More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0243 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_0243  carboxymethylenebutenolidase  100 
 
 
278 aa  571  1.0000000000000001e-162  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3951  carboxymethylenebutenolidase  76.68 
 
 
290 aa  456  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3647  dienelactone hydrolase family protein  76.68 
 
 
290 aa  456  1e-127  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0265  dienelactone hydrolase family protein  76.68 
 
 
290 aa  456  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3933  Carboxymethylenebutenolidase  74.09 
 
 
275 aa  432  1e-120  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0186  Carboxymethylenebutenolidase  73.36 
 
 
275 aa  426  1e-118  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4353  Carboxymethylenebutenolidase  72.26 
 
 
275 aa  423  1e-117  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3963  carboxymethylenebutenolidase  74.52 
 
 
268 aa  422  1e-117  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4070  Carboxymethylenebutenolidase  71.53 
 
 
275 aa  421  1e-117  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03717  predicted hydrolase  72.9 
 
 
269 aa  412  1e-114  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4206  dienelactone hydrolase family protein  73.28 
 
 
269 aa  413  1e-114  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000877073 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03666  hypothetical protein  72.9 
 
 
267 aa  412  1e-114  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4351  dienelactone hydrolase family protein  72.41 
 
 
271 aa  409  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4149  Carboxymethylenebutenolidase  71.65 
 
 
271 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4054  dienelactone hydrolase family protein  71.65 
 
 
271 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4178  carboxymethylenebutenolidase  72.03 
 
 
271 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0221316 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4198  dienelactone hydrolase  70.48 
 
 
291 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4175  dienelactone hydrolase  70.48 
 
 
291 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4294  dienelactone hydrolase  70.48 
 
 
291 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4247  dienelactone hydrolase  70.48 
 
 
291 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.750594  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4302  dienelactone hydrolase family protein  71.26 
 
 
270 aa  402  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5271  dienelactone hydrolase family protein  71.65 
 
 
271 aa  404  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.198587 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4024  twin-arginine translocation pathway signal  61.3 
 
 
278 aa  336  2.9999999999999997e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2140  Carboxymethylenebutenolidase  61.07 
 
 
291 aa  331  1e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.324009 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1804  carboxymethylenebutenolidase  60.69 
 
 
291 aa  328  7e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.692278  normal  0.911676 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1951  dienelactone hydrolase  61.07 
 
 
291 aa  323  1e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2042  carboxymethylenebutenolidase  62.21 
 
 
291 aa  324  1e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000295478 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1756  Carboxymethylenebutenolidase  59.92 
 
 
291 aa  322  3e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0969  carboxymethylenebutenolidase  59.62 
 
 
275 aa  321  9.999999999999999e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.35084  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3586  carboxymethylenebutenolidase  60.15 
 
 
295 aa  320  1.9999999999999998e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3285  Carboxymethylenebutenolidase  58.62 
 
 
280 aa  319  3e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5324  carboxymethylenebutenolidase  60.85 
 
 
298 aa  317  1e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1943  carboxymethylenebutenolidase  60.23 
 
 
302 aa  316  3e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0524201  normal  0.0241824 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3005  carboxymethylenebutenolidase  59.7 
 
 
290 aa  310  2e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0541366  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2622  twin-arginine translocation pathway signal  56.88 
 
 
291 aa  309  2.9999999999999997e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.626056 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2832  dienelactone hydrolase  56.36 
 
 
290 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4421  carboxymethylenebutenolidase  57.41 
 
 
290 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.842964  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2668  Carboxymethylenebutenolidase  58.04 
 
 
297 aa  304  1.0000000000000001e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.240942  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3316  carboxymethylenebutenolidase  58.04 
 
 
297 aa  304  1.0000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0813595  normal  0.0640539 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1548  Carboxymethylenebutenolidase  57.04 
 
 
299 aa  303  2.0000000000000002e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0774  Carboxymethylenebutenolidase  59.53 
 
 
300 aa  301  7.000000000000001e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.12147  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6786  Carboxymethylenebutenolidase  55.27 
 
 
294 aa  301  8.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00592953  hitchhiker  0.00000947309 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0181  twin-arginine translocation pathway signal  56.82 
 
 
291 aa  301  9e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.972702  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0875  twin-arginine translocation pathway signal  60.96 
 
 
291 aa  300  1e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0999257  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0609  carboxymethylenebutenolidase  54.44 
 
 
290 aa  299  4e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2540  carboxymethylenebutenolidase  53.96 
 
 
339 aa  291  8e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2398  carboxymethylenebutenolidase  53.96 
 
 
339 aa  290  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2228  putative carboxymethylenebutenolidase (dienelactone hydrolase) protein  53.99 
 
