More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0381 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0381  carboxymethylenebutenolidase  100 
 
 		 291 aa  588  1e-167  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1987  twin-arginine translocation pathway signal  70.1 
 
 		 291 aa  400  9.999999999999999e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5769  carboxymethylenebutenolidase  69.79 
 
 		 295 aa  397  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3354  Carboxymethylenebutenolidase  48.63 
 
 		 295 aa  287  1e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000150508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3313  twin-arginine translocation pathway signal  47.02 
 
 		 296 aa  278  1e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2724  twin-arginine translocation pathway signal  49.12 
 
 		 299 aa  276  2e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.368309 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0846  carboxymethylenebutenolidase  52.65 
 
 		 293 aa  275  5e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.269647  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1487  Carboxymethylenebutenolidase  48.12 
 
 		 295 aa  274  1.0000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4137  carboxymethylenebutenolidase  45.89 
 
 		 298 aa  273  3e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.597321  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3130  Carboxymethylenebutenolidase  51.43 
 
 		 296 aa  270  2e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4562  Carboxymethylenebutenolidase  46.42 
 
 		 297 aa  268  8.999999999999999e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.546274  normal  0.125824 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3409  carboxymethylenebutenolidase  47.92 
 
 		 295 aa  264  2e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2091  carboxymethylenebutenolidase  47.2 
 
 		 303 aa  264  2e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.449099  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3469  dienelactone hydrolase family protein  47.57 
 
 		 295 aa  263  3e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3286  dienelactone hydrolase family protein  47.57 
 
 		 295 aa  263  3e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0735  carboxymethylenebutenolidase  46.13 
 
 		 296 aa  261  8e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0400913 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4312  dienelactone hydrolase family protein  46.88 
 
 		 295 aa  259  3e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2950  Carboxymethylenebutenolidase  44.86 
 
 		 295 aa  258  6e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2806  dienelactone hydrolase family protein  45.58 
 
 		 295 aa  250  2e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6635  Carboxymethylenebutenolidase  48.61 
 
 		 295 aa  249  4e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.235988 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3327  carboxymethylenebutenolidase  47.55 
 
 		 295 aa  248  8e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3288  carboxymethylenebutenolidase  46.21 
 
 		 307 aa  246  4e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02875  predicted hydrolase  50.2 
 
 		 254 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2534  carboxymethylenebutenolidase  46.29 
 
 		 295 aa  240  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.178351  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05585  hypothetical protein  43.6 
 
 		 305 aa  237  1e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001605  dienelactone hydrolase family  44.14 
 
 		 305 aa  234  1.0000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0207  twin-arginine translocation pathway signal  41.67 
 
 		 296 aa  232  6e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0965  dienelactone hydrolase  40.92 
 
 		 326 aa  230  2e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3006  dienelactone hydrolase  41.64 
 
 		 331 aa  230  2e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.146307  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3378  dienelactone hydrolase  40.26 
 
 		 326 aa  229  6e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0985  dienelactone hydrolase  40.26 
 
 		 326 aa  228  6e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1000  dienelactone hydrolase  40.59 
 
 		 326 aa  228  7e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5691  Carboxymethylenebutenolidase  47.57 
 
 		 295 aa  228  8e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.175838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3286  dienelactone hydrolase  40.59 
 
 		 320 aa  226  3e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1006  dienelactone hydrolase family protein  40.59 
 
 		 320 aa  225  6e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2526  carboxymethylenebutenolidase  43.11 
 
 		 294 aa  225  8e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0833  twin-arginine translocation pathway signal  40.26 
 
 		 320 aa  223  4e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.704656 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37970  Dienelactone hydrolase-like protein  45.42 
 
 		 295 aa  222  7e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3190  twin-arginine translocation pathway signal  39.93 
 
 		 320 aa  219  3e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2322  carboxymethylenebutenolidase  45.71 
 
 		 310 aa  216  2.9999999999999998e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4136  carboxymethylenebutenolidase  41.53 
 
 		 324 aa  165  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0424  Carboxymethylenebutenolidase  38.46 
 
 		 313 aa  159  6e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0290099 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0298  Carboxymethylenebutenolidase  40.17 
 
 		 227 aa  155  6e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2600  Carboxymethylenebutenolidase  35.83 
 
 		 264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02824  hypothetical protein  48.12 
 
 		 136 aa  129  8.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3311  dienelactone hydrolase  39.06 
 
 		 305 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.162342 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4121  Carboxymethylenebutenolidase  36.17 
 
 		 235 aa  126  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4178  carboxymethylenebutenolidase  33.46 
 
 		 271 aa  124  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0221316 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5271  dienelactone hydrolase family protein  33.07 
 
