More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0186 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_0186  Carboxymethylenebutenolidase  100 
 
 
275 aa  561  1.0000000000000001e-159  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3933  Carboxymethylenebutenolidase  81.09 
 
 
275 aa  466  9.999999999999999e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4070  Carboxymethylenebutenolidase  73.45 
 
 
275 aa  429  1e-119  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0243  carboxymethylenebutenolidase  73.36 
 
 
278 aa  426  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4353  Carboxymethylenebutenolidase  72.63 
 
 
275 aa  424  1e-118  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3951  carboxymethylenebutenolidase  69.4 
 
 
290 aa  407  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0265  dienelactone hydrolase family protein  69.4 
 
 
290 aa  407  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3963  carboxymethylenebutenolidase  72.59 
 
 
268 aa  405  1.0000000000000001e-112  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3647  dienelactone hydrolase family protein  69.4 
 
 
290 aa  407  1.0000000000000001e-112  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03717  predicted hydrolase  71.54 
 
 
269 aa  397  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4247  dienelactone hydrolase  72.97 
 
 
291 aa  397  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.750594  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4294  dienelactone hydrolase  72.97 
 
 
291 aa  397  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4175  dienelactone hydrolase  72.97 
 
 
291 aa  397  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4198  dienelactone hydrolase  72.97 
 
 
291 aa  397  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4206  dienelactone hydrolase family protein  72.31 
 
 
269 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000877073 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4149  Carboxymethylenebutenolidase  71.04 
 
 
271 aa  395  1e-109  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03666  hypothetical protein  71.54 
 
 
267 aa  396  1e-109  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4054  dienelactone hydrolase family protein  71.04 
 
 
271 aa  395  1e-109  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4351  dienelactone hydrolase family protein  71.43 
 
 
271 aa  395  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5271  dienelactone hydrolase family protein  71.04 
 
 
271 aa  392  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.198587 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4178  carboxymethylenebutenolidase  71.04 
 
 
271 aa  392  1e-108  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0221316 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4302  dienelactone hydrolase family protein  70.27 
 
 
270 aa  388  1e-107  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2140  Carboxymethylenebutenolidase  61.98 
 
 
291 aa  335  5e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.324009 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1804  carboxymethylenebutenolidase  61.6 
 
 
291 aa  333  2e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.692278  normal  0.911676 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4024  twin-arginine translocation pathway signal  59.54 
 
 
278 aa  332  4e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1756  Carboxymethylenebutenolidase  61.22 
 
 
291 aa  331  7.000000000000001e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5324  carboxymethylenebutenolidase  61.33 
 
 
298 aa  324  1e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3586  carboxymethylenebutenolidase  60.38 
 
 
295 aa  318  6e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2622  twin-arginine translocation pathway signal  60.23 
 
 
291 aa  318  7e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.626056 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3285  Carboxymethylenebutenolidase  59 
 
 
280 aa  316  2e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2042  carboxymethylenebutenolidase  59.32 
 
 
291 aa  315  4e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000295478 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0875  twin-arginine translocation pathway signal  61.75 
 
 
291 aa  314  9.999999999999999e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0999257  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1951  dienelactone hydrolase  59.7 
 
 
291 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0774  Carboxymethylenebutenolidase  61.26 
 
 
300 aa  312  3.9999999999999997e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.12147  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0969  carboxymethylenebutenolidase  57.69 
 
 
275 aa  311  4.999999999999999e-84  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.35084  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3005  carboxymethylenebutenolidase  56.49 
 
 
290 aa  311  5.999999999999999e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0541366  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1943  carboxymethylenebutenolidase  58.33 
 
 
302 aa  311  1e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0524201  normal  0.0241824 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4421  carboxymethylenebutenolidase  55.51 
 
 
290 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.842964  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0181  twin-arginine translocation pathway signal  55.81 
 
 
291 aa  302  5.000000000000001e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.972702  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2668  Carboxymethylenebutenolidase  57.03 
 
 
297 aa  301  6.000000000000001e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.240942  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3316  carboxymethylenebutenolidase  57.03 
 
 
297 aa  301  6.000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0813595  normal  0.0640539 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2832  dienelactone hydrolase  56.06 
 
 
290 aa  301  6.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1548  Carboxymethylenebutenolidase  55.85 
 
 
299 aa  299  3e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2228  putative carboxymethylenebutenolidase (dienelactone hydrolase) protein  55.3 
 
 
293 aa  299  4e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6786  Carboxymethylenebutenolidase  55.3 
 
 
294 aa  298  7e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00592953  hitchhiker  0.00000947309 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0609  carboxymethylenebutenolidase  54.96 
 
 
290 aa  297  1e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2398  carboxymethylenebutenolidase  54.37 
 
 
339 aa  293  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1733  carboxymethylenebutenolidase  53.9 
 