 
293 aa  290  2e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1700  carboxymethylenebutenolidase  53.96 
 
 
291 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1506  carboxymethylenebutenolidase  53.96 
 
 
291 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.893969  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0358  carboxymethylenebutenolidase  53.96 
 
 
291 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0848  carboxymethylenebutenolidase  53.58 
 
 
291 aa  289  4e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1733  carboxymethylenebutenolidase  53.82 
 
 
307 aa  285  5.999999999999999e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.353507 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4825  carboxymethylenebutenolidase  51.7 
 
 
291 aa  285  8e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00463404  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1710  carboxymethylenebutenolidase  52.63 
 
 
291 aa  283  2.0000000000000002e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3245  carboxymethylenebutenolidase  52.45 
 
 
291 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0210034 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0324  carboxymethylenebutenolidase  53.91 
 
 
256 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4491  twin-arginine translocation pathway signal  50.94 
 
 
291 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3874  carboxymethylenebutenolidase  50.94 
 
 
291 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630972  normal  0.609004 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3653  carboxymethylenebutenolidase  50.94 
 
 
291 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19765  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3771  carboxymethylenebutenolidase  51.7 
 
 
291 aa  280  2e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0116114 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2040  Carboxymethylenebutenolidase  51.81 
 
 
292 aa  279  3e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.143956  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2433  Carboxymethylenebutenolidase  51.81 
 
 
292 aa  278  8e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2216  dienelactone hydrolase  51.35 
 
 
291 aa  275  4e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.60917  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4626  Carboxymethylenebutenolidase  47.39 
 
 
277 aa  269  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000529247 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2733  carboxymethylenebutenolidase  49.81 
 
 
290 aa  261  8e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5221  putative carboxymethylenebutenolidase precursor (dienelactone hydrolase  50.19 
 
 
270 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0554108  normal  0.200336 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0943  Carboxymethylenebutenolidase  47.31 
 
 
287 aa  237  2e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00110752 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0536  carboxymethylenebutenolidase  39.51 
 
 
239 aa  147  3e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.192606 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  32.51 
 
 
251 aa  138  7.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0949  Carboxymethylenebutenolidase  35.06 
 
 
261 aa  139  7.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00366545  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3405  Carboxymethylenebutenolidase  35.74 
 
 
246 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6096  carboxymethylenebutenolidase  42.67 
 
 
238 aa  132  5e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0559809 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4930  Carboxymethylenebutenolidase  38.2 
 
 
227 aa  132  6e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0665407  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4136  carboxymethylenebutenolidase  36.4 
 
 
324 aa  130  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1212  Carboxymethylenebutenolidase  32.31 
 
 
248 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1987  twin-arginine translocation pathway signal  32.87 
 
 
291 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2806  dienelactone hydrolase family protein  33.63 
 
 
295 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0255  Carboxymethylenebutenolidase  38.3 
 
 
229 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.781459  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0260  carboxymethylenebutenolidase  38.3 
 
 
229 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785902 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4312  dienelactone hydrolase family protein  34.52 
 
 
295 aa  125  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2838  carboxymethylenebutenolidase  38.08 
 
 
230 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3138  dienelactone hydrolase family protein  38.08 
 
 
230 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0053  dienelactone hydrolase  38.08 
 
 
230 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3915  dienelactone hydrolase family protein  38.08 
 
 
230 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.306599  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3413  dienelactone hydrolase family protein  38.08 
 
 
230 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.934398  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1705  dienelactone hydrolase family protein  38.08 
 
 
230 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2503  carboxymethylenebutenolidase  30.99 
 
 
245 aa  124  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3834  dienelactone hydrolase family protein  38.08 
 
 
230 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.356995  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3313  twin-arginine translocation pathway signal  35.5 
 
 
296 aa  124  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02875  predicted hydrolase  34.52 
 
 
254 aa  123  3e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3469  dienelactone hydrolase family protein  34.52 
 
 
295 aa  123  3e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4876  carboxymethylenebutenolidase  35.41 
 
 
254 aa  123  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.21455 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3286  dienelactone hydrolase family protein  34.52 
 
 
295 aa  123  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7870  putative carboxymethylenebutenolidase  37.02 
 
 
223 aa  122  6e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0089  carboxymethylenebutenolidase  34.04 
 
 
244 aa  121  9.999999999999999e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3160  carboxymethylenebutenolidase  37.24 
 
 
230 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.300765  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0608  carboxymethylenebutenolidase  35.09 
 
 
272 aa  121  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3409  carboxymethylenebutenolidase  33.94 
 
 
295 aa  120  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0321  carboxymethylenebutenolidase  36.29 
 
 
229 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>