More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2534 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2534  carboxymethylenebutenolidase  100 
 
 		 295 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.178351  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2806  dienelactone hydrolase family protein  94.92 
 
 		 295 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3409  carboxymethylenebutenolidase  77.21 
 
 		 295 aa  478  1e-134  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3286  dienelactone hydrolase family protein  76.53 
 
 		 295 aa  476  1e-133  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3469  dienelactone hydrolase family protein  76.53 
 
 		 295 aa  476  1e-133  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4312  dienelactone hydrolase family protein  75.85 
 
 		 295 aa  472  1e-132  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6635  Carboxymethylenebutenolidase  80.27 
 
 		 295 aa  473  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.235988 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3327  carboxymethylenebutenolidase  78.91 
 
 		 295 aa  472  1e-132  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37970  Dienelactone hydrolase-like protein  77.21 
 
 		 295 aa  467  9.999999999999999e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5691  Carboxymethylenebutenolidase  80.27 
 
 		 295 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.175838  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02875  predicted hydrolase  77.47 
 
 		 254 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0735  carboxymethylenebutenolidase  61.43 
 
 		 296 aa  393  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0400913 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2526  carboxymethylenebutenolidase  57.82 
 
 		 294 aa  370  1e-101  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3354  Carboxymethylenebutenolidase  53.9 
 
 		 295 aa  345  6e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000150508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4562  Carboxymethylenebutenolidase  54.64 
 
 		 297 aa  343  2e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.546274  normal  0.125824 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3313  twin-arginine translocation pathway signal  54.42 
 
 		 296 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1487  Carboxymethylenebutenolidase  52.04 
 
 		 295 aa  335  5.999999999999999e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2724  twin-arginine translocation pathway signal  55.78 
 
 		 299 aa  335  7e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.368309 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3288  carboxymethylenebutenolidase  55.93 
 
 		 307 aa  331  8e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2950  Carboxymethylenebutenolidase  51.36 
 
 		 295 aa  331  1e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4137  carboxymethylenebutenolidase  50 
 
 		 298 aa  325  8.000000000000001e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.597321  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3130  Carboxymethylenebutenolidase  55.1 
 
 		 296 aa  323  2e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05585  hypothetical protein  53.52 
 
 		 305 aa  319  3e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2091  carboxymethylenebutenolidase  52.9 
 
 		 303 aa  319  3.9999999999999996e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.449099  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001605  dienelactone hydrolase family  52.98 
 
 		 305 aa  307  1.0000000000000001e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0207  twin-arginine translocation pathway signal  48.82 
 
 		 296 aa  305  7e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3006  dienelactone hydrolase  50.17 
 
 		 331 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.146307  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3286  dienelactone hydrolase  50.82 
 
 		 320 aa  302  5.000000000000001e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1006  dienelactone hydrolase family protein  51.33 
 
 		 320 aa  301  7.000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0833  twin-arginine translocation pathway signal  50.49 
 
 		 320 aa  299  4e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.704656 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1000  dienelactone hydrolase  49.83 
 
 		 326 aa  296  2e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0965  dienelactone hydrolase  49.83 
 
 		 326 aa  296  4e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3190  twin-arginine translocation pathway signal  50.5 
 
 		 320 aa  295  6e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0985  dienelactone hydrolase  49.16 
 
 		 326 aa  294  1e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3378  dienelactone hydrolase  48.83 
 
 		 326 aa  291  9e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2322  carboxymethylenebutenolidase  53.45 
 
 		 310 aa  272  4.0000000000000004e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1987  twin-arginine translocation pathway signal  47.02 
 
 		 291 aa  253  3e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0381  carboxymethylenebutenolidase  46.29 
 
 		 291 aa  246  2e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5769  carboxymethylenebutenolidase  43.46 
 
 		 295 aa  229  3e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3428  carboxymethylenebutenolidase  76.26 
 
 		 145 aa  223  2e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0846  carboxymethylenebutenolidase  42.76 
 
 		 293 aa  218  7.999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.269647  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02824  hypothetical protein  73.33 
 
 		 136 aa  217  2e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02825  hypothetical protein  82.61 
 
 		 116 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4136  carboxymethylenebutenolidase  38.99 
 
 		 324 aa  178  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0424  Carboxymethylenebutenolidase  43.97 
 
 		 313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0290099 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3311  dienelactone hydrolase  35.67 
 
 		 305 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.162342 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0298  Carboxymethylenebutenolidase  39.48 
 
 		 227 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4353  Carboxymethylenebutenolidase  33.89 
 
 		 275 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2794  dienelactone hydrolase  36.15 
 
 		 303 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.487627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2750  dienelactone hydrolase  36.15 
 
