75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_2301 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_2301  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  100 
 
 
232 aa  476  1e-133  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1651  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  91.57 
 
 
323 aa  345  4e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0627752  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1573  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  81.09 
 
 
326 aa  340  1e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2408  carbohydrate esterase family 1 protein  30.73 
 
 
316 aa  94.4  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.211104  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1969  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  32.97 
 
 
363 aa  90.9  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0935555 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1493  phospholipase/Carboxylesterase  32.24 
 
 
317 aa  84  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.030471  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3217  hypothetical protein  38.16 
 
 
282 aa  83.2  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3854  putative lipoprotein  39.01 
 
 
336 aa  82.8  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.496382  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5085  polyhydroxybutyrate depolymerase  37.57 
 
 
313 aa  82.4  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  normal  0.355318 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1204  phospholipase/carboxylesterase  31.22 
 
 
335 aa  80.9  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.299935  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3966  phospholipase/carboxylesterase  29.79 
 
 
795 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13327  esterase lipoprotein lpqC  35.71 
 
 
304 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000167103  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1590  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  33.15 
 
 
353 aa  77.4  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255211  normal  0.12664 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07050  hypothetical protein  39.19 
 
 
322 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10685  lipoprotein lpqP  39.16 
 
 
280 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.132448  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1400  phospholipase/Carboxylesterase  31.75 
 
 
325 aa  73.9  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2752  phospholipase/carboxylesterase  30.39 
 
 
309 aa  72.8  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4460  polyhydroxybutyrate depolymerase  34.39 
 
 
322 aa  72  0.000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.403398  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3106  putative lipoprotein  40.95 
 
 
341 aa  70.5  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0373  polyhydroxybutyrate depolymerase  35.24 
 
 
357 aa  68.9  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0880654  hitchhiker  0.00622899 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0646  hypothetical protein  38.1 
 
 
322 aa  68.9  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399454  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0726  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  32.61 
 
 
462 aa  68.9  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401494  normal  0.100919 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0967  putative esterase  35.33 
 
 
244 aa  68.2  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.127871 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0579  esterase, putative  29.67 
 
 
324 aa  67  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4595  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  35.95 
 
 
344 aa  66.6  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3566  phospholipase/carboxylesterase  28.42 
 
 
331 aa  66.2  0.0000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3487  hypothetical protein  28.5 
 
 
332 aa  65.1  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5398  hypothetical protein  27.33 
 
 
302 aa  63.9  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.330044  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1385  putative Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  25 
 
 
464 aa  62.4  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.516849  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1240  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  34.27 
 
 
370 aa  62.4  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.194401 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3127  phospholipase/Carboxylesterase  31.03 
 
 
314 aa  62  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.539584 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2261  putative esterase/lipase/thioesterase  33.1 
 
 
361 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556081  normal  0.0820217 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92192  predicted protein  36.07 
 
 
486 aa  60.5  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.865019  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0072  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  42.25 
 
 
392 aa  60.8  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1167  hypothetical protein  31.69 
 
 
471 aa  58.5  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.428408  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3488  hypothetical protein  27.45 
 
 
447 aa  57.8  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3891  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  30.87 
 
 
298 aa  57.4  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.947481  normal  0.780646 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  29.73 
 
 
1002 aa  57  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7236  putative LpqP (hydrolase/esterase)  40 
 
 
405 aa  56.6  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0397136  normal  0.31443 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0713  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  37.76 
 
 
287 aa  55.1  0.0000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3485  hypothetical protein  31.89 
 
 
269 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1953  putative hydrolase  33.58 
 
 
308 aa  54.3  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0001445  hitchhiker  0.00199711 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0080  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  31.98 
 
 
286 aa  53.5  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1290  hypothetical protein  38.2 
 
 
305 aa  53.1  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3576  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  30.56 
 
 
451 aa  52.4  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.875939  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4230  phospholipase/Carboxylesterase  41.27 
 
 
268 aa  52.4  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.58568  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0297  lpqC, putative  28.96 
 
 
306 aa  52.4  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.433259  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3198  putative polyhydroxybutyrate depolymerase  30.12 
 
 
279 aa  52  0.000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.396095  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  42.03 
 
 
461 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26429  predicted protein  36.99 
 
 
363 aa  50.4  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000229905  normal  0.222049 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2650  hypothetical protein  28.21 
 
 
355 aa  48.5  0.00008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.376354  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5020  phospholipase/Carboxylesterase  40 
 
 
563 aa  47  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.780509  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3303  glycoside hydrolase family 62  39.13 
 
 
436 aa  47.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000382833  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05267  feruloyl esterase (Eurofung)  36.23 
 
 
270 aa  46.2  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33500  esterase, poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  25.42 
 
 
429 aa  46.6  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2820  esterase, PHB depolymerase family  31.16 
 
 
352 aa  45.8  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000611867  hitchhiker  0.00921779 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2065  esterase, PHB depolymerase  29.81 
 
 
359 aa  45.1  0.0009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0523522  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0364  putative polyhydroxybutyrate depolymerase  36.49 
 
 
265 aa  44.3  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.81916  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3270  esterase, PHB depolymerase  27.38 
 
 
372 aa  44.7  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.67973 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1020  hypothetical protein  36.11 
 
 
260 aa  44.3  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2906  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  29.35 
 
 
659 aa  44.3  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.686004  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3857  PHB depolymerase family esterase  28.21 
 
 
414 aa  43.5  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1990  esterase, PHB depolymerase family  30.11 
 
 
406 aa  43.5  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000642829  normal  0.085302 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0493  esterase, PHB depolymerase family  58.82 
 
 
378 aa  43.1  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00180  conserved hypothetical protein  29.19 
 
 
340 aa  43.1  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1285  esterase, PHB depolymerase family  26.95 
 
 
367 aa  42.7  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.29485  normal  0.060549 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5409  phospholipase/Carboxylesterase  38.64 
 
 
468 aa  42.4  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.301225 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5249  phospholipase/carboxylesterase  50 
 
 
243 aa  42.4  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0855258  normal  0.417619 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6802  esterase, PHB depolymerase family  27.57 
 
 
398 aa  42.4  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0419644  decreased coverage  0.000000125026 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1547  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  42.55 
 
 
492 aa  42  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1342  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase precursor  42.55 
 
 
492 aa  42  0.009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.968046  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0529  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  42.55 
 
 
492 aa  42  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0624  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase precursor  42.55 
 
 
492 aa  42  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.520528  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1740  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  42.55 
 
 
492 aa  42  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.548806  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0824  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  42.55 
 
 
492 aa  42  0.009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0168099  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>