84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2257 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2257  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  100 
 
 		 270 aa  554  1e-157  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1400  phospholipase/Carboxylesterase  27.75 
 
 		 325 aa  78.2  0.0000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1204  phospholipase/carboxylesterase  28.49 
 
 		 335 aa  76.6  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.299935  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05267  feruloyl esterase (Eurofung)  27.7 
 
 		 270 aa  74.3  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0373  polyhydroxybutyrate depolymerase  34.21 
 
 		 357 aa  74.3  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0880654  hitchhiker  0.00622899 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1385  putative Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  27.57 
 
 		 464 aa  73.2  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.516849  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1493  phospholipase/Carboxylesterase  29.94 
 
 		 317 aa  73.2  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.030471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3966  phospholipase/carboxylesterase  28.33 
 
 		 795 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2408  carbohydrate esterase family 1 protein  25.36 
 
 		 316 aa  70.9  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.211104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  27.72 
 
 		 461 aa  70.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  23.63 
 
 		 1002 aa  69.7  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3303  glycoside hydrolase family 62  28.7 
 
 		 436 aa  68.6  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000382833  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1953  putative hydrolase  29.03 
 
 		 308 aa  67.8  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0001445  hitchhiker  0.00199711 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1969  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  27.23 
 
 		 363 aa  67.4  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0935555 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5085  polyhydroxybutyrate depolymerase  30.52 
 
 		 313 aa  65.9  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  normal  0.355318 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0242  cellulose-binding family II  26.09 
 
 		 447 aa  65.5  0.0000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4595  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  27.9 
 
 		 344 aa  61.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3198  putative polyhydroxybutyrate depolymerase  25.83 
 
 		 279 aa  61.6  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.396095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1573  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  25.88 
 
 		 326 aa  60.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4839  phospholipase/Carboxylesterase  25.22 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3891  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  23.72 
 
 		 298 aa  59.3  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.947481  normal  0.780646 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0579  esterase, putative  24.88 
 
 		 324 aa  58.9  0.00000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13327  esterase lipoprotein lpqC  35.19 
 
 		 304 aa  58.9  0.00000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000167103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1651  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  28.57 
 
 		 323 aa  58.9  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0627752  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10685  lipoprotein lpqP  25.58 
 
 		 280 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.132448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1106  hypothetical protein  28.25 
 
 		 355 aa  58.5  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.117901 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07050  hypothetical protein  27.45 
 
 		 322 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5584  phospholipase/carboxylesterase  29.01 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0297  lpqC, putative  24.03 
 
 		 306 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.433259  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4460  polyhydroxybutyrate depolymerase  25.95 
 
 		 322 aa  56.2  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.403398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5398  hypothetical protein  23.61 
 
 		 302 aa  55.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.330044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3106  putative lipoprotein  25.86 
 
 		 341 aa  55.5  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0335  phospholipase/carboxylesterase  23.79 
 
 		 357 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.64094  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4230  phospholipase/Carboxylesterase  26.79 
 
 		 268 aa  53.1  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.58568  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1536  putative polyhydroxybutyrate depolymerase  25.1 
 
 		 276 aa  53.1  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.26582  normal  0.221996 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0548  phospholipase/Carboxylesterase  24.27 
 
 		 358 aa  53.1  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.185297  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2261  putative esterase/lipase/thioesterase  25.73 
 
 		 361 aa  52.8  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556081  normal  0.0820217 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4055  phospholipase/carboxylesterase  27.53 
 
 		 242 aa  52.4  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.342724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1020  hypothetical protein  29.58 
 
 		 260 aa  52  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1208  phospholipase/carboxylesterase  23.28 
 
 		 239 aa  52  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.12535 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0364  putative polyhydroxybutyrate depolymerase  34.48 
 
 		 265 aa  51.6  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.81916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1368  phospholipase/Carboxylesterase  23.28 
 
 		 239 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00180  conserved hypothetical protein  31.79 
 