 		 303 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0604874  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2780  carboxymethylenebutenolidase  35.81 
 
 		 322 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3034  dienelactone hydrolase  33.23 
 
 		 318 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.821147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0243  carboxymethylenebutenolidase  32.76 
 
 		 278 aa  126  5e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2600  Carboxymethylenebutenolidase  38.89 
 
 		 264 aa  125  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4070  Carboxymethylenebutenolidase  33.33 
 
 		 275 aa  124  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3951  carboxymethylenebutenolidase  32.33 
 
 		 290 aa  124  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0265  dienelactone hydrolase family protein  32.33 
 
 		 290 aa  124  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5221  putative carboxymethylenebutenolidase precursor (dienelactone hydrolase  38.6 
 
 		 270 aa  123  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0554108  normal  0.200336 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3933  Carboxymethylenebutenolidase  33.48 
 
 		 275 aa  122  7e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5324  carboxymethylenebutenolidase  39.48 
 
 		 298 aa  122  7e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0186  Carboxymethylenebutenolidase  32.61 
 
 		 275 aa  122  8e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3647  dienelactone hydrolase family protein  31.9 
 
 		 290 aa  122  8e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1710  carboxymethylenebutenolidase  32.64 
 
 		 291 aa  120  3e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2805  Carboxymethylenebutenolidase  33.76 
 
 		 290 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.103542  normal  0.354876 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2228  putative carboxymethylenebutenolidase (dienelactone hydrolase) protein  32.87 
 
 		 293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6385  carboxymethylenebutenolidase  35.95 
 
 		 234 aa  117  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2579  Carboxymethylenebutenolidase  31.58 
 
 		 273 aa  116  3.9999999999999997e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.315807  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3245  carboxymethylenebutenolidase  29.97 
 
 		 291 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0210034 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5271  dienelactone hydrolase family protein  32.4 
 
 		 271 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.198587 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4178  carboxymethylenebutenolidase  32.4 
 
 		 271 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0221316 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2216  dienelactone hydrolase  32.19 
 
 		 291 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.60917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3312  Carboxymethylenebutenolidase  33.33 
 
 		 290 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3653  carboxymethylenebutenolidase  30.48 
 
 		 291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0181  twin-arginine translocation pathway signal  32.23 
 
 		 291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.972702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1783  Carboxymethylenebutenolidase  39.06 
 
 		 227 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0391  Carboxymethylenebutenolidase  37.78 
 
 		 232 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3285  Carboxymethylenebutenolidase  31.6 
 
 		 280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4491  twin-arginine translocation pathway signal  30.48 
 
 		 291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3874  carboxymethylenebutenolidase  30.48 
 
 		 291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630972  normal  0.609004 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4117  Carboxymethylenebutenolidase  35.62 
 
 		 238 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.63682  normal  0.0814825 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4229  Carboxymethylenebutenolidase  35.62 
 
 		 238 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.17029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4330  carboxymethylenebutenolidase  38.22 
 
 		 232 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4825  carboxymethylenebutenolidase  30.48 
 
 		 291 aa  112  5e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00463404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1898  Carboxymethylenebutenolidase  33.94 
 
 		 292 aa  113  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.668e-17 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6786  Carboxymethylenebutenolidase  31.06 
 
 		 294 aa  112  6e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00592953  hitchhiker  0.00000947309 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1285  carboxymethylenebutenolidase  32.31 
 
 		 263 aa  112  6e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2140  Carboxymethylenebutenolidase  32.49 
 
 		 291 aa  112  6e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.324009 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03717  predicted hydrolase  32.14 
 
 		 269 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4206  dienelactone hydrolase family protein  32.14 
 
 		 269 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000877073 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1943  carboxymethylenebutenolidase  36.52 
 
 		 302 aa  112  8.000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0524201  normal  0.0241824 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2303  putative carboxymethylenebutenolidase  37.17 
 
 		 224 aa  112  8.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03666  hypothetical protein  32.14 
 
 		 267 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3963  carboxymethylenebutenolidase  32.14 
 
 		 268 aa  112  8.000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4351  dienelactone hydrolase family protein  32 
 
 		 271 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4149  Carboxymethylenebutenolidase  31.6 
 
 		 271 aa  112  9e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4054  dienelactone hydrolase family protein  31.6 
 
 		 271 aa  112  9e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1804  carboxymethylenebutenolidase  33.33 
 
 		 291 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.692278  normal  0.911676 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4121  Carboxymethylenebutenolidase  34.33 
 
 		 235 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1491  carboxymethylenebutenolidase  31.15 
 
 		 261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0546343  normal  0.398934 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1386  Carboxymethylenebutenolidase  35.84 
 
 		 224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.670188  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>