa  65.9  0.0000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0001445  hitchhiker  0.00199711 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0967  putative esterase  26.32 
 
 		 244 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.127871 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2301  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  27.33 
 
 		 232 aa  63.9  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10685  lipoprotein lpqP  28.96 
 
 		 280 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.132448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3106  putative lipoprotein  23.97 
 
 		 341 aa  58.5  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7236  putative LpqP (hydrolase/esterase)  28.31 
 
 		 405 aa  57  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0397136  normal  0.31443 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0072  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  29.13 
 
 		 392 aa  57  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4595  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  26.78 
 
 		 344 aa  55.8  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4460  polyhydroxybutyrate depolymerase  28.24 
 
 		 322 aa  55.1  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.403398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26429  predicted protein  27.63 
 
 		 363 aa  52.8  0.000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000229905  normal  0.222049 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05267  feruloyl esterase (Eurofung)  29.87 
 
 		 270 aa  52.4  0.000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2066  phospholipase/carboxylesterase  27.11 
 
 		 238 aa  52  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.565731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  23.13 
 
 		 1002 aa  51.2  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3487  hypothetical protein  24.91 
 
 		 332 aa  49.3  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2257  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  22.07 
 
 		 270 aa  48.5  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3823  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  26.47 
 
 		 374 aa  48.5  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5113  esterase, PHB depolymerase  27.21 
 
 		 370 aa  47.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.841359  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1211  esterase, PHB depolymerase family  22.71 
 
 		 312 aa  47.4  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0349548 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3244  phospholipase/carboxylesterase  26.71 
 
 		 245 aa  47  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1590  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  23.62 
 
 		 353 aa  47  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255211  normal  0.12664 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1167  hypothetical protein  26.17 
 
 		 471 aa  46.2  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.428408  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1020  hypothetical protein  28.99 
 
 		 260 aa  45.8  0.0008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1633  carboxylesterase  25.51 
 
 		 223 aa  45.8  0.0009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00846065 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2261  putative esterase/lipase/thioesterase  24.1 
 
 		 361 aa  45.8  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556081  normal  0.0820217 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2056  esterase, PHB depolymerase family  24.86 
 
 		 334 aa  43.9  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2906  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  23.18 
 
 		 659 aa  43.5  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.686004  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1893  phospholipase/Carboxylesterase  26.04 
 
 		 223 aa  43.5  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2054  phospholipase/carboxylesterase  24.03 
 
 		 381 aa  43.5  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.287144  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08036  hypothetical protein  26.25 
 
 		 215 aa  43.1  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.119993  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  30.34 
 
 		 461 aa  42.7  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92192  predicted protein  20.94 
 
 		 486 aa  42.7  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.865019  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1240  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  22.52 
 
 		 370 aa  42.7  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.194401 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1454  phospholipase/carboxylesterase family protein  25.13 
 
 		 223 aa  42.4  0.009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.105501  normal  0.208922 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5020  phospholipase/Carboxylesterase  29.9 
 
 		 563 aa  42.4  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.780509  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>