More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A0848 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A2540  carboxymethylenebutenolidase  99.66 
 
 
339 aa  594  1e-169  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0848  carboxymethylenebutenolidase  100 
 
 
291 aa  595  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1506  carboxymethylenebutenolidase  99.66 
 
 
291 aa  594  1e-169  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.893969  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1700  carboxymethylenebutenolidase  99.66 
 
 
291 aa  594  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0358  carboxymethylenebutenolidase  99.66 
 
 
291 aa  594  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2398  carboxymethylenebutenolidase  99.31 
 
 
339 aa  592  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0609  carboxymethylenebutenolidase  93.47 
 
 
290 aa  556  1e-157  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0324  carboxymethylenebutenolidase  99.22 
 
 
256 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4825  carboxymethylenebutenolidase  80.07 
 
 
291 aa  498  1e-140  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00463404  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3771  carboxymethylenebutenolidase  80.41 
 
 
291 aa  496  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0116114 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3653  carboxymethylenebutenolidase  78.69 
 
 
291 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19765  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4491  twin-arginine translocation pathway signal  78.69 
 
 
291 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3245  carboxymethylenebutenolidase  79.38 
 
 
291 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0210034 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3874  carboxymethylenebutenolidase  78.69 
 
 
291 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630972  normal  0.609004 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2216  dienelactone hydrolase  78.01 
 
 
291 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.60917  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2832  dienelactone hydrolase  68.62 
 
 
290 aa  421  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6786  Carboxymethylenebutenolidase  67.93 
 
 
294 aa  418  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00592953  hitchhiker  0.00000947309 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4421  carboxymethylenebutenolidase  65.86 
 
 
290 aa  409  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.842964  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2228  putative carboxymethylenebutenolidase (dienelactone hydrolase) protein  62.63 
 
 
293 aa  380  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2622  twin-arginine translocation pathway signal  61.03 
 
 
291 aa  374  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.626056 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2040  Carboxymethylenebutenolidase  58.62 
 
 
292 aa  364  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.143956  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2433  Carboxymethylenebutenolidase  58.97 
 
 
292 aa  363  2e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0875  twin-arginine translocation pathway signal  60.82 
 
 
291 aa  356  1.9999999999999998e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0999257  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3005  carboxymethylenebutenolidase  58.62 
 
 
290 aa  337  9.999999999999999e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0541366  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3586  carboxymethylenebutenolidase  59.27 
 
 
295 aa  327  2.0000000000000001e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1943  carboxymethylenebutenolidase  56.04 
 
 
302 aa  325  8.000000000000001e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0524201  normal  0.0241824 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4024  twin-arginine translocation pathway signal  57.55 
 
 
278 aa  322  6e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0181  twin-arginine translocation pathway signal  53.98 
 
 
291 aa  318  6e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.972702  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2140  Carboxymethylenebutenolidase  53.95 
 
 
291 aa  315  5e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.324009 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1804  carboxymethylenebutenolidase  54.51 
 
 
291 aa  313  9.999999999999999e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.692278  normal  0.911676 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1756  Carboxymethylenebutenolidase  54.86 
 
 
291 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1951  dienelactone hydrolase  53.82 
 
 
291 aa  312  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0969  carboxymethylenebutenolidase  54.15 
 
 
275 aa  310  2e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.35084  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1548  Carboxymethylenebutenolidase  55.07 
 
 
299 aa  307  1.0000000000000001e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3285  Carboxymethylenebutenolidase  52.31 
 
 
280 aa  302  4.0000000000000003e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2042  carboxymethylenebutenolidase  51.37 
 
 
291 aa  299  3e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000295478 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1733  carboxymethylenebutenolidase  53.41 
 
 
307 aa  295  5e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.353507 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2668  Carboxymethylenebutenolidase  52.72 
 
 
297 aa  295  5e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.240942  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3316  carboxymethylenebutenolidase  52.72 
 
 
297 aa  295  5e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0813595  normal  0.0640539 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5324  carboxymethylenebutenolidase  54.71 
 
 
298 aa  295  8e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4070  Carboxymethylenebutenolidase  52.09 
 
 
275 aa  291  9e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0186  Carboxymethylenebutenolidase  53.99 
 
 
275 aa  291  1e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4353  Carboxymethylenebutenolidase  52.65 
 
 
275 aa  289  4e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0243  carboxymethylenebutenolidase  53.58 
 
 
278 aa  289  4e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3963  carboxymethylenebutenolidase  52.47 
 
 
268 aa  288  8e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3933  Carboxymethylenebutenolidase  52.47 
 
 
275 aa  286  2e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4149  Carboxymethylenebutenolidase  52.67 
 
 
271 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4054  dienelactone hydrolase family protein  52.67 
 
 
271 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5271  dienelactone hydrolase family protein  52.67 
 