 
307 aa  291  8e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.353507 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2540  carboxymethylenebutenolidase  53.99 
 
 
339 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0848  carboxymethylenebutenolidase  53.99 
 
 
291 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1506  carboxymethylenebutenolidase  53.99 
 
 
291 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.893969  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1700  carboxymethylenebutenolidase  53.99 
 
 
291 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0358  carboxymethylenebutenolidase  53.99 
 
 
291 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1710  carboxymethylenebutenolidase  54.14 
 
 
291 aa  287  1e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3771  carboxymethylenebutenolidase  52.47 
 
 
291 aa  285  4e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0116114 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3245  carboxymethylenebutenolidase  52.47 
 
 
291 aa  284  8e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0210034 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2040  Carboxymethylenebutenolidase  53.23 
 
 
292 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.143956  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2433  Carboxymethylenebutenolidase  53.23 
 
 
292 aa  282  3.0000000000000004e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0324  carboxymethylenebutenolidase  53.91 
 
 
256 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3653  carboxymethylenebutenolidase  50.95 
 
 
291 aa  281  9e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19765  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4825  carboxymethylenebutenolidase  51.33 
 
 
291 aa  281  9e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00463404  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4491  twin-arginine translocation pathway signal  50.95 
 
 
291 aa  281  9e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3874  carboxymethylenebutenolidase  50.95 
 
 
291 aa  281  9e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630972  normal  0.609004 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2216  dienelactone hydrolase  51.35 
 
 
291 aa  275  9e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.60917  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4626  Carboxymethylenebutenolidase  47.37 
 
 
277 aa  267  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000529247 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5221  putative carboxymethylenebutenolidase precursor (dienelactone hydrolase  49.43 
 
 
270 aa  251  1e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0554108  normal  0.200336 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2733  carboxymethylenebutenolidase  48.66 
 
 
290 aa  246  2e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0943  Carboxymethylenebutenolidase  46.92 
 
 
287 aa  238  9e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00110752 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0536  carboxymethylenebutenolidase  39.66 
 
 
239 aa  150  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.192606 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6096  carboxymethylenebutenolidase  41.52 
 
 
238 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0559809 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3405  Carboxymethylenebutenolidase  37.25 
 
 
246 aa  129  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0949  Carboxymethylenebutenolidase  32.93 
 
 
261 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00366545  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3733  dienelactone hydrolase  33.06 
 
 
248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000974999  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1212  Carboxymethylenebutenolidase  32.76 
 
 
248 aa  125  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  33.2 
 
 
251 aa  123  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7870  putative carboxymethylenebutenolidase  38.89 
 
 
223 aa  122  9e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1491  carboxymethylenebutenolidase  29.56 
 
 
261 aa  121  9.999999999999999e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0546343  normal  0.398934 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0431  dienelactone hydrolase  31.17 
 
 
247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.850934 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2806  dienelactone hydrolase family protein  31.74 
 
 
295 aa  120  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0420  Carboxymethylenebutenolidase  31.52 
 
 
247 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0089  carboxymethylenebutenolidase  35.15 
 
 
244 aa  116  3.9999999999999997e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5319  Carboxymethylenebutenolidase  36.86 
 
 
223 aa  115  6e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319881  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0241  carboxymethylenebutenolidase  35.86 
 
 
229 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1445  carboxymethylenebutenolidase  33.48 
 
 
246 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.80402  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2534  carboxymethylenebutenolidase  32.76 
 
 
295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.178351  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4136  carboxymethylenebutenolidase  34.07 
 
 
324 aa  114  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0321  carboxymethylenebutenolidase  35.59 
 
 
229 aa  114  3e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2210  carboxymethylenebutenolidase family protein  35.65 
 
 
242 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2055  dienelactone hydrolase  28.57 
 
 
251 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731615  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0260  carboxymethylenebutenolidase  35.32 
 
 
229 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785902 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0255  Carboxymethylenebutenolidase  35.32 
 
 
229 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.781459  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1865  Carboxymethylenebutenolidase  35.65 
 
 
242 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.613212  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1199  Carboxymethylenebutenolidase  31.73 
 
 
214 aa  112  8.000000000000001e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3312  Carboxymethylenebutenolidase  33.91 
 
 
290 aa  112  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0424  Carboxymethylenebutenolidase  34.75 
 
 
313 aa  111  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0290099 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2805  Carboxymethylenebutenolidase  32.61 
 
 
290 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.103542  normal  0.354876 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4312  dienelactone hydrolase family protein  33.04 
 
 
295 aa  110  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02875  predicted hydrolase  33.04 
 
 
254 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1705  dienelactone hydrolase family protein  33.33 
 
 
230 aa  109  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3915  dienelactone hydrolase family protein  33.33 
 
 
230 aa  109  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.306599  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>