 		 271 aa  122  6e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.198587 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2579  Carboxymethylenebutenolidase  34.11 
 
 		 273 aa  121  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.315807  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4351  dienelactone hydrolase family protein  33.07 
 
 		 271 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4378  carboxymethylenebutenolidase  36.17 
 
 		 230 aa  121  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.112691 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3285  Carboxymethylenebutenolidase  31.1 
 
 		 280 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02825  hypothetical protein  55.26 
 
 		 116 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4149  Carboxymethylenebutenolidase  32.68 
 
 		 271 aa  120  3e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3428  carboxymethylenebutenolidase  48.46 
 
 		 145 aa  120  3e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03666  hypothetical protein  32.81 
 
 		 267 aa  120  3e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4054  dienelactone hydrolase family protein  32.68 
 
 		 271 aa  120  3e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03717  predicted hydrolase  32.81 
 
 		 269 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1783  Carboxymethylenebutenolidase  36.68 
 
 		 227 aa  119  4.9999999999999996e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4206  dienelactone hydrolase family protein  32.81 
 
 		 269 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000877073 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00900  dienelactone hydrolase-like enzyme  38 
 
 		 241 aa  118  9.999999999999999e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1304  carboxymethylenebutenolidase  37.28 
 
 		 224 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0181  twin-arginine translocation pathway signal  33.45 
 
 		 291 aa  117  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.972702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2042  carboxymethylenebutenolidase  33.59 
 
 		 291 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000295478 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4247  dienelactone hydrolase  31.85 
 
 		 291 aa  115  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.750594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4175  dienelactone hydrolase  31.85 
 
 		 291 aa  115  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4198  dienelactone hydrolase  31.85 
 
 		 291 aa  115  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1386  Carboxymethylenebutenolidase  35.81 
 
 		 224 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.670188  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4294  dienelactone hydrolase  31.85 
 
 		 291 aa  115  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0243  carboxymethylenebutenolidase  33.88 
 
 		 278 aa  115  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4302  dienelactone hydrolase family protein  32.28 
 
 		 270 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3647  dienelactone hydrolase family protein  30.86 
 
 		 290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3963  carboxymethylenebutenolidase  31.5 
 
 		 268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1804  carboxymethylenebutenolidase  31.27 
 
 		 291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.692278  normal  0.911676 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2805  Carboxymethylenebutenolidase  32.81 
 
 		 290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.103542  normal  0.354876 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0265  dienelactone hydrolase family protein  30.47 
 
 		 290 aa  113  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3951  carboxymethylenebutenolidase  30.47 
 
 		 290 aa  113  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1266  carboxymethylenebutenolidase  36.71 
 
 		 231 aa  113  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3312  Carboxymethylenebutenolidase  32.81 
 
 		 290 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0548  carboxymethylenebutenolidase  34.04 
 
 		 235 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.833541 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2787  carboxymethylenebutenolidase  33.19 
 
 		 254 aa  113  4.0000000000000004e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4061  carboxymethylenebutenolidase  33.62 
 
 		 236 aa  112  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.86952  normal  0.797437 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2831  carboxymethylenebutenolidase  37.34 
 
 		 230 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0276  carboxymethylenebutenolidase  37.34 
 
 		 230 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2800  Carboxymethylenebutenolidase  31.78 
 
 		 257 aa  112  6e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.637875  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3231  dienelactone hydrolase  36.24 
 
 		 228 aa  112  6e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.891917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5221  putative carboxymethylenebutenolidase precursor (dienelactone hydrolase  33.58 
 
 		 270 aa  112  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0554108  normal  0.200336 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5380  Carboxymethylenebutenolidase  35.65 
 
 		 420 aa  112  6e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204007  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1202  carboxymethylenebutenolidase  35.53 
 
 		 224 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3034  dienelactone hydrolase  41.38 
 
 		 318 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.821147  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4229  Carboxymethylenebutenolidase  33.9 
 
 		 238 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.17029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4117  Carboxymethylenebutenolidase  33.9 
 
 		 238 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.63682  normal  0.0814825 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0841  dienelactone hydrolase  34.63 
 
 		 228 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.540975  normal  0.335069 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0391  Carboxymethylenebutenolidase  36.21 
 
 		 232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3379  carboxymethylenebutenolidase  37.07 
 
 		 230 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0969  carboxymethylenebutenolidase  30.71 
 
 		 275 aa  110  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.35084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4330  carboxymethylenebutenolidase  36.21 
 
 		 232 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3842  Carboxymethylenebutenolidase  34.38 
 
 		 276 aa  110  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2140  Carboxymethylenebutenolidase  31.34 
 
 		 291 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.324009 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>