 
271 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.198587 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4198  dienelactone hydrolase  53.44 
 
 
291 aa  282  4.0000000000000003e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4175  dienelactone hydrolase  53.44 
 
 
291 aa  282  4.0000000000000003e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0774  Carboxymethylenebutenolidase  50.54 
 
 
300 aa  282  4.0000000000000003e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.12147  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4247  dienelactone hydrolase  53.44 
 
 
291 aa  282  4.0000000000000003e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.750594  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4294  dienelactone hydrolase  53.44 
 
 
291 aa  282  4.0000000000000003e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03717  predicted hydrolase  52.47 
 
 
269 aa  281  7.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4351  dienelactone hydrolase family protein  52.29 
 
 
271 aa  281  7.000000000000001e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03666  hypothetical protein  52.47 
 
 
267 aa  281  9e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4206  dienelactone hydrolase family protein  52.47 
 
 
269 aa  281  1e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000877073 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4178  carboxymethylenebutenolidase  52.29 
 
 
271 aa  280  2e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0221316 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3647  dienelactone hydrolase family protein  51.62 
 
 
290 aa  278  5e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0265  dienelactone hydrolase family protein  51.26 
 
 
290 aa  277  1e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3951  carboxymethylenebutenolidase  51.26 
 
 
290 aa  277  1e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1710  carboxymethylenebutenolidase  51.58 
 
 
291 aa  276  3e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4302  dienelactone hydrolase family protein  51.53 
 
 
270 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4626  Carboxymethylenebutenolidase  46.35 
 
 
277 aa  266  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000529247 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2733  carboxymethylenebutenolidase  48.56 
 
 
290 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5221  putative carboxymethylenebutenolidase precursor (dienelactone hydrolase  46.13 
 
 
270 aa  241  1e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0554108  normal  0.200336 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0943  Carboxymethylenebutenolidase  44.64 
 
 
287 aa  231  8.000000000000001e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00110752 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0949  Carboxymethylenebutenolidase  34.77 
 
 
261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00366545  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0536  carboxymethylenebutenolidase  37.04 
 
 
239 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.192606 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6096  carboxymethylenebutenolidase  38.08 
 
 
238 aa  119  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0559809 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4136  carboxymethylenebutenolidase  33.2 
 
 
324 aa  118  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1212  Carboxymethylenebutenolidase  30.95 
 
 
248 aa  112  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1987  twin-arginine translocation pathway signal  30.69 
 
 
291 aa  112  9e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2806  dienelactone hydrolase family protein  31.33 
 
 
295 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1199  Carboxymethylenebutenolidase  31.33 
 
 
214 aa  111  2.0000000000000002e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3313  twin-arginine translocation pathway signal  31.62 
 
 
296 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0241  carboxymethylenebutenolidase  35.42 
 
 
229 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  27.2 
 
 
251 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2055  dienelactone hydrolase  26.4 
 
 
251 aa  109  6e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731615  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1491  carboxymethylenebutenolidase  27.54 
 
 
261 aa  108  8.000000000000001e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0546343  normal  0.398934 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3405  Carboxymethylenebutenolidase  31.6 
 
 
246 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0424  Carboxymethylenebutenolidase  35.37 
 
 
313 aa  106  5e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0290099 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1423  carboxymethylenebutenolidase  32.27 
 
 
250 aa  106  5e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.307098  normal  0.828639 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2210  carboxymethylenebutenolidase family protein  31.67 
 
 
242 aa  105  7e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1865  Carboxymethylenebutenolidase  31.67 
 
 
242 aa  105  7e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.613212  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1445  carboxymethylenebutenolidase  32.79 
 
 
246 aa  105  8e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.80402  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0420  Carboxymethylenebutenolidase  30.47 
 
 
247 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2091  carboxymethylenebutenolidase  31.43 
 
 
303 aa  103  4e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.449099  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0431  dienelactone hydrolase  29.69 
 
 
247 aa  102  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.850934 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3327  carboxymethylenebutenolidase  32.91 
 
 
295 aa  102  6e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2534  carboxymethylenebutenolidase  30 
 
 
295 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.178351  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3733  dienelactone hydrolase  29.48 
 
 
248 aa  100  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000974999  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1016  Carboxymethylenebutenolidase  28.19 
 
 
250 aa  100  4e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.387888 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6635  Carboxymethylenebutenolidase  29.53 
 
 
295 aa  99.8  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.235988 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5769  carboxymethylenebutenolidase  30 
 
 
295 aa  99  9e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2800  Carboxymethylenebutenolidase  27.92 
 
 
257 aa  98.6  1e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.637875  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3286  dienelactone hydrolase family protein  28.87 
 
 
295 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4312  dienelactone hydrolase family protein  28.87 
 
 
295 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4930  Carboxymethylenebutenolidase  30.34 
 
 
227 aa  98.6  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0665407  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>