 		 340 aa  51.2  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3854  putative lipoprotein  28.4 
 
 		 336 aa  51.2  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.496382  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5249  phospholipase/carboxylesterase  27.31 
 
 		 243 aa  51.2  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0855258  normal  0.417619 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0646  hypothetical protein  27.49 
 
 		 322 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399454  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3217  hypothetical protein  24.23 
 
 		 282 aa  50.4  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0080  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  27.22 
 
 		 286 aa  50.8  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5020  phospholipase/Carboxylesterase  31.86 
 
 		 563 aa  50.1  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.780509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3127  phospholipase/Carboxylesterase  26.06 
 
 		 314 aa  50.4  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.539584 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3037  hypothetical protein  25.52 
 
 		 850 aa  49.7  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.762203  normal  0.221922 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1167  hypothetical protein  26.47 
 
 		 471 aa  49.3  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.428408  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0967  putative esterase  33.65 
 
 		 244 aa  48.9  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.127871 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2301  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  29.66 
 
 		 232 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1105  phospholipase/carboxylesterase  25.27 
 
 		 253 aa  48.5  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.320599  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3576  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  27.54 
 
 		 451 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.875939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2752  phospholipase/carboxylesterase  25.64 
 
 		 309 aa  47.4  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0490  hypothetical protein  26.87 
 
 		 357 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.637254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26429  predicted protein  22.86 
 
 		 363 aa  47  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000229905  normal  0.222049 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3487  hypothetical protein  26.2 
 
 		 332 aa  47  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7236  putative LpqP (hydrolase/esterase)  26.22 
 
 		 405 aa  47.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0397136  normal  0.31443 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1240  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  31.62 
 
 		 370 aa  47.4  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.194401 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0060  phospholipase/carboxylesterase  23.81 
 
 		 226 aa  46.6  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.885579  normal  0.31865 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1590  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  26.14 
 
 		 353 aa  46.6  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255211  normal  0.12664 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2633  PHB depolymerase family esterase  26.24 
 
 		 422 aa  46.6  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.655829 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2906  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  30.51 
 
 		 659 aa  46.2  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.686004  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0696  phospholipase/Carboxylesterase  25.58 
 
 		 218 aa  46.2  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3959  esterase, PHB depolymerase family  27.22 
 
 		 423 aa  45.8  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0726  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  30.25 
 
 		 462 aa  45.8  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401494  normal  0.100919 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1229  hypothetical protein  29.52 
 
 		 816 aa  45.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.737589  hitchhiker  0.00225369 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0072  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  23.46 
 
 		 392 aa  45.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6756  phospholipase/carboxylesterase  22.18 
 
 		 225 aa  45.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.847027  normal  0.369639 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2269  hypothetical protein  26.26 
 
 		 261 aa  44.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.187168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1052  phospholipase/carboxylesterase  38.6 
 
 		 365 aa  44.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3270  esterase, PHB depolymerase  26.7 
 
 		 372 aa  44.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.67973 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0063  phospholipase/carboxylesterase  24.31 
 
 		 227 aa  44.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.982882  normal  0.670301 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1716  phospholipase/Carboxylesterase  26.16 
 
 		 217 aa  43.5  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0890  phospholipase/carboxylesterase  33.75 
 
 		 417 aa  43.5  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00284338  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1148  phospholipase/Carboxylesterase  23.21 
 
 		 239 aa  43.9  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0912  phospholipase/carboxylesterase  32.5 
 
 		 417 aa  43.1  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0349753  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0185  hypothetical protein  22.88 
 
 		 446 aa  42.4  0.009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000162284  hitchhiker  0.000128495 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2056  esterase, PHB depolymerase family  23.08 
 
 		 334 aa  42.4  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10962  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2509  esterase, PHB depolymerase family  32.84 
 
 		 489 aa  42.4  0.009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.821888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1290  hypothetical protein  25.66 
 
 		 305 aa  42.4  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>